Pttg1ip2,也称为pituitary tumor-transforming gene 1 interacting protein 2,是一种与垂体瘤转化基因1(Pttg1)相互作用的蛋白。Pttg1是一种癌基因,在多种肿瘤中过表达,如垂体腺瘤、乳腺癌和卵巢癌。Pttg1ip2与Pttg1的相互作用可能影响Pttg1的活性,进而影响肿瘤的发生和发展。
基因复制和基因丢失是动物基因组进化中的常见事件,两者之间的平衡导致不同物种间基因数量的显著差异。在基因复制后,两个拷贝通常以相似的速度积累序列变化。然而,在某些情况下,序列变化的积累是不均衡的,一个拷贝与它的旁系同源基因发生显著分化。这种“不对称进化”在串联基因复制后比全基因组复制后更为常见,并且可以产生实质上新颖的基因。例如,在蛾、软体动物和哺乳动物中复制的同源异型基因中就观察到了不对称进化,每个案例都产生了新的同源异型基因,并被招募到新的发育角色中[1]。
乳腺癌是一种异质性很强的疾病。大多数乳腺癌病例(约70%)被认为是散发的。家族性乳腺癌(约30%的患者),通常出现在乳腺癌发病率高的家族中,与许多高、中、低渗透性的易感基因有关。家系连锁研究已经确定了高渗透性基因BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53,这些基因负责遗传综合征。此外,基于家庭和基于人群的方法表明,参与DNA修复的基因,如CHEK2、ATM、BRIP1(FANCJ)、PALB2(FANCN)和RAD51C(FANCO),与中度乳腺癌风险相关。乳腺癌的全基因组关联研究(GWAS)发现了一些常见的低渗透性等位基因,这些等位基因与乳腺癌的略微增加或降低的风险相关。目前,仅在临床实践中广泛应用高渗透性基因。由于下一代测序技术的发展,预计所有家族性乳腺癌基因都将被纳入基因检测。然而,在全面实施多基因面板测试到临床工作流程之前,还需要对中度风险和低风险变异的临床管理进行额外研究。在这篇综述中,我们关注家族性乳腺癌风险的不同组成部分[2]。
基因电路是后基因组研究的一个核心焦点,旨在理解细胞现象是如何从基因和蛋白质的连接性中产生的。这种连接性产生了类似于复杂电路的分子网络图,为了系统地理解它,需要发展一个描述电路的数学框架。从工程的角度来看,通往这个框架的自然路径是通过构建和分析构成网络的底层模块。最近,在测序和基因工程方面的实验进展使得这种方法变得可行,通过设计和实施合成基因网络,这些网络适合于数学建模和定量分析。这些进展标志着基因电路学科的兴起,该学科为预测和评估细胞过程的动力学提供了一个框架。合成基因网络还将导致新的细胞控制逻辑形式,这可能在功能基因组学、纳米技术和基因与细胞治疗中具有重要的应用[3]。
理解基因型-表型关系是生物学中的一个中心目标。基因敲除产生了一个完全失去功能的基因型,并且是探索基因功能的一种常用方法。基因敲除的最严重表型后果是致死性。具有致死性敲除表型的基因被称为必需基因。基于酵母的全基因组敲除分析,基因组中高达约四分之一的基因可能是必需的。与其他基因型-表型关系一样,基因的必需性受背景效应的影响,并且可能由于基因-基因相互作用而发生变化。特别是,对于一些必需基因,由于敲除引起的致死性可以通过外基因抑制因子来挽救。这种“必需性的绕过”(BOE)基因-基因相互作用是一种被忽视的遗传抑制类型。最近的一项系统分析发现,令人惊讶的是,裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中近30%的必需基因的必需性可以通过BOE相互作用来绕过。在这里,我回顾了揭示和理解必需性绕过的历史和最近进展[4]。
基因调控网络是一个复杂的系统,其中基因通过直接或间接的方式相互影响,以调控基因表达和细胞过程。基因调控网络的研究对于理解细胞分化、发育和疾病发生等生物学过程至关重要。基因调控网络的研究方法包括实验方法,如基因敲除和基因过表达,以及计算方法,如基因表达分析[5]。
一个全面的、可计算的人类基因组中所有宏分子编码的基因功能的表示是生物学和生物医学研究的基础资源。基因本体论联盟一直致力于实现这一目标,通过生成一个关于基因功能的结构化信息体,现在包括超过175,000篇出版物中报道的人类基因和实验可操作模型生物的基因的实验发现。在这里,我们描述了一个大型、国际性的努力结果,该努力整合了所有这些发现,以创建尽可能完整和准确的表示人类基因功能的资源。具体来说,我们对所有人类蛋白编码基因应用了专家策划的、明确的进化模型方法。这种方法将相关基因家族中可用的实验信息整合到模型中,这些模型重建了进化过程中功能的获得和丧失。模型和由此产生的68,667个集成基因功能覆盖了大约82%的人类蛋白编码基因。功能库揭示了分子调控功能的明显优势,模型提供了人类基因功能进化起源的见解。我们表明,我们描述功能的集合可以改进广泛使用的基因本体论富集分析。每个功能特征的实验证据都被记录下来,从而使得科学界能够帮助审查和改进这个资源,我们已经使其公开可用[6]。
综上所述,Pttg1ip2是一种重要的蛋白质,与垂体瘤转化基因1(Pttg1)相互作用,可能影响Pttg1的活性,进而影响肿瘤的发生和发展。Pttg1ip2的研究可以帮助我们更好地理解基因复制和基因丢失在动物基因组进化中的作用,以及基因调控网络在细胞分化、发育和疾病发生中的重要性。此外,Pttg1ip2的研究还可以帮助我们揭示基因型-表型关系,以及必需基因的必需性绕过的机制。最后,Pttg1ip2的研究还可以帮助我们更好地理解乳腺癌等疾病的发生和发展机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略[1][2][3][4][5][6]。
参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/
5. Davidson, Eric, Levin, Michael. 2005. Gene regulatory networks. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 102, 4935. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15809445/
6. Feuermann, Marc, Mi, Huaiyu, Gaudet, Pascale, Mushayahama, Tremayne, Thomas, Paul D. 2025. A compendium of human gene functions derived from evolutionary modelling. In Nature, 640, 146-154. doi:10.1038/s41586-025-08592-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/40011791/