RFX2是一种重要的转录因子,属于RFX家族成员,主要参与调控哺乳动物精子发生和纤毛成熟。RFX转录因子在脊椎动物的纤毛发生中起关键作用,例如在蛙和斑马鱼胚胎中,RFX2基因的敲低会导致神经管闭合和左右轴模式形成缺陷[3]。在哺乳动物中,RFX2基因的功能也得到了研究。例如,小鼠模型中RFX2基因的敲除导致精子发生缺陷,表现为精子成熟过程中的停滞,尤其是在圆形和伸长的精子阶段[3,4]。这些研究表明RFX2基因在哺乳动物精子发生中发挥着重要作用。
除了在精子发生中的作用,RFX2基因还与炎症反应有关。在急性炎症过程中,中性粒细胞表现出不同的基因表达模式,取决于其发育阶段、激活状态和组织微环境[2]。研究发现,RFX2基因在中性粒细胞中发挥重要作用,促进其存活。通过靶向JUNB等转录因子,可以减少中性粒细胞激活引起的病理炎症[2]。
RFX2基因的表达和调控也受到了深入研究。例如,在巴马小型猪近交系(BMI)的睾丸中,RFX2基因的平均表达量为16138.25,其对应的转录本ENSSSCT00000043271.2的平均表达值为123.1898。基因结构分析表明,RFX2基因位于猪基因组2号染色体上,具有19个外显子。蛋白质结构分析显示,RFX2蛋白由728个氨基酸组成,包含两个保守结构域。系统发育分析表明,RFX2在哺乳动物物种之间具有高度保守性[1]。此外,BMI RFX2与43个蛋白质具有相互作用,涉及细胞周期、精子细胞发育、精子细胞分化、纤毛组装和纤毛组织等多种功能。相关分析表明,RFX2与FOXJ1、DNAH9、TMEM138、E2F7和ATR等蛋白质具有显著相关性,其中与ATR的相关性最高,表明RFX2和ATR在精子发生中具有重要作用。功能注释显示,RFX2参与了17个基因本体论(GO)术语,包括3个细胞成分(CC)、6个分子功能(MF)和8个生物过程(BP)。miRNA-gene靶向分析表明,BMI RFX2主要由两个miRNA调控,其中4个lncRNA和5个lncRNA竞争性结合ssc-miR-365-5p和ssc-miR-744与RFX2。双荧光素酶报告实验表明,ssc-miR-365-5p和ssc-miR-744显著降低了RFX2 3'UTR在293T细胞中的荧光素酶活性,表明这两个miRNA调控了RFX2的表达[1]。
此外,RFX2基因还与肿瘤细胞干性有关。研究发现,RFX2基因在脊髓室管膜瘤(SE)组织中表达升高,且与肿瘤干细胞特征相关。RFX2基因的敲低可以减少肿瘤干细胞标记物的表达,抑制肿瘤细胞的成球能力,并减缓肿瘤的恶性进展。RFX2基因通过结合PAF1启动子来诱导其转录,进而促进肿瘤干性[6]。
RFX2基因还参与调节纤毛基因的表达。研究发现,RFX2和Foxj1在更多纤毛基因的启动子上结合,而Foxj1更喜欢直接结合到增强子上,并通过RFX2稳定在启动子上。RFX2和Foxj1位于染色质环的锚点端,表明当Foxj1在远端位点结合时,RFX2通过环状结构将关键调节域与Foxj1结合,从而实现协调的纤毛基因表达[5]。
综上所述,RFX2基因在哺乳动物精子发生、炎症反应、肿瘤细胞干性和纤毛基因表达等方面发挥着重要作用。RFX2基因的调控和功能研究对于深入理解其在生物学过程中的作用和机制具有重要意义。未来的研究可以进一步探讨RFX2基因与其他相关基因和信号通路的相互作用,以及其在疾病发生和发展中的作用,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献:
1. Liu, Zhipeng, Dai, Hongmei, Huo, Hailong, Zhang, Xia, Huo, Jinlong. 2023. Molecular characteristics and transcriptional regulatory of spermatogenesis-related gene RFX2 in adult Banna mini-pig inbred line (BMI). In Animal reproduction, 20, e20220090. doi:10.1590/1984-3143-AR2022-0090. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36922987/
2. Khoyratty, Tariq E, Ai, Zhichao, Ballesteros, Ivan, Hidalgo, Andres, Udalova, Irina A. 2021. Distinct transcription factor networks control neutrophil-driven inflammation. In Nature immunology, 22, 1093-1106. doi:10.1038/s41590-021-00968-4. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34282331/
3. Shawlot, William, Vazquez-Chantada, Mercedes, Wallingford, John B, Finnell, Richard H. 2015. Rfx2 is required for spermatogenesis in the mouse. In Genesis (New York, N.Y. : 2000), 53, 604-611. doi:10.1002/dvg.22880. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26248850/
4. Kistler, W Stephen, Baas, Dominique, Lemeille, Sylvain, Durand, Bénédicte, Reith, Walter. 2015. RFX2 Is a Major Transcriptional Regulator of Spermiogenesis. In PLoS genetics, 11, e1005368. doi:10.1371/journal.pgen.1005368. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26162102/
5. Quigley, Ian K, Kintner, Chris. 2017. Rfx2 Stabilizes Foxj1 Binding at Chromatin Loops to Enable Multiciliated Cell Gene Expression. In PLoS genetics, 13, e1006538. doi:10.1371/journal.pgen.1006538. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28103240/
6. Zhang, Zhe, Chen, Yusheng, Guo, Yang, Wang, Jiangtao, Chen, Hang. 2023. RFX2 promotes tumor cell stemness through epigenetic regulation of PAF1 in spinal ependymoma. In Journal of neuro-oncology, 165, 487-497. doi:10.1007/s11060-023-04506-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38057505/