智鼠故事 
C57BL/6JCya-Nipsnap3aem1flox/Cya 条件性基因敲除小鼠
复苏/繁育服务
产品名称：
Nipsnap3a-flox
产品编号：
S-CKO-15688
品系背景：
C57BL/6JCya
* 使用本品系发表的文献需注明：Nipsnap3a-flox mice (Strain S-CKO-15688) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
只
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-Nipsnap3aem1flox/Cya
品系编号
CKOCMP-73398-Nipsnap3a-B6J-VA
产品编号
S-CKO-15688
基因名
Nipsnap3a
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
1700054F22Rik
NCBI号
修饰方式
条件性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
活体
环境标准
SPF
供应地区
中国
品系详情
Nipsnap3a位于小鼠的4号染色体，采用基因编辑技术，通过高通量电转受精卵方式，获得Nipsnap3a基因条件性敲除小鼠，性成熟后取精子冻存。
Nipsnap3a-flox小鼠模型由赛业生物（Cyagen）采用基因编辑技术构建。该模型中，Nipsnap3a基因位于小鼠4号染色体上，由7个外显子组成，其中ATG起始密码子在1号外显子，TAG终止密码子在6号外显子。条件性敲除区域（cKO区域）位于2号外显子，包含211个碱基对的编码序列。删除该区域会导致小鼠Nipsnap3a基因功能的丧失。Nipsnap3a-flox小鼠模型的构建过程包括将核糖核蛋白（RNP）和靶向载体共同注入受精卵。随后，对出生的小鼠进行PCR和测序分析进行基因型鉴定。此外，该模型中5'-loxP位点的插入位于1号内含子，3'-loxP位点的插入位于2号内含子，cKO区域的有效大小约为1.3 kb。该策略是基于现有数据库中的遗传信息设计的。由于生物过程的复杂性，loxP插入对基因转录、RNA剪接和蛋白质翻译的影响无法在现有技术水平上预测。Nipsnap3a-flox小鼠模型可用于研究Nipsnap3a基因在小鼠体内的功能。
基因研究概述
NIPSNAP3A，全称为Nuclear Interacting Protein with SNARE Motifs 3A，是一种主要定位于线粒体基质中的蛋白质。NIPSNAP家族的蛋白质在细胞代谢和生存中发挥着重要作用，因为它们参与细胞增殖、凋亡等关键过程。NIPSNAP3A在维持细胞稳态方面具有重要作用，主要通过调节线粒体动力学来协调细胞过程。研究发现，NIPSNAP3A的敲低可以抑制HeLa细胞的增殖和迁移，并减弱Actinomycin D (Act-D)诱导的凋亡。这表明NIPSNAP3A在细胞过程中与线粒体功能之间存在着复杂的相互作用[1]。
此外，NIPSNAP3A的敲低不仅通过降低DRP1-S616抑制线粒体分裂，而且还通过抑制细胞凋亡中的细胞色素c释放。这些发现强调了NIPSNAP3A在协调细胞过程中的关键作用，这很可能是通过其对线粒体动力学的影响来实现的。NIPSNAP3A的这些功能表明它在维持细胞稳态和调节线粒体功能方面发挥着重要作用[1]。
在大型全基因组测序研究中，多性状罕见变异分析可以提高统计功效，并检测多效性基因和区域。研究表明，NIPSNAP3A在大型全基因组测序研究中的多性状罕见变异分析中具有重要意义。通过多性状分析，发现了一些罕见变异，包括NIPSNAP3A增强子区域和染色体1上的一个基因间区域，这些变异在单一性状分析中可能被忽略[2]。
线粒体是细胞能量代谢和细胞生存的关键器官，它们产生细胞ATP的主要部分，并通过氧化磷酸化调节细胞增殖和凋亡等关键过程。NIPSNAP家族的蛋白质是线粒体基质蛋白，但NIPSNAP3A等NIPSNAPs的分子和细胞功能尚不清楚。研究发现，NIPSNAP3A的敲低可以抑制HeLa细胞的增殖和迁移，并减弱Actinomycin D (Act-D)诱导的凋亡。这些发现表明NIPSNAP3A在细胞过程中与线粒体功能之间存在着复杂的相互作用，并且可能通过影响线粒体动力学来协调细胞过程[1]。
此外，NIPSNAP3A的敲低不仅通过降低DRP1-S616抑制线粒体分裂，而且还通过抑制细胞凋亡中的细胞色素c释放。这些发现强调了NIPSNAP3A在协调细胞过程中的关键作用，这很可能是通过其对线粒体动力学的影响来实现的[1]。
牙周炎是一种由免疫系统功能障碍引起的慢性炎症性疾病。线粒体外泌体（MitoEVs）是一组高度异质性的细胞外囊泡，富含线粒体成分。研究表明，MitoEVs与牙周炎的免疫微环境密切相关。通过分析MitoCarta 3.0、GeneCards和GEO数据库的数据，共发现了44个差异表达的MitoEV相关基因（MERGs）。随机森林和LASSO算法识别了9个核心MERGs，包括NIPSNAP3A。免疫浸润和共识聚类分析表明，核心MERGs与各种免疫细胞高度相关，不同牙周炎亚型中免疫细胞和核心MERGs之间存在显著差异。这些发现表明，MitoEVs在牙周炎的免疫微环境中发挥着重要的调节作用，而NIPSNAP3A作为核心MERGs之一，可能参与其中[3]。
前列腺的发育和维持依赖于雄激素和雄激素受体。雄激素途径在前列腺癌中仍然很重要。研究发现，通过测序LongSAGE库评估了前列腺癌细胞对雄激素的反应。在雄激素处理后，有131个标签（87个基因）的表达发生了显著差异。其中，NIPSNAP3A是24个新发现的雄激素反应基因之一。这些基因参与蛋白质合成和转运、对氧化应激的反应、转录、增殖、凋亡和分化等过程，可能代表前列腺对雄激素依赖性的分子机制[4]。
NIPSNAP3和NIPSNAP4是高度同源的蛋白质，编码基因与ATP结合盒转运蛋白A1（ABCA1）基因紧密相邻。NIPSNAP3和NIPSNAP4在多种组织和细胞中以不同的程度表达。有趣的是，NIPSNAP3在骨骼肌中的表达最高，而NIPSNAP4的mRNA丰度较低。NIPSNAP4与细胞膜相关，并部分定位于脂筏。NIPSNAP3和NIPSNAP4的广泛表达和与细胞膜的关联进一步支持了这些蛋白质在细胞中的重要作用，可能与囊泡转运相关。NIPSNAP3和NIPSNAP4基因位于ABCA1基因的3'端附近，ABCA1基因的突变会导致家族性高密度脂蛋白缺乏症。相邻的基因组位置以及ABCA1是囊泡转运的调节因子的事实可能表明这些蛋白质之间存在功能关系，尽管NIPSNAP4不与ABCA1直接相互作用，并且其表达在ABCA1突变的细胞中并未改变[5]。
综上所述，NIPSNAP3A是一种重要的蛋白质，在细胞代谢和生存中发挥着重要作用。NIPSNAP3A通过调节线粒体动力学来协调细胞过程，并参与细胞增殖、凋亡等关键过程。此外，NIPSNAP3A还与牙周炎的免疫微环境以及前列腺癌的发生发展相关。进一步的研究可以阐明NIPSNAP3A在细胞过程中的功能和机制，以及其在疾病发生发展中的作用，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献：
1. Yan, Run, Chen, Liting, Cai, Zimu, Ruan, Yu, Han, Qi. 2024. NIPSNAP3A regulates cellular homeostasis by modulating mitochondrial dynamics. In Gene, 933, 148976. doi:10.1016/j.gene.2024.148976. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39362349/
2. Li, Xihao, Chen, Han, Selvaraj, Margaret Sunitha, Liu, Zhonghua, Lin, Xihong. 2023. A statistical framework for powerful multi-trait rare variant analysis in large-scale whole-genome sequencing studies. In bioRxiv : the preprint server for biology, , . doi:10.1101/2023.10.30.564764. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37961350/
3. Yang, Haoran, Zhao, Anna, Chen, Yuxiang, Zhou, Jianzhong, Li, Ziliang. 2024. Exploring the potential link between MitoEVs and the immune microenvironment of periodontitis based on machine learning and bioinformatics methods. In BMC oral health, 24, 169. doi:10.1186/s12903-024-03912-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38308306/
4. Romanuik, Tammy L, Wang, Gang, Holt, Robert A, Marra, Marco A, Sadar, Marianne D. 2009. Identification of novel androgen-responsive genes by sequencing of LongSAGE libraries. In BMC genomics, 10, 476. doi:10.1186/1471-2164-10-476. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/19832994/
5. Buechler, Christa, Bodzioch, Marek, Bared, Salim Maa, Dembinska-Kiec, Aldona, Schmitz, Gerd. . Expression pattern and raft association of NIPSNAP3 and NIPSNAP4, highly homologous proteins encoded by genes in close proximity to the ATP-binding cassette transporter A1. In Genomics, 83, 1116-24. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15177564/
