ABLIM3,也称为Actin binding LIM protein 3,是一种重要的细胞骨架蛋白。LIM结构域蛋白在多种生物学过程中发挥着关键作用,包括胚胎发育、细胞谱系决定和癌症分化。ABLIM3具有四个LIM结构域和一个VHD结构域,这些结构特征使其能够作为连接肌动蛋白细胞骨架和细胞信号通路的桥梁[4]。ABLIM3在脊椎动物中保守存在,其同源序列在小鼠、鱼和青蛙中均有发现。ABLIM3基因位于人类染色体5q32上,由24个外显子组成。在人体中,ABLIM3在心脏、肺、肝脏和大脑/小脑中表达水平最高,同时在多个其他组织中也有较低水平的表达。此外,ABLIM3在胎儿的肝脏、中枢神经系统(CNS)和脊髓中也有表达[4]。
ABLIM3在多种疾病中发挥着重要作用。在神经母细胞瘤(NB)中,ABLIM3的表达水平与肿瘤的转移和预后密切相关。研究表明,ABLIM3的表达水平与NB的转移呈负相关,低表达ABLIM3的患者预后较差[1]。此外,ABLIM3的表达与APC共刺激和Type1 IFN反应相关,低表达ABLIM3的患者对免疫治疗的反应增强。ABLIM3的下调会增加NB细胞的迁移和侵袭能力,这与细胞粘附分子(CAMs)通路的基因富集相关[1]。
在自闭症谱系障碍(ASD)中,ABLIM3的表达水平也与疾病的发病机制相关。研究表明,DYRK1A基因的杂合突变与ASD相关。ABLIM3是DYRK1A的底物,ABLIM3的下调可以恢复DYRK1A功能,改善DYRK1A相关的社会认知障碍[2][3]。
ABLIM3的表达水平也与食管腺癌(EAC)的预后相关。研究发现,ABLIM3的表达水平与EAC患者的总生存期(OS)呈正相关,ABLIM3的表达水平可以作为预测EAC患者预后的潜在因素[5]。
在脊椎动物的进化过程中,ABLIM3基因也发生了变化。研究表明,ABLIM3基因在脊椎动物的形成过程中出现,并且在脊椎动物基因组中经历了氨基酸序列的变异[6]。
ABLIM3的表达水平也与肝毒性相关。研究表明,ABLIM3是肝毒性预测的基因标志物之一,其表达水平可以预测肝毒性[7]。
此外,ABLIM3还与肺部的老化相关。研究发现,ABLIM3的表达水平与HIV相关慢性阻塞性肺病(COPD)患者的肺部老化程度相关,ABLIM3的表达水平可以作为预测HIV相关COPD风险的因素[8]。
综上所述,ABLIM3是一种重要的细胞骨架蛋白,在多种生物学过程中发挥着关键作用。ABLIM3的表达水平与多种疾病的发生、发展和预后相关,包括神经母细胞瘤、自闭症谱系障碍、食管腺癌、肝毒性、肺部的老化等。ABLIM3的研究有助于深入理解细胞骨架蛋白的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献:
1. Gong, Baocheng, Qu, Tongyuan, Zhang, Jiaojiao, Cao, Wenfeng, Zhao, Qiang. 2024. Downregulation of ABLIM3 confers to the metastasis of neuroblastoma via regulating the cell adhesion molecules pathway. In Computational and structural biotechnology journal, 23, 1547-1561. doi:10.1016/j.csbj.2024.04.024. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38645433/
2. Shih, Yu-Tzu, Alipio, Jason Bondoc, Sahay, Amar. . An inhibitory circuit-based enhancer of DYRK1A function reverses Dyrk1a-associated impairment in social recognition. In Neuron, 111, 3084-3101.e5. doi:10.1016/j.neuron.2023.09.009. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37797581/
3. Shih, Yu-Tzu, Alipio, Jason Bondoc, Sahay, Amar. 2023. An inhibitory circuit-based enhancer of Dyrk1a function reverses Dyrk1a -associated impairment in social recognition. In bioRxiv : the preprint server for biology, , . doi:10.1101/2023.02.03.526955. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36778241/
4. Krupp, Markus, Weinmann, Arndt, Galle, Peter R, Teufel, Andreas. . Actin binding LIM protein 3 (abLIM3). In International journal of molecular medicine, 17, 129-33. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16328021/
5. Mao, Yanmei, Zhang, Haibo, He, Xin, Chen, Yanping, Zeng, Ying. 2024. A four-gene signature predicts overall survival of patients with esophageal adenocarcinoma. In Translational cancer research, 13, 1382-1393. doi:10.21037/tcr-23-1798. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38617513/
6. Yang, Zhiyuan, Hu, Fuyan. 2018. Investigation of gene evolution in vertebrate genome reveals novel insights into spine study. In Gene, 679, 360-368. doi:10.1016/j.gene.2018.09.023. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30218752/
7. Smith, Brandi Patrice, Auvil, Loretta Sue, Welge, Michael, Johnson, Kamin, Madak-Erdogan, Zeynep. 2020. Identification of early liver toxicity gene biomarkers using comparative supervised machine learning. In Scientific reports, 10, 19128. doi:10.1038/s41598-020-76129-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33154507/
8. Hernández Cordero, Ana I, Yang, Chen Xi, Yang, Julia, Sin, Don D, Leung, Janice M. . Airway Aging and Methylation Disruptions in HIV-associated Chronic Obstructive Pulmonary Disease. In American journal of respiratory and critical care medicine, 206, 150-160. doi:10.1164/rccm.202106-1440OC. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35426765/