基因1700006A11Rik是一个在哺乳动物基因组中发现的基因,其功能目前尚不完全清楚。该基因位于小鼠染色体17的A11区域,根据命名规则,Rik代表该基因是在小鼠基因敲除项目中通过插入一个报告基因而发现的基因。基因1700006A11Rik的表达模式和功能研究较少,但根据已有的研究,我们可以推测其在生物体内的潜在作用。
基因复制和基因丢失是动物基因组进化中的常见事件,这些动态过程之间的平衡导致了不同物种之间基因数量的主要差异。在基因复制后,通常两个子代基因会以大约相同的速度积累序列变化。然而,在某些情况下,序列变化的积累非常不均匀,一个副本会与它的同源基因发生显著分化。这种“非对称进化”在串联基因复制后比全基因组复制后更常见,并且可以产生新的基因。例如,在蛾类、软体动物和哺乳动物中,非对称进化导致了新的同源异形基因的产生,这些基因被招募到新的发育作用中[1]。
乳腺癌是一种异质性疾病,大多数乳腺癌病例(约70%)被认为是散发的。家族性乳腺癌(约30%的患者)通常发生在乳腺癌发病率高的家庭中,与多种高、中、低渗透率的易感基因相关。家族连锁研究已经确定了高渗透率基因BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53,这些基因负责遗传综合征。此外,基于家庭和人口的方法表明,参与DNA修复的基因,如CHEK2、ATM、BRIP1(FANCJ)、PALB2(FANCN)和RAD51C(FANCO),与中等的乳腺癌风险相关。乳腺癌的全基因组关联研究(GWAS)揭示了许多与乳腺癌风险略微升高或降低的常见低渗透率等位基因。目前,只有高渗透率基因在临床实践中得到广泛应用。随着下一代测序技术的发展,预计所有家族性乳腺癌基因都将被纳入基因检测。然而,在全面实施多基因面板测试到临床工作流程之前,还需要对中度和低风险变异的临床管理进行更多研究[2]。
工程基因回路是后基因组研究的核心焦点之一,旨在理解细胞现象如何从基因和蛋白质的连通性中产生。这种连通性产生分子网络图,类似于复杂的电子电路,需要开发一个数学框架来描述电路。从工程的角度来看,通往这样一个框架的自然途径是构建和分析构成网络的基本模块。近年来,在测序和基因工程方面的实验进展使得通过设计和实施易于数学建模和定量分析的合成基因网络来使这种方法可行。这些发展标志着基因回路学科的兴起,该学科为预测和评估细胞过程的动态提供了一个框架。合成基因网络还将导致细胞控制的新逻辑形式,这可能对功能基因组学、纳米技术和基因与细胞治疗具有重要意义[3]。
基因敲除产生一个完全的失活基因型,是研究基因功能的一种常用方法。基因敲除最严重的表型后果是致死性。具有致死性敲除表型的基因被称为必需基因。基于酵母的全基因组敲除分析表明,基因组中大约有四分之一的基因可能是必需的。与其他基因型-表型关系一样,基因必需性受背景效应的影响,并且由于基因-基因相互作用而可能发生变化。特别是,对于某些必需基因,由敲除引起的致死性可以通过外基因抑制因子得到拯救。这种“必需性旁路”(BOE)基因-基因相互作用是一种被低估的遗传抑制类型。最近的一项系统性分析表明,令人惊讶的是,裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中近30%的必需基因的必需性可以通过BOE相互作用得到旁路[4]。
综上所述,基因1700006A11Rik是一个在哺乳动物基因组中发现的基因,其功能目前尚不完全清楚。该基因可能参与了细胞内复杂的基因调控网络,并可能在发育、疾病发生和细胞功能中发挥作用。随着基因工程和测序技术的进步,我们对基因1700006A11Rik的功能和作用机制的理解将不断深入,这将为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/