智鼠故事 
C57BL/6JCya-Tmcc1em1/Cya 基因敲除小鼠
复苏/繁育服务
产品名称：
Tmcc1-KO
产品编号：
S-KO-09515
品系背景：
C57BL/6JCya
* 使用本品系发表的文献需注明：Tmcc1-KO mice (Strain S-KO-09515) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
只
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-Tmcc1em1/Cya
品系编号
KOCMP-330401-Tmcc1-B6J-VA
产品编号
S-KO-09515
基因名
Tmcc1
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
mKIAA0779；3632431M01Rik
NCBI号
修饰方式
全身性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
在研小鼠
环境标准
SPF
供应地区
中国
品系详情
Tmcc1位于小鼠的6号染色体，采用基因编辑技术，通过应用高通量电转受精卵方式，获得Tmcc1基因敲除小鼠，性成熟后取精子冻存。
Tmcc1-KO小鼠模型由赛业生物（Cyagen）采用基因编辑技术构建。Tmcc1基因位于小鼠6号染色体上，包含6个外显子，其中ATG起始密码子位于3号外显子，TGA终止密码子位于6号外显子。在Tmcc1基因编码区约29.02%的位置，4号外显子被选为基因敲除的目标区域。该外显子涵盖了48.02%的编码区，有效敲除区域约为935个碱基对。小鼠模型的构建过程包括将基因编辑工具与靶向载体共同注入受精卵。随后，对出生的小鼠进行PCR和测序分析进行基因型鉴定。携带Tmcc1基因敲除等位基因的小鼠可用于研究Tmcc1基因在小鼠体内的功能。
基因研究概述
TMCC1，也称为跨膜和卷曲螺旋结构域家族1，是一种定位于内质网（ER）的蛋白质。内质网是存在于真核细胞中的连续膜网络，包括核包膜、粗面内质网和平滑内质网，具有多种关键功能。TMCC1蛋白家族至少包含3种假定的蛋白质（TMCC1-3），从线虫到人类中均有保守存在。研究表明，TMCC1是一种在多种人类细胞系中表达的ER蛋白，包含2个相邻的跨膜结构域和卷曲螺旋结构域。TMCC1通过其跨膜结构域被靶向定位到粗面内质网，而其N端区域和C端尾部则位于细胞质中。此外，TMCC1的细胞质区域可以与TMCC家族的其他蛋白质形成同源或异源二聚体或多聚体，并与核糖体蛋白相互作用。值得注意的是，过表达TMCC1或其跨膜结构域会导致内质网形态缺陷，表明TMCC1在内质网组织中发挥作用[1]。
TMCC1除了在内质网组织中发挥作用外，还与神经系统疾病有关。研究表明，在肝性脑病诱导的神经病理生理学疾病中，环形RNA Tmcc1（cirTmcc1）在胆管结扎（BDL）小鼠模型的大脑皮层中特异性表达。通过转录和细胞分析，研究人员发现cirTmcc1与NF-κB p65-CREB转录复合物结合，并调节与细胞内代谢和星形胶质细胞功能相关的基因的表达。进一步研究表明，cirTmcc1通过介导神经突触可塑性，改善星形胶质细胞中促炎介质的分泌和谷氨酸代谢，从而提高空间记忆力。因此，cirTmcc1可能是针对肝性脑病引起的神经病理生理学并发症进行预防和治疗的潜在环形RNA候选物[2]。
此外，TMCC1还与肝癌的发生发展相关。一项研究表明，M2巨噬细胞在促进肿瘤血管生成、增殖、化疗耐药和转移中发挥重要作用。然而，M2巨噬细胞在肝癌进展中的具体作用及其对临床预后的影响仍需进一步阐明。研究人员筛选了与M2巨噬细胞相关的基因，并构建了一个四基因预后模型，发现高风险组表现出更高的增殖、侵袭能力、微卫星不稳定性（MSI）和干细胞特性。此外，高风险亚组对化疗药物（如索拉非尼、阿霉素、顺铂和丝裂霉素）和免疫检查点抑制剂（ICI）治疗的敏感性更高。在体外实验中，TMCC1的表达水平被发现可以增强HepG2细胞的迁移能力，通过激活Wnt信号通路发挥作用[3]。
TMCC1还与RNA的m6A修饰有关。一项研究表明，长非编码RNA（lncRNA）在肝癌的发生发展中起着重要作用。研究人员构建了一个包含三个lncRNA（AL355574.1、AL158166.1、TMCC1-AS1）的预后特征，该模型在训练组和测试组中均表现出良好的预后预测能力。此外，在Huh7和HepG2细胞中，AL355574.1的敲低抑制了细胞增殖和迁移，降低了MMP-2、MMP-9、N-钙粘蛋白和Akt/mTOR磷酸化蛋白的表达水平，但提高了E-钙粘蛋白的表达水平[4]。
此外，TMCC1还与细胞死亡相关。一项研究表明，铜依赖性细胞死亡（cuproptosis）是一种新的细胞死亡方式，不同于凋亡。研究人员发现，在肝癌中，与cuproptosis相关的长非编码RNA（CRLncRNA）在疾病的发生发展和预后中起着重要作用。通过分析肝癌病例的基因转录组和临床数据，研究人员建立了一个包含六个cuproptosis-related lncRNAs的预后模型，该模型在训练组和验证组中均表现出优异的预后准确性。此外，肿瘤突变负荷、免疫功能、基因本体（GO）、京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析以及药物敏感性分析进一步阐明了cuproptosis-associated lncRNAs可能影响疾病预后的潜在机制[5]。
TMCC1还与内质网应激相关。一项研究表明，内质网应激相关的基因（ERSRGs）在肝癌中与不良预后相关。研究人员构建了一个包含四个ERSRGs（PON1、AGR2、SSR2、TMCC1）的预后风险模型，该模型可以准确预测肝癌患者的生存结果。此外，20例新鲜冷冻的肝癌和正常组织被收集用于验证模型中的基因表达。研究还发现，内质网应激相关的特征可以反映肿瘤微环境（TME）中不同免疫细胞的浸润水平，并预测免疫检查点抑制剂（ICI）治疗的疗效[6]。
综上所述，TMCC1是一种定位于内质网的蛋白质，在多种生物学过程中发挥作用，包括内质网组织、神经系统疾病、肝癌的发生发展、RNA的m6A修饰以及细胞死亡。TMCC1的研究有助于深入理解内质网应激、神经系统疾病、肝癌、RNA修饰和细胞死亡的生物学功能和疾病发生机制，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献：
1. Zhang, Chao, Kho, Yik-Shing, Wang, Zhe, Wang, Yuzhuo, Qi, Robert Z. 2014. Transmembrane and coiled-coil domain family 1 is a novel protein of the endoplasmic reticulum. In PloS one, 9, e85206. doi:10.1371/journal.pone.0085206. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24454821/
2. Jo, Danbi, Lim, Yeong-Hwan, Jung, Yoon Seok, Kim, Young-Kook, Song, Juhyun. 2023. Circular RNA Tmcc1 improves astrocytic glutamate metabolism and spatial memory via NF-κB and CREB signaling in a bile duct ligation mouse model: transcriptional and cellular analyses. In Journal of neuroinflammation, 20, 121. doi:10.1186/s12974-023-02806-w. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37217942/
3. Song, Huangqin, Wang, Xiaoxiao, Zhang, Chao, He, Jiefeng. 2023. Construction of an M2 macrophage-related prognostic model in hepatocellular carcinoma. In Frontiers in oncology, 13, 1170775. doi:10.3389/fonc.2023.1170775. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37409259/
4. Wu, Xingwei, Wang, Shengnan, Wu, Xiaoming, Cheng, Jin, Qi, Zhilin. 2024. Analysis of m6A-related lncRNAs for prognostic and immunotherapeutic response in hepatocellular carcinoma. In Journal of Cancer, 15, 2045-2065. doi:10.7150/jca.92128. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38434979/
5. Raza, Abbas, Diehl, Sean A, Krementsov, Dimitry N, Blankenhorn, Elizabeth P, Teuscher, Cory. 2023. A genetic locus complements resistance to Bordetella pertussis-induced histamine sensitization. In Communications biology, 6, 244. doi:10.1038/s42003-023-04603-w. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36879097/
6. Wei, Mingwei, Lu, Libai, Luo, Zongjiang, Ma, Jiasheng, Wang, Jianchu. 2024. Prognostic analysis of hepatocellular carcinoma based on cuproptosis -associated lncRNAs. In BMC gastroenterology, 24, 142. doi:10.1186/s12876-024-03219-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38654165/
