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C57BL/6JCya-4933434E20Rikem1flox/Cya 条件性基因敲除小鼠
产品名称:
4933434E20Rik-flox
产品编号:
S-CKO-17379
品系背景:
C57BL/6JCya
小鼠资源库
* 使用本品系发表的文献需注明:4933434E20Rik-flox mice (Strain S-CKO-17379) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-4933434E20Rikem1flox/Cya
品系编号
CKOCMP-99650-4933434E20Rik-B6J-VA
产品编号
S-CKO-17379
基因名
4933434E20Rik
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
5730552F22Rik; NICE-3; NS5ATP4
NCBI号
修饰方式
条件性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
活体
环境标准
SPF
供应地区
全球范围
品系详情
4933434E20Rik位于小鼠的3号染色体,采用基因编辑技术,通过高通量电转受精卵方式,获得4933434E20Rik基因条件性敲除小鼠,性成熟后取精子冻存。
4933434E20Rik-flox小鼠模型是由赛业生物(Cyagen)利用基因编辑技术构建的条件性敲除小鼠。该模型中的4933434E20Rik基因位于小鼠的3号染色体上,由7个外显子组成,其中ATG起始密码子位于1号外显子,TGA终止密码子位于7号外显子。条件性敲除区域(cKO区域)位于3至4号外显子之间,包含172个碱基对的编码序列。删除该区域会导致小鼠4933434E20Rik基因功能的丧失。 4933434E20Rik-flox小鼠模型的构建过程包括将核糖核蛋白(RNP)和靶向载体共同注入受精卵。随后,对出生的小鼠进行PCR和测序分析进行基因型鉴定。该模型可用于研究4933434E20Rik基因在小鼠体内的功能,特别是在基因转录、RNA剪接和蛋白质翻译方面的作用。
基因研究概述
基因4933434E20Rik,又称为Rik ENSMUSG00000049334,是一个在哺乳动物基因组中发现的基因。尽管该基因的具体功能尚未完全明了,但是它可能参与了基因调控网络,并可能对发育过程有所影响。基因4933434E20Rik位于小鼠基因组中,并且可能具有类似于其他已知基因的功能。例如,一些研究已经发现基因重复和基因丢失在动物基因组的进化中是频繁发生的事件,这种动态过程导致了不同物种间基因数量的显著差异[1]。
基因重复是生物进化中的一个重要现象,它可以为新功能的产生提供基础。在基因重复之后,两个副本通常会以大致相同的速率积累序列变化。然而,在某些情况下,序列变化的积累会非常不平衡,一个副本会与它的同源基因发生显著的分化。这种“不对称进化”现象在串联基因重复后比在基因组整体复制后更为常见,并且可以产生具有全新功能的基因。例如,在鳞翅目、软体动物和哺乳动物的重复同源异型基因中,已经观察到不对称进化的例子,这些基因被招募到新的发育角色中[1]。
在人类疾病研究中,已经发现了一些与乳腺癌相关的基因,如BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53。除了这些高外显率的基因外,还有许多中等外显率和低外显率的基因与乳腺癌的风险相关。随着下一代测序技术的发展,预计所有家族性乳腺癌基因都将被纳入遗传测试中[2]。
基因工程和合成生物学是研究基因功能和基因调控网络的另一个重要领域。基因电路的概念被引入,它提供了一个框架来预测和评估细胞过程的动态。通过设计和实施合成基因网络,可以更好地理解基因和蛋白质之间的相互作用,并可能开发新的细胞控制逻辑形式,这对于功能基因组学、纳米技术和基因治疗具有重要意义[3]。
在基因功能研究中,基因敲除是一种常用的方法。然而,对于一些基因来说,敲除会导致细胞死亡,这些基因被称为必需基因。必需基因的功能可以通过基因间的相互作用来绕过,这种现象被称为“绕过必需性”。研究发现,在裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中,几乎30%的必需基因可以通过这种相互作用来绕过其必需性[4]。
基因调控网络是细胞内基因表达调控的复杂系统。它涉及各种转录因子、表观遗传修饰和信号通路,共同决定基因的表达模式和细胞的功能。了解基因调控网络对于研究发育、疾病和细胞功能至关重要[5]。
植物Cis作用元件数据库PlantCARE是一个关于植物顺式作用元件、增强子和抑制子的数据库。它提供了这些元件在特定启动子序列上的位置矩阵、保守序列和个体位点的信息。这个数据库对于研究植物基因表达调控和开发相关工具非常有用[6]。
基因片段的研究对于理解基因结构和功能也具有重要意义。基因片段可以是基因的一部分,它们可能参与基因表达调控或编码蛋白质的功能域。研究基因片段有助于揭示基因的功能和进化[7]。
植物中的抗病基因依赖于植物的抗病反应。这些基因编码的蛋白质可以识别病原体相关的分子模式,并激活植物的抗病机制。研究植物抗病基因有助于开发新的抗病策略,提高农作物的产量和质量[8]。
MHC基因的表达受到多种转录因子的调控。这些转录因子与MHC基因启动子相互作用,影响MHC基因的表达水平和MHC蛋白的功能。研究MHC基因表达的调控对于理解免疫系统和疾病的发生机制具有重要意义[9]。
基因的定义是生物学中的一个基本概念。随着对基因结构和功能的深入研究,基因的定义也在不断演变。基因是DNA序列的一部分,它编码蛋白质或RNA分子,并参与基因表达和细胞功能的调控[10]。
综上所述,基因4933434E20Rik是一个在哺乳动物基因组中发现的基因,可能参与了基因调控网络和发育过程。基因重复、基因敲除、基因工程、基因调控网络和植物抗病基因等研究对于深入理解基因功能和基因表达调控具有重要意义。未来,随着生物信息学和高通量测序技术的发展,我们有望进一步揭示基因4933434E20Rik的功能和它在生物进化中的作用。
参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/
5. Davidson, Eric, Levin, Michael. 2005. Gene regulatory networks. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 102, 4935. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15809445/
6. Lescot, Magali, Déhais, Patrice, Thijs, Gert, Rouzé, Pierre, Rombauts, Stephane. . PlantCARE, a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences. In Nucleic acids research, 30, 325-7. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11752327/
7. Mateles, R I. . Gene fragments. In Bio/technology (Nature Publishing Company), 10, 456. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/1368495/
8. Hammond-Kosack, K E, Jones, J D. . Resistance gene-dependent plant defense responses. In The Plant cell, 8, 1773-91. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8914325/
9. Ting, J P, Baldwin, A S. . Regulation of MHC gene expression. In Current opinion in immunology, 5, 8-16. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8452678/
10. Epp, C D. . Definition of a gene. In Nature, 389, 537. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9335484/