智鼠故事 
C57BL/6JCya-Alkbh1em1flox/Cya 条件性基因敲除小鼠
复苏/繁育服务
产品名称：
Alkbh1-flox
产品编号：
S-CKO-05561
品系背景：
C57BL/6JCya
* 使用本品系发表的文献需注明：Alkbh1-flox mice (Strain S-CKO-05561) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
只
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-Alkbh1em1flox/Cya
品系编号
CKOCMP-211064-Alkbh1-B6J-VA
产品编号
S-CKO-05561
基因名
Alkbh1
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
Abh；alkB；hABH；Alkbh；2700073G19Rik
NCBI号
修饰方式
条件性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
MGI:2384034 Mice homozygous for a null allele show delayed fetal growth, impaired placental development and low birth weight. Mice homozygous for another null allele show sex-ratio distortion, reduced survival, spermatogenic defects and incompletely penetrant eye, neural tube, skeleton and craniofacial defects.
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
在研小鼠
环境标准
SPF
供应地区
中国
品系详情
Alkbh1位于小鼠的12号染色体，采用基因编辑技术，通过高通量电转受精卵方式，获得Alkbh1基因条件性敲除小鼠，性成熟后取精子冻存。
Alkbh1-flox小鼠模型是由赛业生物（Cyagen）采用基因编辑技术构建的条件性敲除小鼠。Alkbh1基因位于小鼠12号染色体上，由6个外显子组成，其中ATG起始密码子在1号外显子，TAA终止密码子在6号外显子。条件性敲除区域（cKO区域）位于第二号至3号外显子，包含272个碱基对的编码序列。删除该区域会导致小鼠Alkbh1基因功能的丧失。
Alkbh1-flox小鼠模型的构建过程包括将核糖核蛋白（RNP）和靶向载体共同注入受精卵。随后，对出生的小鼠进行PCR和测序分析进行基因型鉴定。赛业生物（Cyagen）的研究表明，对于携带敲除等位基因的小鼠，会出现不同的表型。例如，对于携带一个特定等位基因的小鼠，会出现延迟的胎儿生长、受损的胎盘发育和低出生体重。而对于携带另一个特定等位基因的小鼠，会出现性别比例失衡、生存率降低、精子生成缺陷以及不完全的视网膜、神经管、骨骼和颅面缺陷。此外，敲除第二号至3号外显子会导致基因移码，并覆盖编码区域的23.31%。5'-loxP位点插入的大小为3227个碱基对，而3'-loxP位点插入的大小为4187个碱基对。有效的cKO区域大小约为2.9千碱基对。该策略基于现有数据库中的遗传信息设计，但由于生物过程的复杂性，无法预测loxP插入对基因转录、RNA剪接和蛋白质翻译的风险。
Alkbh1-flox小鼠模型可用于研究Alkbh1基因在小鼠体内的功能。该模型可以帮助研究人员研究Alkbh1基因在胚胎发育、胎盘发育、性别比例、生存率、精子生成以及视网膜、神经管、骨骼和颅面发育等方面的作用。此外，该模型还可以用于研究Alkbh1基因移码突变对蛋白质功能和表达的影响。
基因研究概述
ALKBH1，也称为AlkB同源物1，是一种关键的RNA脱甲基酶，在人类细胞中发挥着重要作用。它参与调控多种细胞过程，包括RNA修饰、DNA修饰和蛋白质翻译。ALKBH1不仅与多种生物学过程相关，还与多种人类疾病的发生和发展密切相关。本文将基于相关研究，对ALKBH1的功能和作用进行综述。
首先，ALKBH1是一种tRNA脱甲基酶，它通过介导tRNA中N1-甲基腺苷（m1A）的脱甲基化来调节蛋白质合成。研究发现，ALKBH1催化tRNA的脱甲基化会导致翻译起始的减弱和tRNA在蛋白质合成中的使用减少。这一过程是动态的，并且会响应葡萄糖的可用性来影响翻译。此外，ALKBH1还参与了DNA N6-甲基腺嘌呤（6mA）的脱甲基化。在慢性肾脏疾病（CKD）中，ALKBH1的表达上调导致6mA水平的降低，进而促进血管钙化（VC）的发生。研究发现，ALKBH1通过脱甲基化DNA 6mA修饰，促进八聚体结合转录因子4（Oct4）与骨形态发生蛋白2（BMP2）启动子的结合，并激活BMP2的转录。这导致了血管平滑肌细胞（VSMCs）的成骨性重编程和VC的进展[1]。
除了tRNA和DNA的修饰，ALKBH1还与RNA的其他修饰有关。研究发现，ALKBH1与RNA 5-甲基胞嘧啶（m5C）的动态调节有关。m5C是一种普遍存在于RNA上的表观遗传修饰，参与调控RNA的代谢和功能。ALKBH1作为m5C的脱甲基酶，参与了m5C的动态调节，并与多种RNA代谢过程相关，包括mRNA输出、RNA稳定性和翻译。此外，ALKBH1还与多种人类疾病的发生和发展密切相关。研究发现，ALKBH1的基因多态性与胃癌的易感性相关。在胃癌患者中，ALKBH1的表达上调，并且与患者的生存率降低相关。研究发现，ALKBH1通过脱甲基化DNA 6mA修饰，抑制NRF1的结合能力，从而抑制AMPK信号通路，导致代谢向Warburg效应转变，促进胃癌的发生。此外，ALKBH1还与肿瘤相关巨噬细胞的浸润相关。研究发现，ALKBH1的表达上调与胃癌的进展和不良预后相关。ALKBH1通过调节m6A RNA脱甲基化，影响肿瘤免疫微环境，并促进胃癌的发生和发展[2][3]。
ALKBH1还与病毒的复制有关。研究发现，登革病毒通过劫持宿主的tRNA表观遗传组来促进病毒蛋白的表达，而ALKBH1作为tRNA修饰的脱甲基酶，在登革病毒感染中发挥宿主限制因子的作用。研究发现，ALKBH1和其tRNA产物5-甲酰胞嘧啶（f5C）和2'-O-甲基-5-甲酰胞嘧啶（f5Cm）在登革病毒感染早期被减少。ALKBH1敲低模拟了病毒感染，导致感染期间病毒NS3蛋白水平升高，而ALKBH1过表达则降低了NS3水平和病毒复制，并增加了f5C和f5Cm。此外，ALKBH1还与肺癌的发生和发展有关。研究发现，ALKBH1在肺癌组织和细胞中的表达水平上调。ALKBH1的敲低抑制了肺癌细胞的侵袭和迁移能力，而其过表达则促进了这些能力。此外，ALKBH1的晶体结构揭示了其N端结构域与核心催化结构域紧密接触，可能负责识别核酸底物[4][5]。
综上所述，ALKBH1是一种关键的RNA脱甲基酶，参与调控多种细胞过程，包括RNA修饰、DNA修饰和蛋白质翻译。ALKBH1在多种生物学过程中发挥重要作用，并与多种人类疾病的发生和发展密切相关。因此，深入研究ALKBH1的功能和作用机制，对于理解RNA表观遗传修饰的生物学功能和疾病发生机制具有重要意义，并为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献：
1. Ouyang, Liu, Su, Xiaoyan, Li, Wenxin, Chen, Jie, Huang, Hui. . ALKBH1-demethylated DNA N6-methyladenine modification triggers vascular calcification via osteogenic reprogramming in chronic kidney disease. In The Journal of clinical investigation, 131, . doi:10.1172/JCI146985. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34003800/
2. Li, Yue, Zhou, Dalei, Liu, Qing, Ye, Zulu, He, Caiyun. 2022. Gene Polymorphisms of m6A Erasers FTO and ALKBH1 Associated with Susceptibility to Gastric Cancer. In Pharmacogenomics and personalized medicine, 15, 547-559. doi:10.2147/PGPM.S360912. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35669943/
3. Chang, Renin, Tsui, Kuan-Hao, Pan, Li-Fei, Li, Chia-Jung. 2024. Spatial and single-cell analyses uncover links between ALKBH1 and tumor-associated macrophages in gastric cancer. In Cancer cell international, 24, 57. doi:10.1186/s12935-024-03232-5. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38317214/
4. Chan, Cheryl, Kwan Sze, Newman Siu, Suzuki, Yuka, Begley, Thomas J, Dedon, Peter C. 2023. Dengue virus exploits the host tRNA epitranscriptome to promote viral replication. In bioRxiv : the preprint server for biology, , . doi:10.1101/2023.11.05.565734. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37986976/
5. Li, Hong, Zhang, Ying, Guo, Yajuan, Xie, Wei, Wang, Caiyan. 2020. ALKBH1 promotes lung cancer by regulating m6A RNA demethylation. In Biochemical pharmacology, 189, 114284. doi:10.1016/j.bcp.2020.114284. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33068553/
