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C57BL/6NCya-Prpf8em1flox/Cya 条件性基因敲除小鼠
复苏/繁育服务
产品名称:
Prpf8-flox
产品编号:
S-CKO-19849
品系背景:
C57BL/6NCya
小鼠资源库
* 使用本品系发表的文献需注明:Prpf8-flox mice (Strain S-CKO-19849) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
基本信息
品系名称
C57BL/6NCya-Prpf8em1flox/Cya
品系编号
CKOCMP-192159-Prpf8-B6N-VA
产品编号
S-CKO-19849
基因名
Prpf8
品系背景
C57BL/6NCya
基因别称
Prp8;Sfprp8l;DBF3/PRP8;D11Bwg0410e
NCBI号
修饰方式
条件性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
MGI:2179381 Mice that are either heterozygous or homozygous for a knock-in allele exhibit abnormal retinal pigment epithelium morphology and late-onset retinal degeneration. These changes are more severe in homozygous mutant mice.
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
活体
环境标准
SPF
供应地区
中国
品系详情
Prpf8位于小鼠的11号染色体,采用基因编辑技术,通过高通量电转受精卵方式,获得Prpf8基因条件性敲除小鼠,性成熟后取精子冻存。
Prpf8-flox小鼠模型是由赛业生物(Cyagen)采用基因编辑技术构建的条件性敲除小鼠。Prpf8基因位于小鼠11号染色体上,由42个外显子组成,其中ATG起始密码子在1号外显子,TAG终止密码子在42号外显子。条件性敲除区域(cKO区域)位于3至7号外显子,包含829碱基对的编码序列。删除该区域应该会导致小鼠Prpf8基因功能的丧失。为了构建靶向载体,赛业生物(Cyagen)使用BAC克隆RP23-400E4作为模板,通过PCR技术生成同源臂和cKO区域。出生的小鼠将进行PCR和测序分析进行基因型鉴定。 此外,对于携带敲除等位基因的小鼠,其表现出异常的视网膜色素上皮形态和晚发性视网膜变性。这些变化在纯合突变小鼠中更为严重。3至7号外显子涵盖了编码区域的11.83%。第二号内含子中5'-loxP位点的插入大小为1948碱基对,第七号内含子中3'-loxP位点的插入大小为490碱基对。有效的cKO区域大小约为1.8千碱基对。这一策略是基于现有数据库中的遗传信息设计的。由于生物过程的复杂性,目前的技术水平无法预测loxP插入对基因转录、RNA剪接和蛋白质翻译的所有风险。
基因研究概述
PRPF8,也称为前体信使RNA处理因子8,是一种核心的剪接体蛋白,属于U4/U6-U5三小核RNA(snRNP)复合物。剪接体是一个由蛋白质和snRNA组成的巨大分子机器,主要负责从信使RNA(mRNA)前体中去除内含子和连接外显子,这一过程称为剪接。剪接体在维持基因表达的正确性方面发挥着至关重要的作用,因为它决定了细胞中哪些基因会被表达以及以何种方式表达。
PRPF8在剪接体中扮演着重要的结构支架角色,帮助维持剪接体的三维结构,并促进剪接过程中RNA元件的移动。此外,PRPF8还与RNA解旋酶Brr2相互作用,调节其活性,进而影响5'-剪接位点的选择和剪接反应的动力学。这一过程对于确保正确的剪接模式和避免错误剪接至关重要,因为错误的剪接可以导致无功能的或有害的蛋白质产生,从而引发疾病。
PRPF8的表达受到流感病毒的影响。研究表明,流感病毒可以上调PRPF8的表达,从而增强病毒的产生。流感病毒NS1和PB1蛋白的表达能够促进PRPF8的表达,这表明流感病毒可能通过这些蛋白质来调控PRPF8的表达,进而影响病毒复制[1]。此外,PRPF8的表达还与多种人类疾病相关。例如,PRPF8的变异与青光眼有关。研究发现,在患有成年发病的家族性原发性开角型青光眼的家族中,PRPF8基因中存在致病性变异[2]。这些变异主要位于PRPF8的N端,而与视网膜色素变性相关的变异则主要位于C端,这表明PRPF8的变异与疾病表型之间存在明显的基因型-表型相关性。
除了青光眼,PRPF8的变异还与神经发育障碍有关。研究发现,患有各种神经发育障碍的个体中存在PRPF8的杂合性变异,这些变异包括错义变异和功能缺失变异[3]。这些个体表现出多种临床特征,可能代表了一种新的神经发育综合征。此外,PRPF8的过表达与肝细胞癌的侵袭性和生长有关。研究发现,PRPF8在肝细胞癌中过表达,并与其侵袭性和不良预后相关[4]。PRPF8通过调节FN1的剪接,影响整合素的结合,进而激活FAK/AKT信号通路和应力纤维的形成,促进肝细胞癌的侵袭和生长。
PRPF8的表达也与乳腺癌的进展相关。研究发现,PRPF8在乳腺癌组织中的表达显著高于邻近的非癌组织,且PRPF8表达高的患者预后较差[5]。PRPF8的表达与TGF-β、JAK-STAT和细胞周期控制通路相关。沉默PRPF8的表达可以抑制乳腺癌细胞的生长和克隆形成能力,并增加p21的表达。
PRPF8的变异还与原发性纤毛缺陷相关。研究发现,PRPF8、PRPF6和PRPF31基因的突变与原发性纤毛缺陷相关[6]。这些基因的突变导致细胞中的纤毛出现缺陷,进而引发多种疾病,如Joubert综合征和Jeune综合征。此外,PRPF8的缺陷还与骨髓增生性疾病有关。研究发现,PRPF8的突变或缺失与骨髓增生性疾病相关,并影响剪接反应,导致异常的剪接模式[7]。
最后,PRPF8的调控机制还与结直肠癌的发生机制相关。研究发现,一个与多民族相关的剪接定量性状位点(sQTL)rs61746794可以促进PRMT7的外显子16的剪接,从而增加PRMT7-V2的表达水平。PRMT7-V2是一种表观遗传修饰酶,可以催化组蛋白H4R3和H3R2的精氨酸甲基化,进而调节YAP、AKT和KRAS信号通路[8]。
综上所述,PRPF8是一种核心的剪接体蛋白,在维持基因表达的正确性方面发挥着至关重要的作用。PRPF8的表达受到多种因素的调控,包括病毒感染和基因变异。PRPF8的变异与多种人类疾病相关,包括青光眼、神经发育障碍、肝细胞癌、乳腺癌、原发性纤毛缺陷和骨髓增生性疾病。此外,PRPF8的调控机制还与结直肠癌的发生机制相关。因此,深入研究PRPF8的生物学功能和调控机制对于理解基因表达调控的复杂性以及疾病的发生机制具有重要意义。
参考文献:
1. Yang, Chee-Hing, Li, Hui-Chun, Shiu, Yu-Ling, Wu, Cheng-Hao, Lo, Shih-Yen. 2017. Influenza A virus upregulates PRPF8 gene expression to increase virus production. In Archives of virology, 162, 1223-1235. doi:10.1007/s00705-016-3210-3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28110426/
2. Wan, Ruixue, Bai, Rui, Zhan, Xiechao, Shi, Yigong. 2019. How Is Precursor Messenger RNA Spliced by the Spliceosome? In Annual review of biochemistry, 89, 333-358. doi:10.1146/annurev-biochem-013118-111024. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31815536/
3. O'Grady, Lauren, Schrier Vergano, Samantha A, Hoffman, Trevor L, Sweetser, David A, Gold, Nina B. 2022. Heterozygous variants in PRPF8 are associated with neurodevelopmental disorders. In American journal of medical genetics. Part A, 188, 2750-2759. doi:10.1002/ajmg.a.62772. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35543142/
4. López-Cánovas, Juan L, Hermán-Sánchez, Natalia, Del Rio-Moreno, Mercedes, Luque, Raúl M, Gahete, Manuel D. 2023. PRPF8 increases the aggressiveness of hepatocellular carcinoma by regulating FAK/AKT pathway via fibronectin 1 splicing. In Experimental & molecular medicine, 55, 132-142. doi:10.1038/s12276-022-00917-7. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36609600/
5. Cao, Difei, Xue, Jiaying, Huang, Guoqing, An, Jing, An, Weiwei. . The role of splicing factor PRPF8 in breast cancer. In Technology and health care : official journal of the European Society for Engineering and Medicine, 30, 293-301. doi:10.3233/THC-THC228028. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35124606/
6. Wheway, Gabrielle, Schmidts, Miriam, Mans, Dorus A, Roepman, Ronald, Johnson, Colin A. 2015. An siRNA-based functional genomics screen for the identification of regulators of ciliogenesis and ciliopathy genes. In Nature cell biology, 17, 1074-1087. doi:10.1038/ncb3201. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26167768/
7. Kurtovic-Kozaric, A, Przychodzen, B, Singh, J, Maciejewski, J P, Padgett, R A. 2014. PRPF8 defects cause missplicing in myeloid malignancies. In Leukemia, 29, 126-36. doi:10.1038/leu.2014.144. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24781015/
8. Zhang, Ming, Chen, Can, Lu, Zequn, Tian, Jianbo, Miao, Xiaoping. 2023. Genetic Control of Alternative Splicing and its Distinct Role in Colorectal Cancer Mechanisms. In Gastroenterology, 165, 1151-1167. doi:10.1053/j.gastro.2023.07.019. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37541527/