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Vsir-KO 基因敲除小鼠
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基本信息
基因研究概述
质控标准
基因
基因全称
V-set immunoregulatory receptor
基因别称
4632428N05Rik，Dies1，PD-1H，VISTA
染色体号
Chr 10 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_028732 | Ensembl: ENSMUST00000020301
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~3
敲除长度
~2.4 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1921298Mice homozygous for a knock-out allele exhibit increased leukocyte infiltration and T cell activation.
VSIR，也称为V-domain Ig suppressor of T cell activation（VISTA），是一种重要的免疫检查点基因。VSIR编码的蛋白质属于免疫球蛋白超家族，在免疫调节中发挥关键作用，特别是在肿瘤免疫中。VSIR通过抑制T细胞活化，调节免疫应答，从而在肿瘤免疫逃避中发挥作用。近年来，VSIR在肿瘤发生发展、预后和免疫治疗中的应用价值受到了广泛关注。
VSIR在急性髓系白血病（AML）和骨髓增生异常综合征（MDS）中的预后价值存在争议。研究表明，VSIR在AML肿瘤样本和细胞系中的表达水平最高，且AML患者中VSIR高表达与生存期显著缩短相关。此外，VSIR表达水平还可以预测MDS患者向AML的进展，表明其可能在AML的早期发生和发展中发挥作用[1]。此外，VSIR在其他癌症类型中也表现出预后价值，如多发性骨髓瘤和间皮瘤[1]。
VSIR在皮肤免疫中也发挥着重要作用。研究表明，Vsir基因敲除小鼠表现出加剧的类似银屑病的皮肤炎症。通过单细胞RNA测序分析，研究人员发现皮肤中主要免疫细胞亚群包括巨噬细胞、树突状细胞和成纤维细胞。巨噬细胞是Vsir基因敲除小鼠皮肤中的主要免疫细胞群体。进一步分析发现，Vsir基因敲除小鼠皮肤中Hspb1和Cebpb基因表达上调。这些发现揭示了Vsir基因敲除小鼠皮肤免疫细胞在银屑病中的转录组景观和表型异质性，为研究VISTA在银屑病中的作用提供了新的思路[2]。
在脑转移瘤微环境中，中枢神经系统固有髓系细胞（CNS-myeloids）通过Cxcl10介导免疫抑制，促进脑转移瘤的生长。研究表明，CNS-myeloid细胞中Cx3cr1基因的缺失会导致Cxcl10上调，从而增强免疫抑制，促进脑转移瘤的发生。阻断Cxcl10可以减少脑转移瘤，而rCxcl10可以增加脑转移瘤并招募VISTAHi PD-L1+ CNS-myeloid细胞到脑转移瘤病变处。抑制VISTA和PD-L1信号传导可以缓解免疫抑制并减少脑转移瘤负担[3]。
STAT3信号通路在AML中发挥重要作用。研究表明，高表达VSIR与AML患者的不良预后相关。阻断VSIR可以增强T细胞介导的AML细胞毒性。进一步研究发现，高表达VSIR与STAT3信号通路活跃相关。STAT3作为转录因子，直接结合到VSIR基因的DNA响应元件上，调节VSIR的表达。开发了一种选择性STAT3抑制剂W1046，该抑制剂可以显著抑制AML细胞的增殖和存活。W1046通过抑制STAT3信号传导和下调VSIR，增强T细胞活化，从而显著提高抗VSIR抗体的疗效。W1046和抗VSIR抗体的联合应用在体外和体内均表现出显著的抗AML效果[4]。
GPX1在AML中发挥重要作用。研究表明，AML患者中GPX1高表达与不良预后相关。GPX1表达水平与髓系来源抑制细胞（MDSCs）、单核细胞和T细胞耗竭的分数水平相关，与MDSC标记、MDSC促进因子CCR2和免疫抑制检查点（TIM3/Gal-9、SIRPα和VISTA）的表达水平相关，与CD4+和CD8+ T细胞的分数水平呈负相关。沉默GPX1表达可以降低AML细胞活力和CCR2表达。GPX1相关的预后特征（GPS）是一个独立的危险因素，具有较高的ROC曲线下面积（AUC）值。高风险组富含内吞作用，将线粒体转移到AML细胞中，以应对化疗，以及NOTCH、WNT和TLR信号通路，这些信号通路促进治疗耐药性[5]。
VSIR在多种癌症类型中的表达、遗传变异、预后和免疫学特征方面发挥着重要作用。研究表明，VSIR在胆管癌、食管癌、肾细胞癌和肝细胞癌等多种癌症中表达上调，而在其他癌症中表达下调。预后分析表明，VSIR与食管癌和肝细胞癌患者的总生存期（OS）显著相关。VSIR的表达与肿瘤阶段相关，提示其在肿瘤发生发展中的作用。启动子甲基化分析表明，肿瘤中VSIR的甲基化水平降低，表明其可能在肿瘤发生中发挥作用。此外，VSIR的表达与多种免疫细胞相关，提示其在免疫调节中的作用。蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络构建和基因富集分析揭示了VSIR相关的失调通路，强调其在多种通路中的可能作用[6]。
VSIR在胃肠胰腺神经内分泌肿瘤（GEP-NETs）中发挥重要作用。研究表明，GEP-NET肿瘤细胞表达与正常胃肠内分泌细胞分化、命运决定阶段相关的基因和调控元件。肿瘤和淋巴样区室稀疏表达免疫抑制靶点，如程序性细胞死亡蛋白1/程序性死亡配体1（PD-1/PD-L1）轴。然而，原发性和转移性GEP-NETs中浸润的髓系细胞类型富含编码其他免疫检查点的基因，包括VSIR、HAVCR2（TIM3）、LGALS9（Gal-9）和SIGLEC10。这些发现突出了GEP-NET不同解剖亚型细胞景观的转录组异质性，并为未来精准医学治疗提供了潜在途径[7]。
VSIR在炎症性肠病（IBD）中也发挥着重要作用。研究表明，IBD、溃疡性结肠炎（UC）和克罗恩病（CD）相关基因变异会影响五个血浆蛋白（ERAP2、RIPK2、TALDO1、CADM2和RHOC）、三个血浆蛋白（VSIR、HGFAC和CADM2）和两个血浆蛋白（MST1和FLRT3）的丰度。这些蛋白质可能成为未来功能研究和潜在药物靶点的有价值的线索[8]。
VSIR在非小细胞肺癌（NSCLC）中也具有重要作用。研究表明，通过孟德尔随机化分析，确定了七个候选的药物靶点基因，包括VSIR。这些基因的靶向药物在NSCLC中具有显著的疗效和预后价值[9]。
VSIR在多种癌症类型中的表达、遗传变异、预后和免疫学特征方面发挥着重要作用。研究表明，VSIR在多种癌症中表达上调，与不良预后相关。VSIR的表达与肿瘤阶段、启动子甲基化水平、免疫细胞浸润和多种免疫检查点相关。此外，VSIR的表达与多种免疫抑制因子相关，如TIM3、Gal-9、SIRPα和VISTA。这些发现表明，VSIR可能在肿瘤免疫逃避中发挥重要作用。此外，VSIR的表达与多种免疫细胞相关，提示其在免疫调节中的作用。蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络构建和基因富集分析揭示了VSIR相关的失调通路，强调其在多种通路中的可能作用。这些研究结果为VSIR在肿瘤免疫治疗中的应用提供了新的思路和策略[10]。
综上所述，VSIR是一种重要的免疫检查点基因，在肿瘤免疫中发挥关键作用。VSIR在多种癌症类型中的表达、遗传变异、预后和免疫学特征方面发挥着重要作用。VSIR的表达与肿瘤阶段、启动子甲基化水平、免疫细胞浸润和多种免疫检查点相关。此外，VSIR的表达与多种免疫抑制因子相关，如TIM3、Gal-9、SIRPα和VISTA。这些发现表明，VSIR可能在肿瘤免疫逃避中发挥重要作用。此外，VSIR的表达与多种免疫细胞相关，提示其在免疫调节中的作用。蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络构建和基因富集分析揭示了VSIR相关的失调通路，强调其在多种通路中的可能作用。这些研究结果为VSIR在肿瘤免疫治疗中的应用提供了新的思路和策略。
参考文献：
1. Yao, Kevin, Zhou, Emily, Schaafsma, Evelien, Zhang, Baoyi, Cheng, Chao. 2022. Immune checkpoint gene VSIR predicts patient prognosis in acute myeloid leukemia and myelodysplastic syndromes. In Cancer medicine, 12, 5590-5602. doi:10.1002/cam4.5409. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36394080/
2. Qie, Chenxin, Jiang, Jingwei, Liu, Wanmei, Xie, Xiaoxue, Liu, Jun. 2020. Single-cell RNA-Seq reveals the transcriptional landscape and heterogeneity of skin macrophages in Vsir-/- murine psoriasis. In Theranostics, 10, 10483-10497. doi:10.7150/thno.45614. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32929361/
3. Guldner, Ian H, Wang, Qingfei, Yang, Lin, Landreth, Gary E, Zhang, Siyuan. 2020. CNS-Native Myeloid Cells Drive Immune Suppression in the Brain Metastatic Niche through Cxcl10. In Cell, 183, 1234-1248.e25. doi:10.1016/j.cell.2020.09.064. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33113353/
4. Mo, Jianshan, Deng, Lin, Peng, Keren, Wang, Yuanxiang, Zhang, Xiaolei. 2023. Targeting STAT3-VISTA axis to suppress tumor aggression and burden in acute myeloid leukemia. In Journal of hematology & oncology, 16, 15. doi:10.1186/s13045-023-01410-y. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36849939/
5. Zhang, Jian, Peng, Yuhui, He, Yan, Guo, Penxiang, Zhang, Qifang. 2021. GPX1-associated prognostic signature predicts poor survival in patients with acute myeloid leukemia and involves in immunosuppression. In Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease, 1868, 166268. doi:10.1016/j.bbadis.2021.166268. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34536536/
6. Pan, Jun, Mahsud, Ihsanullah, Ul Haq, Moeen, Ullah, Sajid, Jamil, Muhammad. 2024. Comprehensive pan-cancer analysis reveals VSIR as a candidate immunologic, diagnostic, and prognostic biomarker. In American journal of translational research, 16, 1630-1642. doi:10.62347/JMBZ8836. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38883368/
7. Hoffman, Samantha E, Dowrey, Todd W, Villacorta Martin, Carlos, Van Allen, Eliezer M, Murphy, George J. 2023. Intertumoral lineage diversity and immunosuppressive transcriptional programs in well-differentiated gastroenteropancreatic neuroendocrine tumors. In Science advances, 9, eadd9668. doi:10.1126/sciadv.add9668. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37756410/
8. Bai, Zhongyuan, Hao, Jiawei, Chen, Miaoran, Lv, Yongqiang, Li, Feng. 2024. Integrating plasma proteomics with genome-wide association data to identify novel drug targets for inflammatory bowel disease. In Scientific reports, 14, 16251. doi:10.1038/s41598-024-66780-w. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39009667/
9. Feng, Yi, Li, Caichen, Cheng, Bo, Wang, Wei, Liang, Wenhua. 2024. Identifying genetically-supported drug repurposing targets for non-small cell lung cancer through mendelian randomization of the druggable genome. In Translational lung cancer research, 13, 1780-1793. doi:10.21037/tlcr-24-65. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39263038/
10. Nishizaki, D, Kurzrock, R, Miyashita, H, Sicklick, J K, Kato, S. 2024. Viewing the immune checkpoint VISTA: landscape and outcomes across cancers. In ESMO open, 9, 102942. doi:10.1016/j.esmoop.2024.102942. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38503143/
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