智鼠故事 
C57BL/6JCya-Ythdc1em1/Cya 基因敲除小鼠
复苏/繁育服务
产品名称：
Ythdc1-KO
产品编号：
S-KO-06434
品系背景：
C57BL/6JCya
* 使用本品系发表的文献需注明：Ythdc1-KO mice (Strain S-KO-06434) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
只
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-Ythdc1em1/Cya
品系编号
KOCMP-231386-Ythdc1-B6J-VA
产品编号
S-KO-06434
基因名
Ythdc1
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
mKIAA1966；A730098D12Rik
NCBI号
修饰方式
全身性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
MGI:2443713 Mice homozygous for a null allele die between E8.5 and E11.5. Mice homozygous for a cconditional allele activated after embryonic development exhibit infertility with defects in spermatogenesis and oogenesis associated with RNA granules and altered transcription in oocytes.
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
在研小鼠
环境标准
SPF
供应地区
中国
品系详情
Ythdc1位于小鼠的5号染色体，采用基因编辑技术，通过应用高通量电转受精卵方式，获得Ythdc1基因敲除小鼠，性成熟后取精子冻存。
Ythdc1-KO小鼠模型是由赛业生物（Cyagen）采用基因编辑技术构建的全身性基因敲除小鼠模型。Ythdc1基因位于小鼠5号染色体上，由17个外显子组成，其中ATG起始密码子在1号外显子，TAA终止密码子在11号外显子。敲除区域（KO区域）位于第二至九号外显子，包含1324个碱基对的编码序列。删除该区域会导致小鼠Ythdc1基因功能的丧失。
Ythdc1-KO小鼠模型的构建过程包括将核糖核蛋白（RNP）和靶向载体共同注入受精卵。随后，对出生的小鼠进行PCR和测序分析进行基因型鉴定。实验结果表明，携带敲除等位基因的小鼠表现出胚胎致死性，即在胚胎发育的E8.5至E11.5阶段死亡。因此，赛业生物（Cyagen）建议使用条件性敲除模型，通过交配携带条件性等位基因的小鼠与删除小鼠来获得敲除类型。
Ythdc1-KO小鼠模型可用于研究Ythdc1基因在小鼠体内的功能。该模型可以用于研究RNA剪接和蛋白质翻译等生物过程的复杂性，以及Ythdc1基因在小鼠发育和生殖过程中的作用。通过研究Ythdc1-KO小鼠模型，可以深入了解Ythdc1基因的功能和调控机制，为进一步研究Ythdc1基因相关疾病的发生和发展提供重要的实验工具。
基因研究概述
Ythdc1（YTH domain containing 1）基因编码的蛋白质是一种核内N6-甲基腺苷（m6A）结合蛋白，属于YTH结构域家族的成员。m6A是RNA上最常见的内部修饰之一，广泛存在于真核生物的RNA中，尤其是在高等真核细胞中。m6A修饰由m6A甲基转移酶（writers）如METTL3/14/16等催化生成，并由m6A结合蛋白（readers）如YTHDF1/2/3、YTHDC1/2等识别，最后由脱甲基酶（erasers）如FTO和ALKBH5等去除。m6A修饰在调控RNA的稳定性和功能，影响基因表达和生物学过程中发挥着重要作用[3]。
Ythdc1蛋白在RNA代谢中发挥着多种功能。首先，Ythdc1是一种核内m6A结合蛋白，能够与m6A修饰的RNA结合，影响RNA的稳定性、定位和翻译[1,5]。其次，Ythdc1能够与剪接因子SRSF3（SRp20）结合，促进mRNA的剪接过程，进而影响基因表达[1]。此外，Ythdc1还能够与细胞内的其他蛋白质相互作用，参与调控细胞的生物学过程[7]。
在多种疾病中，Ythdc1蛋白发挥着重要作用。例如，在糖尿病皮肤中，Ythdc1通过靶向SQSTM1/p62（sequestosome 1）调节自噬过程，影响伤口愈合[2]。在神经母细胞瘤中，Ythdc1基因多态性与神经母细胞瘤的易感性相关，并且Ythdc1 siRNA能够抑制神经母细胞瘤细胞的增殖和迁移[4]。在Wilms瘤中，Ythdc1基因多态性与Wilms瘤的易感性相关，Ythdc1的表达水平与Wilms瘤的发生和发展相关[8]。此外，Ythdc1还能够与病毒RNA相互作用，影响病毒的复制和传播[6]。
综上所述，Ythdc1蛋白是一种重要的核内m6A结合蛋白，参与调控RNA的稳定性和功能，影响基因表达和生物学过程。Ythdc1在多种疾病中发挥重要作用，包括糖尿病皮肤、神经母细胞瘤、Wilms瘤等。Ythdc1的研究有助于深入理解m6A修饰的生物学功能和疾病发生机制，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献：
1. Xiao, Wen, Adhikari, Samir, Dahal, Ujwal, Zhao, Yong-Liang, Yang, Yun-Gui. 2016. Nuclear m(6)A Reader YTHDC1 Regulates mRNA Splicing. In Molecular cell, 61, 507-519. doi:10.1016/j.molcel.2016.01.012. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26876937/
2. Liang, Diefei, Lin, Wei-Jye, Ren, Meng, Yan, Li, Wang, Wei. 2021. m6A reader YTHDC1 modulates autophagy by targeting SQSTM1 in diabetic skin. In Autophagy, 18, 1318-1337. doi:10.1080/15548627.2021.1974175. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34657574/
3. Jiang, Xiulin, Liu, Baiyang, Nie, Zhi, Yang, Cuiping, Chen, Yongbin. 2021. The role of m6A modification in the biological functions and diseases. In Signal transduction and targeted therapy, 6, 74. doi:10.1038/s41392-020-00450-x. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33611339/
4. Li, Yong, Lu, Tongyi, Wang, Jian, He, Jing, Li, Aiwu. 2021. YTHDC1 gene polymorphisms and neuroblastoma susceptibility in Chinese children. In Aging, 13, 25426-25439. doi:10.18632/aging.203760. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34897032/
5. Roundtree, Ian A, Luo, Guan-Zheng, Zhang, Zijie, Shen, Bin, He, Chuan. 2017. YTHDC1 mediates nuclear export of N6-methyladenosine methylated mRNAs. In eLife, 6, . doi:10.7554/eLife.31311. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28984244/
6. Liu, Jiadong, Gao, Mingwei, He, Jiangping, Bao, Xichen, Chen, Jiekai. 2021. The RNA m6A reader YTHDC1 silences retrotransposons and guards ES cell identity. In Nature, 591, 322-326. doi:10.1038/s41586-021-03313-9. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33658714/
7. Zhang, Canfeng, Chen, Liping, Xie, Chen, Zhao, Yong, Liu, Haiying. 2023. YTHDC1 delays cellular senescence and pulmonary fibrosis by activating ATR in an m6A-independent manner. In The EMBO journal, 43, 61-86. doi:10.1038/s44318-023-00003-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38177310/
8. Lin, Ao, Hua, Rui-Xi, Zhou, Mingming, Liu, Guochang, He, Jing. 2021. YTHDC1 gene polymorphisms and Wilms tumor susceptibility in Chinese children: A five-center case-control study. In Gene, 783, 145571. doi:10.1016/j.gene.2021.145571. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33737126/
