智鼠故事 
C57BL/6JCya-Depdc7em1flox/Cya 条件性基因敲除小鼠
复苏/繁育服务
产品名称：
Depdc7-flox
产品编号：
S-CKO-05600
品系背景：
C57BL/6JCya
* 使用本品系发表的文献需注明：Depdc7-flox mice (Strain S-CKO-05600) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
只
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-Depdc7em1flox/Cya
品系编号
CKOCMP-211896-Depdc7-B6J-VA
产品编号
S-CKO-05600
基因名
Depdc7
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
--
NCBI号
修饰方式
条件性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
在研小鼠
环境标准
SPF
供应地区
中国
品系详情
Depdc7位于小鼠的2号染色体，采用基因编辑技术，通过高通量电转受精卵方式，获得Depdc7基因条件性敲除小鼠，性成熟后取精子冻存。
Depdc7-flox小鼠模型是由赛业生物（Cyagen）构建的条件性基因敲除小鼠。Depdc7基因位于小鼠2号染色体上，由9个外显子组成，其中ATG起始密码子在1号外显子，TGA终止密码子在9号外显子。条件性敲除区域（cKO区域）位于2号外显子，包含约891个碱基对的编码序列。删除该区域会导致小鼠Depdc7基因功能的丧失。Depdc7-flox小鼠模型的构建过程包括将核糖核蛋白（RNP）和靶向载体共同注入受精卵。随后，对出生的小鼠进行PCR和测序分析进行基因型鉴定。此外，携带敲除等位基因的小鼠，由于2号外显子的删除，导致基因发生移码，进一步影响基因的表达和功能。Depdc7-flox小鼠模型可用于研究Depdc7基因在小鼠体内的功能，为相关疾病的研究和治疗提供重要的工具和资源。
基因研究概述
Depdc7，即DEP domain containing 7，是一种在正常肝脏组织中高表达而在其他大多数组织中低表达的基因。Depdc7属于肝脏选择性细胞通讯基因类，其具体功能尚未完全明了。然而，研究表明Depdc7的表达在肝癌组织中下调，提示其在肝癌的发生发展中可能发挥重要作用。
在一项研究中，研究人员构建了一种RNA干扰（RNAi）重组慢病毒载体，靶向Depdc7基因，以在人类肝细胞癌细胞系HepG2中敲低其基因表达。他们筛选了三个针对Depdc7的RNAi序列和一个随机序列，并将这些序列分别克隆到pLV-H1-EF1α-puro载体中，构建了四个慢病毒载体。感染HepG2细胞后，通过实时PCR和蛋白质印迹分析检测Depdc7 mRNA和蛋白质表达水平，发现基因表达在两个水平上都显著下调。细胞迁移和侵袭能力通过Matrigel迁移和侵袭实验检测，结果显示HepG2细胞的迁移和侵袭能力显著增强。该研究成功构建了三个针对Depdc7基因的慢病毒RNAi载体，并证明shRNA介导的Depdc7基因敲低能够促进细胞迁移和侵袭[1]。
另一项研究表明，Depdc7在肝癌细胞系（SMMC-7721、Huh-7、SK-Hep-1和HepG2）和48个肝癌组织中表达下调。当在肝癌细胞系（SK-Hep-1和Huh-7）中过表达Depdc7时，它抑制细胞增殖和生长，抑制细胞周期进入，抑制细胞迁移和侵袭。这些结果，连同敲低实验的结果，表明Depdc7可能在肝癌细胞的生长和转移中发挥重要作用，并建议它可能是一个治疗靶点[2]。
在另一项研究中，研究人员比较了重症监护病房中患有败血症和未患有败血症的患者血浆中的肽和蛋白质。他们发现，与ICU对照组相比，ICU败血症患者的蛋白质观察频率增加，包括Depdc7在内的多种蛋白质。这些发现表明，Depdc7可能在败血症的发生发展中发挥作用[3]。
此外，Depdc7的DNA低甲基化与抑郁症的发生发展相关。在一项研究中，研究人员发现Depdc7基因内含子区域的DNA低甲基化与近期抑郁症症状相关[4]。
在一项探索性研究中，研究人员对患有发育性色觉障碍的家庭成员进行了CGH-array分析和外显子测序，发现Depdc7是可能与该疾病相关的候选基因之一[5]。
Depdc7还与NF-κB信号通路相关。在一项研究中，研究人员发现Depdc7与CARMA2和CARMA3蛋白结合，并调节NF-κB的激活。Depdc7的表达诱导NF-κB的激活，而shRNA介导的Depdc7的敲低则导致G蛋白偶联受体刺激后NF-κB的激活受损[6]。
在一项研究中，研究人员探索了与脂肪酸代谢相关的基因在肝细胞癌中的诊断和预后意义。他们发现，Depdc7是肝细胞癌的关键基因之一，与疾病的诊断和预后相关[7]。
在一项研究中，研究人员描述了一名患有隐睾症和非梗阻性无精子症的患者，其11p13区域存在一个约1Mb的新型Alu介导的微小缺失。该缺失涉及9个基因，包括Depdc7。这些发现表明，Depdc7可能在生殖系统的发育和功能中发挥作用[8]。
综上所述，Depdc7是一种在肝脏组织中高表达的基因，其表达在肝癌组织中下调，提示其在肝癌的发生发展中可能发挥重要作用。Depdc7还与NF-κB信号通路相关，并可能在败血症、抑郁症、发育性色觉障碍和生殖系统的发育和功能中发挥作用。Depdc7的研究有助于深入理解其在多种疾病中的作用机制，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献：
1. Liao, Zhijun, Wang, Xinrui, Lin, Dexin, Zou, Quan. 2016. Construction and Identification of the RNAi Recombinant Lentiviral Vector Targeting Human DEPDC7 Gene. In Interdisciplinary sciences, computational life sciences, 9, 350-356. doi:10.1007/s12539-016-0162-y. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27016254/
2. Liao, Zhijun, Wang, Xinrui, Wang, Xiaojiang, Li, Lisheng, Lin, Dexin. 2017. DEPDC7 inhibits cell proliferation, migration and invasion in hepatoma cells. In Oncology letters, 14, 7332-7338. doi:10.3892/ol.2017.7128. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29344171/
3. Thavarajah, Thanusi, Dos Santos, Claudia C, Slutsky, Arthur S, Romaschin, Alexander, Marshall, John G. 2020. The plasma peptides of sepsis. In Clinical proteomics, 17, 26. doi:10.1186/s12014-020-09288-5. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32636717/
4. Córdova-Palomera, A, Fatjó-Vilas, M, Palma-Gudiel, H, Kebir, O, Fañanás, L. 2015. Further evidence of DEPDC7 DNA hypomethylation in depression: A study in adult twins. In European psychiatry : the journal of the Association of European Psychiatrists, 30, 715-8. doi:10.1016/j.eurpsy.2015.04.001. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25952135/
5. Nijboer, Tanja C W, Hessel, Ellen V S, van Haaften, Gijs W, Brilstra, Eva H, Burbach, J Peter H. 2023. Identification of candidate genes for developmental colour agnosia in a single unique family. In PloS one, 18, e0290013. doi:10.1371/journal.pone.0290013. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37672513/
6. D'Andrea, Egildo Luca, Ferravante, Angela, Scudiero, Ivan, Vito, Pasquale, Stilo, Romania. 2014. The Dishevelled, EGL-10 and pleckstrin (DEP) domain-containing protein DEPDC7 binds to CARMA2 and CARMA3 proteins, and regulates NF-κB activation. In PloS one, 9, e116062. doi:10.1371/journal.pone.0116062. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25541973/
7. Zhao, Sha-Sha, Bai, Rong-Rong, Zhang, Bao-Hua, Zhang, Yue, Cui, Zhong-Qi. 2024. Investigating the diagnostic and prognostic significance of genes related to fatty acid metabolism in hepatocellular carcinoma. In BMC gastroenterology, 24, 409. doi:10.1186/s12876-024-03495-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39548390/
8. Seabra, Catarina M, Quental, Sofia, Neto, Ana Paula, Amorim, António, Lopes, Alexandra M. 2014. A novel Alu-mediated microdeletion at 11p13 removes WT1 in a patient with cryptorchidism and azoospermia. In Reproductive biomedicine online, 29, 388-91. doi:10.1016/j.rbmo.2014.04.017. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24912414/
