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C57BL/6JCya-Trmoem1flox/Cya 条件性基因敲除小鼠
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产品名称:
Trmo-flox
产品编号:
S-CKO-16103
品系背景:
C57BL/6JCya
小鼠资源库
* 使用本品系发表的文献需注明:Trmo-flox mice (Strain S-CKO-16103) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-Trmoem1flox/Cya
品系编号
CKOCMP-74753-Trmo-B6J-VA
产品编号
S-CKO-16103
基因名
Trmo
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
Nap1;5830415F09Rik
NCBI号
修饰方式
条件性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
活体
环境标准
SPF
供应地区
中国
品系详情
Trmo位于小鼠的4号染色体,采用基因编辑技术,通过高通量电转受精卵方式,获得Trmo基因条件性敲除小鼠,性成熟后取精子冻存。
Trmo-flox小鼠是由赛业生物(Cyagen)采用基因编辑技术构建的条件性敲除小鼠模型。该小鼠模型主要用于研究Trmo基因在小鼠体内的功能。Trmo基因位于小鼠4号染色体上,由6个外显子组成,其中ATG起始密码子在1号外显子,TGA终止密码子在6号外显子。条件性敲除区域(cKO区域)位于2号外显子,包含175个碱基对的编码序列。删除该区域会导致小鼠Trmo基因功能的丧失。该小鼠模型的构建过程包括将核糖核蛋白(RNP)和靶向载体共同注入受精卵。随后,对出生的小鼠进行PCR和测序分析进行基因型鉴定。此外,该小鼠模型可用于研究Trmo基因在小鼠体内的功能。
基因研究概述
TRMO,也称为tRNA (adenine37-N6)-methyltransferase TrmO,是一种重要的RNA N6-甲基腺苷(m6A)甲基转移酶。m6A是一种普遍存在于真核细胞RNA上的表观遗传修饰,参与调控RNA的稳定性和功能,影响基因表达和生物学过程。TRMO与另一个蛋白质Mettl3形成复合物,共同催化m6A的生成。m6A修饰在许多生物学过程中发挥作用,包括细胞分化、发育、代谢和疾病发生[1]。
TRMO在多种疾病中发挥重要作用,包括动脉粥样硬化、糖尿病心肌病、结直肠癌和Wilms瘤。在动脉粥样硬化中,TRMO通过NF-κB/IL-6信号通路介导巨噬细胞的炎症反应,促进动脉粥样硬化斑块的形成[2]。在糖尿病心肌病中,TRMO通过下调lncRNA TINCR抑制焦亡和糖尿病心肌病的发生[3]。在结直肠癌中,TRMO通过m6A修饰抑制SOX4 mRNA的表达,从而抑制肿瘤的转移[4]。此外,TRMO的基因多态性与中国儿童Wilms瘤的易感性降低相关[5]。
高风险神经母细胞瘤(NB)患者中,TRMO表达显著上调,与不良预后有强相关性。TRMO通过m6A-YTHDF1依赖机制抑制YWHAH表达,激活PI3K/AKT信号通路,促进NB细胞活性[6]。TRMO通过促进PRC2和KDM5B在二价结构域上的结合,影响组蛋白修饰,进而调控二价结构基因的表达[7]
TRMO不仅在RNA修饰中发挥作用,还具有独立的染色质调控功能。TRMO可以与H3K27me3结合,招募KDM6B诱导H3K27me3的去甲基化,从而影响基因表达和干细胞的多能性维持[8]。此外,TRMO还可以通过下调lncRNA XIST的表达抑制结直肠癌的增殖和转移[9]。
综上所述,TRMO是一种重要的RNA甲基转移酶,参与调控RNA的稳定性和功能,影响基因表达和生物学过程。TRMO在多种疾病中发挥重要作用,包括动脉粥样硬化、糖尿病心肌病、结直肠癌和Wilms瘤。此外,TRMO还具有独立的染色质调控功能,影响基因表达和干细胞的多能性维持。TRMO的研究有助于深入理解RNA表观遗传修饰的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献:
1. Kulkarni, Om, Sugier, Pierre-Emmanuel, Guibon, Julie, Truong, Thérèse, Lesueur, Fabienne. 2021. Gene network and biological pathways associated with susceptibility to differentiated thyroid carcinoma. In Scientific reports, 11, 8932. doi:10.1038/s41598-021-88253-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33903625/
2. Shimada, Miho, Chen, Wei-Yi, Nakadai, Tomoyoshi, Rhodes, Daniela, Roeder, Robert G. 2019. Gene-Specific H1 Eviction through a Transcriptional Activator→p300→NAP1→H1 Pathway. In Molecular cell, 74, 268-283.e5. doi:10.1016/j.molcel.2019.02.016. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30902546/
3. Masum, Md Habib Ullah, Rajia, Sultana, Bristi, Uditi Paul, Rahaman, Md Mizanur, Saha, Otun. 2023. In Silico Functional Characterization of a Hypothetical Protein From Pasteurella Multocida Reveals a Novel S-Adenosylmethionine-Dependent Methyltransferase Activity. In Bioinformatics and biology insights, 17, 11779322231184024. doi:10.1177/11779322231184024. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37424709/
4. Huynh, Mai T, Yadav, Satya P, Reese, Joseph C, Lee, Tae-Hee. 2020. Nucleosome Dynamics during Transcription Elongation. In ACS chemical biology, 15, 3133-3142. doi:10.1021/acschembio.0c00617. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33263994/
5. Kimura, Satoshi, Miyauchi, Kenjyo, Ikeuchi, Yoshiho, Crécy-Lagard, Valérie de, Suzuki, Tsutomu. 2014. Discovery of the β-barrel-type RNA methyltransferase responsible for N6-methylation of N6-threonylcarbamoyladenosine in tRNAs. In Nucleic acids research, 42, 9350-65. doi:10.1093/nar/gku618. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25063302/
6. Neumann, Lisa C, Feiner, Nathalie, Meyer, Axel, Buiting, Karin, Horsthemke, Bernhard. . The imprinted NPAP1 gene in the Prader-Willi syndrome region belongs to a POM121-related family of retrogenes. In Genome biology and evolution, 6, 344-51. doi:10.1093/gbe/evu019. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24482533/
7. Goncalves, Adriana, Bürckstümmer, Tilmann, Dixit, Evelyn, Colinge, Jacques, Superti-Furga, Giulio. 2011. Functional dissection of the TBK1 molecular network. In PloS one, 6, e23971. doi:10.1371/journal.pone.0023971. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21931631/
8. Fang, Lian, Chen, Lin, Lin, Bi, Zhu, Kaiquan, Song, Qifa. 2020. Analysis of Inflammatory and Homeostatic Roles of Tissue-resident Macrophages in the Progression of Cholesteatoma by RNA-Seq. In Immunological investigations, 50, 609-621. doi:10.1080/08820139.2020.1781161. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32573304/
9. Machida, Shinichi, Takaku, Motoki, Ikura, Masae, Ikura, Tsuyoshi, Kurumizaka, Hitoshi. 2014. Nap1 stimulates homologous recombination by RAD51 and RAD54 in higher-ordered chromatin containing histone H1. In Scientific reports, 4, 4863. doi:10.1038/srep04863. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24798879/
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