基因4921536K21Rik,也称为K21Rik,是一种在哺乳动物基因组中发现的新基因。这个基因的名称来源于小鼠基因组的基因标识系统,其中“K”代表基因在染色体上的位置,“21”代表染色体号,“Rik”代表该基因是“基因捕获”(Retired Gene Identification by Knockout)项目的产物。K21Rik基因的具体功能目前尚未完全明确,但是基于基因序列和表达模式的研究,可以推测其在细胞生物学过程中可能扮演重要角色。
基因复制和基因丢失是动物基因组进化过程中的常见事件。基因复制后,两个副本通常会以大致相同的速率积累序列变化。然而,在某些情况下,序列变化的积累可能非常不平衡,其中一个副本会与其同源基因显著不同。这种现象称为“非对称进化”,在串联基因复制后比全基因组复制后更为常见,可以产生具有显著新颖性的基因。非对称进化在许多物种的基因进化中发挥着重要作用,例如在蛾、软体动物和哺乳动物的重复同源基因中,每个案例都产生了新的同源基因,并被招募到新的发育功能中[1]。
乳腺癌是一种异质性很强的疾病,大部分病例(约70%)被认为是偶发的。家族性乳腺癌(约30%的病人),通常出现在乳腺癌发病率高的家族中,与多种高、中、低外显率的易感基因相关。家族连锁研究已经确定了高外显率基因BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53,它们是遗传性综合征的责任基因。此外,基于家族和人群的方法表明,参与DNA修复的基因,如CHEK2、ATM、BRIP1(FANCJ)、PALB2(FANCN)和RAD51C(FANCO),与中等的乳腺癌风险相关。全基因组关联研究(GWAS)在乳腺癌中发现了一些常见的低外显率等位基因,这些等位基因与乳腺癌的风险略有增加或减少相关。目前,仅在临床实践中广泛应用高外显率基因。由于下一代测序技术的发展,预计所有家族性乳腺癌基因都将纳入遗传检测。然而,在将多基因面板检测完全整合到临床工作流程之前,还需要对中度和低风险变异的临床管理进行更多研究[2]。
工程化基因回路是后基因组时代研究的一个重要焦点。细胞现象如何从基因和蛋白质的连接中产生,这个问题是研究基因回路的关键。这种连接产生了分子网络图,类似于复杂的电路图,需要开发一个数学框架来描述这种电路。从工程学的角度来看,通往这一框架的自然途径是构建和分析构成网络的底层模块。近年来,在测序和基因工程方面的实验进展使得这一方法成为可能,通过设计和实施适用于数学建模和定量分析的合成基因网络。这些进展标志着基因回路学科的兴起,它为预测和评估细胞过程的动态提供了一个框架。合成基因网络还将导致新的细胞控制逻辑形式,这可能对功能基因组学、纳米技术和基因和细胞治疗具有重要意义[3]。
了解基因型-表型关系是生物学中的核心目标。基因敲除产生完全失去功能的基因型,是探索基因功能的一种常用方法。基因敲除最严重的表型后果是致死性。具有致死性敲除表型的基因称为必需基因。基于酵母的全基因组敲除分析,基因组中约四分之一的基因可以是必需的。与其他基因型-表型关系一样,基因必需性受到背景效应的影响,并可能因基因-基因相互作用而变化。特别是,对于某些必需基因,由敲除引起的致死性可以通过外基因抑制因子得到拯救。这种“必需性绕过”(BOE)的基因-基因相互作用是一种被低估的遗传抑制类型。最近的一项系统分析显示,令人惊讶的是,裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中近30%的必需基因的必需性可以通过BOE相互作用绕过。本文回顾了揭示和理解必需性绕过的历史和最新进展[4]。
基因4921536K21Rik的研究为理解基因进化、基因功能以及基因与疾病之间的关系提供了新的视角。这个基因可能参与了细胞内复杂的分子网络,并通过非对称进化机制在细胞功能中发挥着重要作用。未来,随着基因编辑和功能基因组学技术的进步,我们可以期待更深入地了解基因4921536K21Rik的功能和其在生物学过程中的作用,以及它与其他基因的相互作用。这样的研究不仅有助于我们理解基因组的进化历史,还可以为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
总结来说,基因4921536K21Rik是一个新发现的基因,其功能和在生物学过程中的作用尚未完全明确。通过研究基因复制、非对称进化、基因功能、基因型-表型关系以及基因回路等生物学现象,我们可以更好地理解基因4921536K21Rik的可能功能和其与疾病的关系。随着生物信息学和基因编辑技术的进步,我们可以期待对这个基因的更深入研究,以揭示其在细胞生物学和疾病发生中的重要作用[1,2,3,4]。
参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/