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C57BL/6JCya-Ssrp1em1flox/Cya 条件性基因敲除小鼠
复苏/繁育服务
产品名称:
Ssrp1-flox
产品编号:
S-CKO-05322
品系背景:
C57BL/6JCya
小鼠资源库
* 使用本品系发表的文献需注明:Ssrp1-flox mice (Strain S-CKO-05322) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-Ssrp1em1flox/Cya
品系编号
CKOCMP-20833-Ssrp1-B6J-VA
产品编号
S-CKO-05322
基因名
Ssrp1
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
T160;Hmgox;Hmg1-rs1;Hmgi-rs3
NCBI号
修饰方式
条件性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
MGI:107912 Disruption of this gene is lethal resulting in death at some point between implantation and E5.5.
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
在研小鼠
环境标准
SPF
供应地区
中国
品系详情
Ssrp1位于小鼠的2号染色体,采用基因编辑技术,通过高通量电转受精卵方式,获得Ssrp1基因条件性敲除小鼠,性成熟后取精子冻存。
Ssrp1-flox小鼠模型由赛业生物(Cyagen)采用基因编辑技术构建,是一种条件性基因敲除小鼠。Ssrp1基因位于小鼠2号染色体上,包含17个外显子,其中ATG起始密码子位于2号外显子,TAA终止密码子位于17号外显子。条件性敲除区域(cKO区域)位于第4号到9号外显子,包含约2283个碱基对的编码序列。删除该区域会导致小鼠Ssrp1基因功能的丧失。Ssrp1-flox小鼠模型的构建过程包括将核糖核蛋白(RNP)和靶向载体共同注入受精卵。随后,对出生的小鼠进行PCR和测序分析进行基因型鉴定。Ssrp1-flox小鼠模型可用于研究Ssrp1基因在小鼠体内的功能。
基因研究概述
SSRP1,即结构特异性识别蛋白1,是一种重要的组蛋白伴侣蛋白,与Spt16一起组成FACT(facilitates chromatin transcription)复合物。FACT复合物在多种染色质相关过程中发挥关键作用,包括DNA复制、修复和转录。通过破坏RNA聚合酶II转录过程中的核小体结构,FACT复合物促进转录延伸,从而确保基因表达的有效进行。此外,FACT复合物还参与调节细胞周期和细胞凋亡,影响细胞代谢和能量产生,以及调控上皮-间质转化(EMT)等生物学过程。
在人类细胞中,SSRP1的Spt16依赖和非依赖性作用在基因转录调节中发挥着重要作用。研究发现,在人类非小细胞肺癌细胞中,SSRP1和Spt16的敲低导致约170个基因的转录水平发生了显著变化,其中包括约106个基因是SSRP1和Spt16的共同靶点。此外,SSRP1还可以独立于Spt16调节部分基因的转录,例如血清反应基因egr1[1]。这些结果表明,SSRP1在人类细胞中具有Spt16依赖和非依赖性作用,共同参与基因转录的调节。
在黑色素瘤中,SSRP1的表达水平显著升高,且与患者的预后不良相关。SSRP1的敲低可以抑制黑色素瘤细胞的增殖、迁移和侵袭能力,并影响上皮-间质转化(EMT)过程。进一步研究发现,SSRP1通过激活MAPK信号通路,促进黑色素瘤细胞的恶性进展[2]。这表明SSRP1可能在黑色素瘤的发生发展中发挥重要作用,有望成为治疗黑色素瘤的潜在靶点。
在肝母细胞瘤(HB)中,FACT复合物的抑制可以破坏MYC和SSRP1之间的致癌性正反馈回路,从而抑制HB1-Pro-like1亚群和其相关高风险“Pro-like1”亚型的HB细胞生长。这表明FACT复合物在HB的发生发展中发挥重要作用,有望成为HB治疗的潜在靶点[3]。
在结直肠癌(CRC)中,SSRP1的表达水平显著升高,且与患者的预后不良相关。SSRP1的敲低可以抑制CRC细胞的增殖、迁移和侵袭能力,并影响细胞代谢和EMT过程。此外,SSRP1还通过诱导细胞凋亡,增强CRC细胞对化疗药物的敏感性。研究发现,miR-28-5p是SSRP1的直接上游调控因子,通过负向调节SSRP1的表达,抑制CRC的进展[4]。
FACT复合物的缺失会导致染色质结构的破坏,影响RNA聚合酶II的转录延伸,导致转录缺陷,包括启动子近端暂停和延伸的缺陷,以及RNA聚合酶II的过早终止。研究发现,FACT复合物通过维持+1核小体的稳定性,参与调节RNA聚合酶II的启动子近端暂停过程[5]。这表明FACT复合物在维持染色质结构和RNA聚合酶II转录延伸过程中发挥重要作用。
在肝细胞癌(HCC)中,SSRP1的表达水平显著升高,且与患者的预后不良相关。SSRP1的敲低可以抑制HCC细胞的增殖、迁移和侵袭能力,并影响细胞代谢和EMT过程。此外,SSRP1还通过诱导细胞凋亡,增强HCC细胞对化疗药物的敏感性。研究发现,miR-497是SSRP1的下游调控因子,通过负向调节SSRP1的表达,抑制HCC的进展[6]。
SSRP1的表达水平与HCC患者的临床特征相关,如血清AFP水平、肿瘤大小和T分期等。此外,SSRP1的表达水平与Treg细胞和CD8+ T细胞的浸润水平呈正相关,尤其是在耗竭型CD8+ T细胞中。这表明SSRP1可能通过影响CD8+ T细胞的浸润,促进HCC的发生发展[7]。
在拟南芥中,SSRP1突变体表现出降低的种子休眠性。研究发现,SSRP1突变体中DOG1基因的转录水平降低,而DOG1基因是已知的种子休眠性的数量性状位点(QTL)。这表明SSRP1在维持拟南芥种子休眠性方面发挥重要作用[8]。
在类风湿性关节炎(RA)中,Mir204和Mir211可以抑制滑膜炎症和增殖。研究发现,SSRP1是Mir204/211的下游靶基因。Mir204/211通过靶向SSRP1,抑制RA的发展。这表明Mir204/211可能成为治疗RA的潜在药物[9]。
综上所述,SSRP1在多种生物学过程中发挥重要作用,包括基因转录调节、细胞增殖、迁移、侵袭、细胞代谢、能量产生、细胞凋亡和EMT等。SSRP1在多种癌症中表达升高,并与患者的预后不良相关。此外,SSRP1还参与调节种子休眠性和RA的发展。SSRP1的研究有助于深入理解染色质相关过程的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献:
1. Li, Yanping, Zeng, Shelya X, Landais, Igor, Lu, Hua. 2007. Human SSRP1 has Spt16-dependent and -independent roles in gene transcription. In The Journal of biological chemistry, 282, 6936-45. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17209051/
2. Yu, Yang, Gao, Yang, Yu, Yang. . SSRP1 Worsens Malignant Melanoma Progression by Activating MAPKs Pathway. In Annals of clinical and laboratory science, 51, 783-789. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34921031/
3. Huang, Hongting, Wu, Liang, Lu, Li, Tang, Yujie, Xia, Qiang. 2023. Single-cell transcriptomics uncovers cellular architecture and developmental trajectories in hepatoblastoma. In Hepatology (Baltimore, Md.), 77, 1911-1928. doi:10.1002/hep.32775. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36059151/
4. Wu, Wei, He, Ke, Guo, Qian, Ding, Qianshan, Xiang, Guoan. 2019. SSRP1 promotes colorectal cancer progression and is negatively regulated by miR-28-5p. In Journal of cellular and molecular medicine, 23, 3118-3129. doi:10.1111/jcmm.14134. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30762286/
5. Žumer, Kristina, Ochmann, Moritz, Aljahani, Abrar, Oudelaar, A Marieke, Cramer, Patrick. 2024. FACT maintains chromatin architecture and thereby stimulates RNA polymerase II pausing during transcription in vivo. In Molecular cell, 84, 2053-2069.e9. doi:10.1016/j.molcel.2024.05.003. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38810649/
6. Chen, Xuyang, Li, Mengxin, Wang, Ding, Guo, Baofeng, Zhang, Ling. 2023. Histone chaperone SSRP1 is required for apoptosis inhibition and mitochondrial function in HCC via transcriptional promotion of TRAP1. In Biochemistry and cell biology = Biochimie et biologie cellulaire, 101, 361-376. doi:10.1139/bcb-2023-0006. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37084412/
7. Ding, Qianshan, He, Ke, Luo, Tao, Jiao, Xingyuan, Xiang, Guoan. 2016. SSRP1 Contributes to the Malignancy of Hepatocellular Carcinoma and Is Negatively Regulated by miR-497. In Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy, 24, 903-14. doi:10.1038/mt.2016.9. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26755331/
8. Luo, Guanshui, Xu, Jianguo, Xia, Zhenglin, He, Ke, Xiang, Guoan. 2021. SSRP1 Is a Prognostic Biomarker Correlated with CD8+ T Cell Infiltration in Hepatocellular Carcinoma (HCC). In BioMed research international, 2021, 9409836. doi:10.1155/2021/9409836. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33688504/
9. Michl-Holzinger, Philipp, Mortensen, Simon A, Grasser, Klaus D. 2019. The SSRP1 subunit of the histone chaperone FACT is required for seed dormancy in Arabidopsis. In Journal of plant physiology, 236, 105-108. doi:10.1016/j.jplph.2019.03.006. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30947026/