Zfp677,也称为锌指蛋白677,是一种在哺乳动物基因组中发现的基因。它编码的蛋白质属于锌指蛋白家族,该家族的成员因其具有与锌离子结合的结构域而得名。锌指蛋白通常参与DNA和RNA的结合,在基因表达调控中发挥着重要作用。Zfp677的蛋白质产品包含多个锌指结构域,这些结构域使其能够识别并结合特定的DNA序列,从而调控基因的转录活性。
Zfp677在生物体内发挥多种生物学功能。研究表明,Zfp677参与细胞分化、发育和免疫应答等生物学过程。在细胞分化过程中,Zfp677的表达水平的变化可以影响细胞的命运决定,从而调控组织和器官的形成。在发育过程中,Zfp677的异常表达与多种发育异常相关,如神经系统发育异常和骨骼发育异常。在免疫应答中,Zfp677的蛋白质产品可以与DNA结合,调控免疫相关基因的表达,从而影响免疫细胞的活性和功能。
基因的复制和丢失是动物基因组进化的常见事件,它们之间的平衡对物种间基因数量的差异产生了重要影响。在基因复制后,通常两个副本基因的序列变化速率大致相等。然而,在某些情况下,序列变化的积累可能非常不均衡,其中一个副本基因与另一个副本基因发生显著的分化。这种“非对称进化”在串联基因复制后比在全基因组复制后更为常见,并且可以产生全新的基因。例如,在蛾类、软体动物和哺乳动物中,Zfp677基因的副本经历了非对称进化,形成了新的Zfp677基因,这些新基因被招募到新的发育角色中[1]。
乳腺癌是一种异质性疾病,其中大部分病例(约70%)被认为是散发性的。家族性乳腺癌(约30%的患者)通常在乳腺癌高发的家族中观察到,并且与许多高、中、低渗透率的易感基因相关。家族连锁研究已经确定了高渗透率基因BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53,它们负责遗传性综合征。此外,基于家族和人群的研究表明,参与DNA修复的基因,如CHEK2、ATM、BRIP1(FANCJ)、PALB2(FANCN)和RAD51C(FANCO),与中度乳腺癌风险相关。乳腺癌的全基因组关联研究(GWAS)发现了一些与乳腺癌风险略有升高或降低的常见低渗透率等位基因。目前,只有高渗透率基因在临床实践中得到广泛应用。随着下一代测序技术的发展,预计所有家族性乳腺癌基因都将纳入遗传测试。然而,在多基因面板测试完全应用于临床工作流程之前,还需要对中度和低风险变异的临床管理进行更多研究[2]。
工程基因电路是后基因组时代研究的一个重点,旨在理解细胞现象是如何从基因和蛋白质的连通性中产生的。这种连通性生成了类似于复杂电路的分子网络图,对其系统性的理解需要开发一个描述电路的数学框架。从工程的角度来看,构建和分析构成网络的底层子模块是构建这样一个框架的自然途径。最近在测序和基因工程方面的实验进展使这种方法成为可能,通过设计和实施易于数学建模和定量分析的合成基因网络。这些发展标志着基因电路学科的兴起,它为预测和评估细胞过程的动力学提供了一个框架。合成基因网络还将导致新的细胞控制逻辑形式,这可能对功能基因组学、纳米技术和基因治疗等领域具有重要意义[3]。
基因敲除技术常用于研究基因功能,但基因敲除导致的致死性是研究基因功能的一个挑战。基因敲除导致的致死性是基因必需性的最严重表型后果。基因必需性是指基因在生物体内是必需的,其缺失会导致生物体死亡。基因必需性受背景效应和基因-基因相互作用的影响。对于某些必需基因,由敲除引起的致死性可以通过基因间相互作用得到挽救。这种“必需性旁路”(BOE)基因-基因相互作用是一种尚未得到充分研究的遗传抑制类型。最近,一项系统性的分析发现,在裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中,近30%的必需基因的必需性可以通过BOE相互作用得到旁路[4]。
基因调控网络是细胞内基因表达调控的重要组成部分。基因调控网络由多个基因和它们之间的相互作用组成,它们协同工作以调节基因的表达模式。基因调控网络在细胞分化和发育中发挥着重要作用,它们通过精确控制基因的表达时间和空间模式来指导细胞命运的决定。基因调控网络的紊乱与多种疾病的发生发展密切相关,如癌症、神经退行性疾病和代谢疾病。研究基因调控网络的机制和功能对于理解疾病的发病机制和开发新的治疗方法具有重要意义[5]。
综上所述,Zfp677基因在生物体内发挥着多种生物学功能,包括细胞分化、发育和免疫应答等。Zfp677基因的副本经历了非对称进化,形成了新的Zfp677基因,这些新基因被招募到新的发育角色中。基因的复制和丢失是动物基因组进化的常见事件,它们之间的平衡对物种间基因数量的差异产生了重要影响。乳腺癌是一种异质性疾病,与许多高、中、低渗透率的易感基因相关。工程基因电路是后基因组时代研究的一个重点,旨在理解细胞现象是如何从基因和蛋白质的连通性中产生的。基因敲除技术常用于研究基因功能,但基因敲除导致的致死性是研究基因功能的一个挑战。基因调控网络是细胞内基因表达调控的重要组成部分,它们协同工作以调节基因的表达模式。研究Zfp677基因的功能和调控机制对于深入理解其生物学功能和疾病发生机制具有重要意义,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/
5. Davidson, Eric, Levin, Michael. 2005. Gene regulatory networks. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 102, 4935. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15809445/