Rab33a,全称为Ras相关的小GTP酶33A,属于小GTP酶超家族的一员,是一种X染色体连锁基因。它在脑、淋巴细胞和正常黑色素细胞中表达,但在黑色素瘤细胞中下调。Rab33a在正常黑色素细胞中与黑素体蛋白共定位,并且其活性GTP酶突变体抑制了这些蛋白向黑素体的运输。在脑中,Rab33a存在于整个皮层以及海马CA区。对黑色素细胞病变的调查表明,Rab33a的异常下调是一个早期事件,在巨大先天性痣的黑色素细胞中已经普遍存在。通过分析亚硫酸氢盐修饰的DNA发现,Rab33a受其启动子区域DNA甲基化的调控,并且黑色素瘤细胞中Rab33a的抑制模拟了正常过程中X染色体连锁基因沉默的过程,而不是组织特异性基因表达。这些信息对于理解癌变以及其他异常过程很重要,因为Rab33a可能在涉及X染色体连锁基因的疾病中发挥重要作用,这些基因与囊泡运输有关[1]。
Rab33a基因表达在结核病患者中下调,主要在CD8+ T细胞中表达。通过定量PCR对结核病患者和健康对照组的外周血单核细胞中选择的Rab分子进行基因表达分析,以确定在宿主免疫反应中发挥关键作用的候选基因。结果显示,Rab13、Rab24和Rab33A的表达存在显著差异。Rab33A基因表达在结核病患者中下调,并且主要在T细胞激活和树突状细胞感染结核分枝杆菌时诱导。这些发现表明Rab33A是结核病中T细胞调节分子,并可能参与疾病过程[2]。
在结直肠癌中,CR-CSC和CRC细胞表达膜锚定的IL30,该分子通过WNT5A和RAB33A调节其自我更新,并通过STAT3上调CXCR4来调节其增殖和迁移。CRISPR/Cas9介导的IL30基因敲除下调了蛋白酶(如MMP2和MMP13)、趋化因子受体(主要是CCR7、CCR3和CXCR4)以及生长和炎症介质(包括ANGPT2、CXCL10、EPO、IGF1和EGF)的表达。这些因素促进了CR-CSC和CRC细胞的扩增,而通过选择性阻断这些因素可以消除这种扩增。敲除IL30基因的CR-CSC表现出肿瘤发生减少,并在80%的小鼠中产生了生长缓慢、低转移的肿瘤,这些小鼠的存活时间比对照组长得多。生物信息和CRC样本的免疫病理学分析显示,CRC和浸润白细胞中缺乏IL30与较长的总生存期相关。IL30是CRC的驱动因素,因为其失活可以抑制癌基因途径和多种自分泌环,从而抑制CR-CSC的肿瘤发生和转移能力。通过CRISPR/Cas9介导的IL30靶向可能改善CRC的当前治疗格局[3]。
在印度南部接种BCG疫苗的儿童中,为了评估有助于诊断结核病感染和疾病的生物标志物,研究了746名疑似结核病的儿童。通过双色逆转录酶多重连接依赖探针扩增检测了210名儿童的整个血液mRNA中45个基因的表达,并通过Bio-Plex分析检测了QuantiFERON上清液中细胞因子/趋化因子的表达。研究发现,与未感染对照组相比,TB疾病中SEC14L1、GUSB、BPI、CCR7和TGFβ-1的转录下调,而与潜伏性TB和对照组相比,TB疾病中RAB33A的转录下调。与未感染对照组相比,潜伏性TB中CD4、TGFβ-1(P<0.01)和IL-2(P<0.01)和IL-13(P<0.05)的表达上调。使用最小绝对收缩和选择算子模型,RAB33A单独区分TB疾病和潜伏性TB(曲线下面积77.5%),而RAB33A、CXCL10、SEC14L1、FOXP3和TNFRSF1A的组合有效区分TB疾病和对照组(曲线下面积91.7%)。11个生物标志物的组合以适度的判别能力预测潜伏性TB(曲线下面积72.2%)。总的来说,RAB33A是TB疾病的潜在生物标志物,而CD4、TGFβ-1和IL-2、IL-13可以识别儿童中的潜伏性TB[4]。
DDT暴露导致胚胎自发运动的超活性,以及在72 hpf时通过自由幼虫活动测量的颤搐样运动,以及在96 hpf时在明暗转换刺激下的幼虫活动。在120 hpf时,机制检查表明DDT暴露通过MDA形成增加、ATP水平下降以及抗氧化酶基因(sod1和gpx1a)表达下降来增加氧化应激。DDT暴露导致异常神经递质表达,其中DA水平增加,5-HT和NOS水平下降。DDT暴露抑制了与轴突发育(rab33a和nrxn2a)和钾通道(kcnq2和kcnq3)相关的基因表达。这些结果表明,DDT暴露胚胎/幼虫中的超活性和颤搐样运动可能是由与神经元损伤相关的氧化应激引起的[5]。
综上所述,Rab33a是一个在多种生物学过程中发挥重要作用的基因。它在黑色素瘤细胞、T细胞和结直肠癌细胞中下调,表明其在肿瘤发生和免疫反应中的潜在作用。Rab33a的表达下调与结核病和潜伏性TB有关,提示其在结核病诊断中的潜在价值。此外,DDT暴露对胚胎发育和神经行为的影响也与Rab33a的表达下调有关。Rab33a的研究对于深入理解其在不同疾病中的作用机制和潜在治疗价值具有重要意义。
参考文献:
1. Cheng, Elaine, Trombetta, Sergio E, Kovacs, Daniela, Picardo, Mauro, Halaban, Ruth. 2006. Rab33A: characterization, expression, and suppression by epigenetic modification. In The Journal of investigative dermatology, 126, 2257-71. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16810302/
2. Jacobsen, Marc, Repsilber, Dirk, Gutschmidt, Andrea, Ziegler, Andreas, Kaufmann, Stefan H E. 2005. Ras-associated small GTPase 33A, a novel T cell factor, is down-regulated in patients with tuberculosis. In The Journal of infectious diseases, 192, 1211-8. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16136464/
3. D'Antonio, Luigi, Fieni, Cristiano, Ciummo, Stefania Livia, Sorrentino, Carlo, Di Carlo, Emma. . Inactivation of interleukin-30 in colon cancer stem cells via CRISPR/Cas9 genome editing inhibits their oncogenicity and improves host survival. In Journal for immunotherapy of cancer, 11, . doi:10.1136/jitc-2022-006056. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36927528/
4. Dhanasekaran, S, Jenum, S, Stavrum, R, Grewal, H M S, Doherty, T M. 2013. Identification of biomarkers for Mycobacterium tuberculosis infection and disease in BCG-vaccinated young children in Southern India. In Genes and immunity, 14, 356-64. doi:10.1038/gene.2013.26. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23676757/
5. Lou, Yanqi, Lin, Chengyin, Yang, Tianpeng, Huang, Changjiang, Chen, Jiangfei. 2024. DDT exposure induces tremor-like behavior and neurotoxicity in developmental stages of embryonic zebrafish. In Ecotoxicology and environmental safety, 271, 116001. doi:10.1016/j.ecoenv.2024.116001. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38277973/