Elfn2,也称为ELFN2(Elongation factor-like 2),是一种在哺乳动物中广泛表达的基因。Elfn2编码的蛋白质与延伸因子类似,但它的具体功能和生物学作用尚未完全明确。然而,一些研究表明Elfn2在细胞分化、发育和疾病发生中发挥着重要作用。
在精子发生过程中,Elfn2被认为是RNA helicase DDX43的靶基因。DDX43是一种RNA结合蛋白,在精子发生过程中发挥着重要的调控作用。研究表明,DDX43缺失或表达DDX43 ATPase-dead突变体会导致精子发生异常,包括组蛋白到精蛋白的替换和后减数分裂染色质凝聚缺陷。通过单细胞RNA测序分析,发现DDX43调节了动态的RNA调控过程,这些过程是精子细胞染色质重塑和分化的基础。此外,转录组分析进一步确定了Elfn2是DDX43的靶基因[1]。
Elfn2在胶质母细胞瘤(GBM)中的作用也得到了研究。研究表明,Elfn2在GBM中作为一种新的低甲基化基因,发挥着致癌基因的作用。Elfn2通过与非肌动蛋白相关激酶A(AurkA)和真核翻译起始因子2α(eIF2α)相互作用,促进细胞自噬,并抑制AurkA的激活。此外,LINC00470通过吸附miR-101并降低H3K27me3的占据水平,增强了Elfn2的表达。这些结果表明,Elfn2和LINC00470在GBM细胞自噬的调控中发挥着重要作用,并且它们的组合对于评估星形细胞瘤患者的预后具有重要意义[2]。
Elfn2还与子宫内膜癌(EC)的进展和预后相关。一项研究通过对TCGA数据库中的mRNA和miRNA数据进行生物信息学分析,发现Elfn2与子宫内膜癌的预后相关。此外,功能富集分析显示,Elfn2的共表达基因主要参与PI3K-Akt信号通路。这些结果表明,Elfn2可能在子宫内膜癌的进展和预后中发挥着重要作用[3]。
此外,Elfn2还与循环总tau水平相关。一项全基因组关联研究(GWAS)发现,Elfn2与循环总tau水平相关,并且在不同种族之间存在差异。这项研究表明,Elfn2可能参与tau蛋白的代谢和tauopathy的发生[4]。
Elfn2还与儿童的身体成分相关。一项全基因组关联研究(EWAS)发现,Elfn2的DNA甲基化与儿童的身体质量指数(BMI)、脂肪质量、无脂肪质量和脂肪质量指数相关。这些结果表明,Elfn2的DNA甲基化可能参与儿童身体成分的调控[5]。
最后,Elfn2还与胰腺癌的放疗抵抗性相关。一项研究表明,Elfn2在放疗抵抗性胰腺癌细胞系中表达上调,并且通过抑制胆固醇生物合成途径的分支点酶farnesyl diphosphate synthase(FDPS)的表达,可以提高胰腺癌细胞对放疗的敏感性。这表明,Elfn2可能参与胰腺癌的放疗抵抗性,并且胆固醇生物合成途径可能是放疗抵抗性的一个潜在靶点[6]。
综上所述,Elfn2在多种生物学过程中发挥着重要作用,包括精子发生、胶质母细胞瘤、子宫内膜癌、tauopathy和身体成分。Elfn2的调控机制和生物学功能的研究将有助于深入理解Elfn2在疾病发生和发展中的作用,并为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献:
1. Tan, Huanhuan, Wang, Weixu, Zhou, Congjin, Ni, Ting, Zheng, Ke. 2023. Single-cell RNA-seq uncovers dynamic processes orchestrated by RNA-binding protein DDX43 in chromatin remodeling during spermiogenesis. In Nature communications, 14, 2499. doi:10.1038/s41467-023-38199-w. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37120627/
2. Liu, Changhong, Fu, Haijuan, Liu, Xiaoping, Li, Guiyuan, Wu, Minghua. 2018. LINC00470 Coordinates the Epigenetic Regulation of ELFN2 to Distract GBM Cell Autophagy. In Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy, 26, 2267-2281. doi:10.1016/j.ymthe.2018.06.019. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30037656/
3. Dong, Ying, Zhang, Ting, Li, Xining, Yu, Hongwei, Shao, Shengwen. 2022. Identification of Key Prognostic-Related miRNA-mRNA Pairs in the Progression of Endometrial Carcinoma. In Gynecologic and obstetric investigation, 87, 12-21. doi:10.1159/000520339. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35081534/
4. Sarnowski, Chloé, Ghanbari, Mohsen, Bis, Joshua C, Ikram, M Arfan, Seshadri, Sudha. 2022. Meta-analysis of genome-wide association studies identifies ancestry-specific associations underlying circulating total tau levels. In Communications biology, 5, 336. doi:10.1038/s42003-022-03287-y. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35396452/
5. Rzehak, Peter, Covic, Marcela, Saffery, Richard, Gruszfeld, Dariusz, Koletzko, Berthold. 2017. DNA-Methylation and Body Composition in Preschool Children: Epigenome-Wide-Analysis in the European Childhood Obesity Project (CHOP)-Study. In Scientific reports, 7, 14349. doi:10.1038/s41598-017-13099-4. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29084944/
6. Souchek, J J, Baine, M J, Lin, C, Jain, M, Batra, S K. 2014. Unbiased analysis of pancreatic cancer radiation resistance reveals cholesterol biosynthesis as a novel target for radiosensitisation. In British journal of cancer, 111, 1139-49. doi:10.1038/bjc.2014.385. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25025965/