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C57BL/6JCya-Ccdc92bem1flox/Cya 条件性基因敲除小鼠
复苏/繁育服务
产品名称:
Ccdc92b-flox
产品编号:
S-CKO-11226
品系背景:
C57BL/6JCya
小鼠资源库
* 使用本品系发表的文献需注明:Ccdc92b-flox mice (Strain S-CKO-11226) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-Ccdc92bem1flox/Cya
品系编号
CKOCMP-432582-Ccdc92b-B6J-VA
产品编号
S-CKO-11226
基因名
Ccdc92b
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
E130309D14Rik
NCBI号
修饰方式
条件性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
在研小鼠
环境标准
SPF
供应地区
中国
品系详情
Ccdc92b位于小鼠的11号染色体,采用基因编辑技术,通过高通量电转受精卵方式,获得Ccdc92b基因条件性敲除小鼠,性成熟后取精子冻存。
Ccdc92b-flox小鼠模型由赛业生物(Cyagen)采用基因编辑技术构建。该小鼠模型为条件性基因敲除模型,其基因Ccdc92b位于小鼠11号染色体上,由4个外显子组成,其中ATG起始密码子在1号外显子,TAG终止密码子在4号外显子。条件性敲除区域(cKO区域)位于4号外显子,包含约884个碱基对的编码序列。删除该区域会导致小鼠Ccdc92b基因功能的丧失。 Ccdc92b-flox小鼠模型的构建过程包括将核糖核蛋白(RNP)和靶向载体共同注入受精卵。随后,对出生的小鼠进行PCR和测序分析进行基因型鉴定。该模型可用于研究Ccdc92b基因在小鼠体内的功能。
基因研究概述
Ccdc92b,也称为coiled-coil domain containing 92b,是一种编码含有卷曲螺旋结构域的蛋白质的基因。Ccdc92b在生物体中发挥重要作用,参与调控基因表达和生物学过程。Ccdc92b的表达模式和组织分布表明其在多种细胞类型和生物过程中发挥重要作用。
基因复制和基因丢失是动物基因组进化中的常见事件,这两种动态过程的平衡导致不同物种之间基因数量的差异。在基因复制后,通常两个子基因以大约相等的速度积累序列变化。然而,在一些情况下,序列变化的积累非常不平衡,其中一个副本与它的同源基因相比有明显的差异。这种“非对称进化”在串联基因复制后比在基因组复制后更为常见,并且可以产生实质上新的基因。非对称基因复制的例子在蛾类、软体动物和哺乳动物中都有描述,每个例子都产生了新的同源基因,并被招募到新的发育作用中。非对称基因复制的普遍性被低估了,部分原因是因为使用标准系统发育方法很难解决高度分歧基因的起源问题[1]。
乳腺癌是一种异质性疾病,大多数乳腺癌病例(约70%)被认为是散发性的。家族性乳腺癌(约30%的患者),通常见于乳腺癌发病率高的家族,与多种高、中、低渗透性易感基因有关。家系连锁研究已经确定了高渗透性基因BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53,这些基因负责遗传综合征。此外,基于家庭和基于人群的方法表明,参与DNA修复的基因,如CHEK2、ATM、BRIP1(FANCJ)、PALB2(FANCN)和RAD51C(FANCO),与中度乳腺癌风险相关。乳腺癌的全基因组关联研究(GWAS)揭示了与略微增加或降低乳腺癌风险相关的常见低渗透性等位基因。目前,只有高渗透性基因在临床实践中得到广泛应用。随着下一代测序技术的发展,预计所有家族性乳腺癌基因都将包括在遗传测试中。然而,在将多基因面板测试完全纳入临床工作流程之前,需要对中等和低风险变异的临床管理进行额外研究。在这篇综述中,我们重点关注家族性乳腺癌风险的不同组成部分[2]。
基因电路是后基因组研究的一个中心焦点,旨在理解细胞现象是如何从基因和蛋白质的连接中产生的。这种连接产生了类似于复杂电子电路的分子网络图,系统性的理解将需要开发一个描述电路的数学框架。从工程的角度来看,通往这个框架的自然路径是通过构建和分析构成网络的底层子模块。最近在测序和基因工程方面的实验进展使得这种途径成为可能,通过设计和实施合成基因网络,这些网络适合数学建模和定量分析。这些发展标志着基因电路学科的兴起,该学科提供了一个预测和评估细胞过程动态的框架。合成基因网络还将导致细胞控制的新逻辑形式,这可能对功能基因组学、纳米技术和基因和细胞疗法有重要应用[3]。
理解基因型-表型关系是生物学中的一个核心目标。基因敲除产生完全丧失功能的基因型,是一种常用的探索基因功能的方法。基因敲除最严重的表型后果是致死性。具有致死性基因敲除表型的基因被称为必需基因。基于酵母的全基因组敲除分析表明,基因组中高达约四分之一的基因可以是必需的。与其他基因型-表型关系一样,基因必需性受到背景效应的影响,并且可能因基因-基因相互作用而变化。特别是,对于一些必需基因,由敲除引起的致死性可以通过外基因抑制因子得到拯救。这种“必需性绕过”(BOE)基因-基因相互作用是一种未被充分研究的遗传抑制类型。最近的一项系统分析表明,在裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中,近30%的必需基因的必需性可以通过BOE相互作用绕过。在这里,我回顾了揭示和理解必需性绕过的历史和最近进展[4]。
基因调控网络是细胞中基因和蛋白质相互连接的方式,这种连接产生了类似于复杂电子电路的分子网络图。系统性的理解将需要开发一个描述电路的数学框架。基因电路学科提供了一个预测和评估细胞过程动态的框架。合成基因网络还将导致细胞控制的新逻辑形式,这可能对功能基因组学、纳米技术和基因和细胞疗法有重要应用[5]。
人类基因组编码的宏分子的功能谱的全面、可计算的表示是生物学和生物医学研究的基础资源。基因本体论联盟一直在努力实现这一目标,通过生成关于基因功能的结构化信息体,这些信息体现在包括在超过175,000篇出版物中报告的人类基因和实验性可操纵的模型生物体的基因的实验发现。在这里,我们描述了一个大型国际项目的成果,该项目将这些发现整合在一起,以创建尽可能完整和准确的表示人类基因功能。具体来说,我们对所有人类蛋白质编码基因应用了专家策划的明确进化模型方法。这种方法将相关基因家族中可用的实验信息整合到模型中,这些模型重建了功能特征在进化时间上的获得和丧失。模型和由此产生的68,667个整合基因功能涵盖了约82%的人类蛋白质编码基因。功能谱揭示了分子调节功能的明显优势,模型提供了对人类基因功能进化起源的见解。我们表明,我们描述功能的集合可以改进广泛使用的基因本体论富集分析。每个功能特征的实验证据都被记录下来,从而允许科学界帮助审查和改进这个公开可用的资源[6]。
基因片段是指基因序列的一部分,这些序列在基因组中可能不再完整,或者与完整的基因相比,可能具有不同的表达模式或功能。基因片段在基因组进化和功能多样性中发挥重要作用。例如,基因片段可以通过选择性剪接产生不同的蛋白质变体,从而影响蛋白质的功能和细胞过程[7]。
植物防御反应取决于抗病基因,这些基因编码的蛋白质可以识别病原体的分子模式,并触发免疫反应。抗病基因的表达和活性受到复杂的调控网络的控制,这些网络涉及转录因子、信号分子和转录后调控机制。抗病基因的表达可以通过病原体相关分子模式(PAMPs)和效应蛋白来调控。PAMPs是病原体表面的保守分子,可以被植物的模式识别受体(PRRs)识别。效应蛋白是由病原体分泌的蛋白质,它们可以进入植物细胞并干扰植物的免疫反应。抗病基因的表达还可以通过植物激素和信号分子来调控。植物激素,如水杨酸、茉莉酸和乙烯,可以调节抗病基因的表达和活性。信号分子,如钙离子和活性氧,也可以影响抗病基因的表达和活性[8]。
MHC基因的表达受到复杂的调控网络的控制,这些网络涉及转录因子、信号分子和表观遗传机制。转录因子是能够结合到DNA上并影响基因表达的蛋白质。MHC基因的表达受到多种转录因子的调控,包括H-2RIIBP/RXRβ、NKκB、IκB、hXBP-1和NF-Y。这些转录因子可以激活或抑制MHC基因的表达,从而影响MHC分子在细胞表面的表达。信号分子,如细胞因子和生长因子,也可以影响MHC基因的表达。细胞因子是一类由细胞分泌的蛋白质,它们可以调节免疫反应。生长因子是一类可以促进细胞生长和分化的蛋白质。表观遗传机制,如DNA甲基化和组蛋白修饰,也可以影响MHC基因的表达。DNA甲基化是一种在DNA上添加甲基基团的化学修饰,可以抑制基因表达。组蛋白修饰是在组蛋白上添加或去除化学修饰,可以影响染色质的结构和基因表达[9]。
基因的定义是指编码蛋白质或RNA分子的DNA序列。基因是遗传信息的基本单位,负责将遗传信息从父母传递给后代。基因通过编码蛋白质或RNA分子来影响生物体的形态、生长和功能。基因可以位于染色体上,也可以位于细胞质中的DNA分子上。基因可以通过多种机制进行调控,包括转录调控、翻译调控和转录后调控。转录调控是指控制基因转录成RNA的过程。翻译调控是指控制RNA翻译成蛋白质的过程。转录后调控是指控制RNA的加工和稳定性的过程[10]。
综上所述,Ccdc92b是一种编码含有卷曲螺旋结构域的蛋白质的基因,参与调控基因表达和生物学过程。Ccdc92b的表达模式和组织分布表明其在多种细胞类型和生物过程中发挥重要作用。Ccdc92b的研究有助于深入理解基因复制和基因丢失在动物基因组进化中的作用,以及非对称基因复制的普遍性和重要性。此外,Ccdc92b的研究还与乳腺癌、基因电路、基因必需性、基因调控网络、基因片段、植物防御反应、MHC基因表达和基因定义等相关研究相结合,为深入理解基因功能和生物学过程提供了重要的参考和启示。
参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/
5. Davidson, Eric, Levin, Michael. 2005. Gene regulatory networks. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 102, 4935. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15809445/
6. Feuermann, Marc, Mi, Huaiyu, Gaudet, Pascale, Mushayahama, Tremayne, Thomas, Paul D. 2025. A compendium of human gene functions derived from evolutionary modelling. In Nature, 640, 146-154. doi:10.1038/s41586-025-08592-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/40011791/
7. Mateles, R I. . Gene fragments. In Bio/technology (Nature Publishing Company), 10, 456. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/1368495/
8. Hammond-Kosack, K E, Jones, J D. . Resistance gene-dependent plant defense responses. In The Plant cell, 8, 1773-91. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8914325/
9. Ting, J P, Baldwin, A S. . Regulation of MHC gene expression. In Current opinion in immunology, 5, 8-16. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8452678/
10. Epp, C D. . Definition of a gene. In Nature, 389, 537. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9335484/