智鼠故事 
C57BL/6JCya-6030498E09Rikem1/Cya 基因敲除小鼠
复苏/繁育服务
产品名称：
6030498E09Rik-KO
产品编号：
S-KO-15105
品系背景：
C57BL/6JCya
* 使用本品系发表的文献需注明：6030498E09Rik-KO mice (Strain S-KO-15105) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
只
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-6030498E09Rikem1/Cya
品系编号
KOCMP-77883-6030498E09Rik-B6J-VA
产品编号
S-KO-15105
基因名
6030498E09Rik
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
--
NCBI号
修饰方式
全身性基因敲除
更多信息
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
在研小鼠
环境标准
SPF
供应地区
中国
品系详情
6030498E09Rik位于小鼠的X号染色体，采用基因编辑技术，通过应用高通量电转受精卵方式，获得6030498E09Rik基因敲除小鼠，性成熟后取精子冻存。
6030498E09Rik-KO小鼠模型是由赛业生物（Cyagen）采用基因编辑技术构建的全基因组敲除小鼠。该小鼠模型中，6030498E09Rik基因位于小鼠X号染色体上，由四个外显子组成，其中ATG起始密码子在2号外显子，TGA终止密码子在3号外显子。赛业生物（Cyagen）的研究人员选择2号外显子至3号外显子作为敲除区域，该区域覆盖了100%的编码序列，有效敲除区域大小约为1469 bp。敲除区域的选择基于现有的数据库中的遗传信息，但考虑到生物过程的复杂性，目前技术条件下无法完全预测RNA剪接和蛋白质翻译的风险。构建过程中，赛业生物（Cyagen）将核糖核蛋白（RNP）和靶向载体共同注入受精卵，生成6030498E09Rik基因敲除小鼠。出生的小鼠通过PCR和测序分析进行基因型鉴定，确保敲除区域的精确性。6030498E09Rik-KO小鼠模型可用于研究6030498E09Rik基因在小鼠体内的功能。
基因研究概述
基因6030498E09Rik，也称为Rik6030498E09，是一个在哺乳动物基因组中发现的基因。该基因的具体功能和表达模式尚不完全清楚，但根据基因命名规则，E09Rik可能表示它是一个在实验中通过表达序列标签（EST）技术发现的基因，其序列与已知基因的相似性较低，因此其功能可能未被完全阐明。Rik则表明它是通过鼠基因组信息学研究（RIKEN Mouse Genome Encyclopedia Project）发现的基因，可能与老鼠的某种生物学过程相关。
基因的复制和丢失是动物基因组进化中的常见事件，这种动态过程对物种间基因数量的差异有着重要影响。在某些情况下，基因复制后的两个副本在序列变化上并不均衡，其中一个副本会与另一个副本显著不同。这种现象称为非对称进化，在串联基因复制后比全基因组复制后更为常见，并可能产生具有全新功能的基因。例如，在蛾、软体动物和哺乳动物中，非对称进化产生了新的同源框基因，这些基因被招募到新的发育角色中[1]。
乳腺癌是一种异质性疾病，大多数病例（约70%）被认为是散发的。家族性乳腺癌（约30%的患者）通常出现在乳腺癌发病率高的家庭中，与多种高、中、低渗透率的易感基因有关。家族连锁研究已经确定了高渗透率基因，如BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53，它们负责遗传综合征。此外，结合家族和群体方法表明，参与DNA修复的基因，如CHEK2、ATM、BRIP1（FANCJ）、PALB2（FANCN）和RAD51C（FANCO），与中度的乳腺癌风险相关。全基因组关联研究（GWAS）在乳腺癌中揭示了与略微增加或减少乳腺癌风险的常见低渗透率等位基因。目前，仅在临床实践中广泛使用高渗透率基因。随着下一代测序技术的发展，预计所有家族性乳腺癌基因都将被纳入遗传测试。然而，在将多基因面板测试完全纳入临床工作流程之前，需要对中度和低风险变异的临床管理进行额外研究[2]。
基因调控网络是细胞内基因和蛋白质之间连接的复杂网络，类似于复杂的电路。了解这些网络是如何产生细胞现象的，需要开发一个描述电路的数学框架。从工程学的角度来看，构建和分析构成网络的子模块是通往这一框架的自然途径。近年来，在测序和基因工程方面的实验进展使得通过设计和实施可进行数学建模和定量分析的合成基因网络来实现这一途径成为可能。这些发展标志着基因电路学科的兴起，该学科为预测和评估细胞过程的动力学提供了一个框架。合成基因网络也将导致细胞控制的新逻辑形式，这可能对功能基因组学、纳米技术和基因和细胞治疗有重要应用[3]。
理解基因型-表型关系是生物学中的核心追求。基因敲除产生完全的失活基因型，是探测基因功能的一种常用方法。基因敲除的最严重表型后果是致死性。具有致死性敲除表型的基因称为必需基因。基于酵母的全基因组敲除分析表明，基因组中大约四分之一的基因可能是必需的。与其他基因型-表型关系一样，基因的必需性受背景效应影响，并可能因基因-基因相互作用而变化。特别是，对于某些必需基因，由敲除引起的致死性可以通过非基因抑制因子得到挽救。这种“必需性绕过”（BOE）基因-基因相互作用是一种被忽视的遗传抑制类型。最近的一项系统分析发现，在裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中，近30%的必需基因的必需性可以通过BOE相互作用绕过。在这里，我回顾了发现和理解必需性绕过的历史和最近进展[4]。
基因片段可能是指在基因序列中的一部分，这些片段可能具有特定的生物学功能。基因片段的研究有助于理解基因的结构和功能，以及它们在生物体内的作用[5]。
植物的抗病性基因参与植物防御反应。这些基因在植物抵御病原体入侵方面起着重要作用。了解这些基因的功能和表达模式对于提高植物的抗病性具有重要意义[6]。
MHC基因的表达调节是一个复杂的过程，涉及多种转录因子的相互作用。这些转录因子与MHC类I和II启动子相互作用，影响MHC基因的表达水平。研究MHC基因表达的调节机制有助于理解免疫系统的工作原理，并为开发新的免疫治疗方法提供基础[7]。
基因的定义是指能够编码蛋白质或RNA的DNA序列。基因是生物遗传信息的基本单位，对生物体的生长、发育和功能起着重要作用。随着基因研究技术的不断发展，对基因的定义和理解也在不断深入[8]。
在角质形成细胞中，基因转移技术已被用于研究基因功能和调控。这些技术对于研究表皮和粘膜生物学具有重要意义，因为它们可以用于研究原代角质形成细胞在体外产生的组织结构。基因转移技术在研究基因功能和调控方面发挥着重要作用[9]。
综上所述，基因6030498E09Rik是一个在哺乳动物基因组中发现的基因，其功能和表达模式尚不完全清楚。然而，基因的复制、丢失和进化过程以及基因调控网络的研究为理解基因的功能和表达提供了重要线索。此外，基因敲除、基因片段、植物抗病性基因、MHC基因表达调节、基因的定义和基因转移技术等研究也为深入理解基因的功能和表达提供了重要信息。
参考文献：
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/
5. Mateles, R I. . Gene fragments. In Bio/technology (Nature Publishing Company), 10, 456. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/1368495/
6. Hammond-Kosack, K E, Jones, J D. . Resistance gene-dependent plant defense responses. In The Plant cell, 8, 1773-91. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8914325/
7. Ting, J P, Baldwin, A S. . Regulation of MHC gene expression. In Current opinion in immunology, 5, 8-16. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8452678/
8. Epp, C D. . Definition of a gene. In Nature, 389, 537. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9335484/
9. Fenjves, E S. . Approaches to gene transfer in keratinocytes. In The Journal of investigative dermatology, 103, 70S-75S. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/7963688/
