智鼠故事 
C57BL/6JCya-Htatsf1em1flox/Cya 条件性基因敲除小鼠
复苏/繁育服务
产品名称：
Htatsf1-flox
产品编号：
S-CKO-15476
品系背景：
C57BL/6JCya
* 使用本品系发表的文献需注明：Htatsf1-flox mice (Strain S-CKO-15476) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
只
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-Htatsf1em1flox/Cya
品系编号
CKOCMP-72459-Htatsf1-B6J-VA
产品编号
S-CKO-15476
基因名
Htatsf1
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
TAT-SF1；1600023H17Rik；2600017A12Rik；2700077B20Rik
NCBI号
修饰方式
条件性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
MGI:1919709 Mice homozygous for a conditional allele activated in embryonic stem cells exhibit reduced pluripotency.
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
活体
环境标准
SPF
供应地区
中国
品系详情
Htatsf1位于小鼠的X号染色体，采用基因编辑技术，通过高通量电转受精卵方式，获得Htatsf1基因条件性敲除小鼠，性成熟后取精子冻存。
Htatsf1-flox小鼠模型是由赛业生物（Cyagen）构建的条件性基因敲除小鼠。Htatsf1基因位于小鼠X号染色体上，由10个外显子组成，其中ATG起始密码子在2号外显子，TAA终止密码子在10号外显子。条件性敲除区域（cKO区域）位于3号和4号外显子之间，包含229个碱基对的编码序列。删除该区域会导致小鼠Htatsf1基因功能的丧失。Htatsf1-flox小鼠模型的构建过程包括将核糖核蛋白（RNP）和靶向载体共同注入受精卵。随后，对出生的小鼠进行PCR和测序分析进行基因型鉴定。此外，对于携带敲除等位基因的小鼠，胚胎干细胞中的多能性会降低。敲除3号和4号外显子会导致基因移码，覆盖10.08%的编码区域。2号内含子中5'-loxP位点的插入区域大小为1299个碱基对，4号内含子中3'-loxP位点的插入区域大小为407个碱基对。有效的cKO区域大小约为1.4千碱基对。Htatsf1-flox小鼠模型可用于研究Htatsf1基因在小鼠体内的功能。
基因研究概述
HTATSF1，即HIV Tat-specific factor 1，是一种转录延伸因子，在细胞内参与RNA聚合酶II的转录过程。它通过影响转录延伸和剪接过程，调控基因的表达。HTATSF1在多种生物学过程中发挥作用，包括细胞分化、发育、代谢和疾病发生。
HTATSF1与肿瘤的发生和发展密切相关。研究发现，CK2激酶可以磷酸化HTATSF1 Ser748，从而促进HTATSF1与TOPBP1的相互作用，进而促进RAD51招募和HR修复。然而，CK2-HTATSF1-TOPBP1信号轴在肿瘤发生和化疗反应中的临床意义尚未阐明。研究发现，CK2-HTATSF1-TOPBP1轴在多种恶性肿瘤中普遍高激活，使乳腺癌对化疗的反应性降低。相比之下，该轴中每个基因的缺失突变，也发生在乳腺癌和肺癌样本中，预测HR缺陷评分更高，携带HTATSF1失功能突变的肿瘤细胞对PARP抑制剂或铂类药物更敏感。因此，CK2-HTATSF1-TOPBP1轴的完整性与肿瘤发生密切相关，是肿瘤HR状态的指标，并调节化疗反应[1]。
HTATSF1在Duchenne muscular dystrophy (DMD)小鼠模型中也发挥重要作用。研究发现，CSNK2A2、AP3D1和ACTB在GC和DIA中代表强通用的参考基因，而HTATSF1和SDHA是心脏的最优参考基因。GAPDH、HPRT1和RPL13A相反是较差的参考基因，显示出组织、年龄或疾病特异性表达变化。这表明HTATSF1在不同组织和疾病状态下的表达稳定性不同，因此在研究基因表达时需要根据具体情况选择合适的参考基因[2]。
HTATSF1在mdx小鼠模型中也发挥重要作用。研究发现，RPL13a、CSNK2A2、AP3D1和ACTB是稳定表达的参考基因，适用于正常化和比较基因表达。而GAPDH等基因则表现出明显的疾病或肌肉类型相关性。这表明，在选择参考基因时，需要考虑具体的实验条件和研究对象[3]。
HTATSF1在转录延伸过程中也发挥重要作用。研究发现，SF3B1和U2AF1的非同义突变会损害RNA聚合酶II的转录延伸，导致转录复制冲突、复制应激和染色质组织改变。这种延伸缺陷与HTATSF1与突变SF3B1的相互作用受损有关。通过无偏筛选，研究人员发现了Sin3/HDAC复合物中的表观遗传因子，其调节可以正常化转录缺陷及其下游效应。这表明，通过靶向Sin3/HDAC复合物可以作为一种潜在的治疗策略[4]。
此外，HTATSF1在多种疾病中发挥重要作用，包括结直肠癌和自闭症谱系障碍（ASD）。研究发现，HTATSF1的表达与shRNA和sgRNA的抑制效率存在显著的交叉相关性，这表明HTATSF1可以作为预测抗肿瘤靶点的有用资源[5]。同时，研究发现，HTATSF1在ASD候选基因中，其变异与神经功能相关，这表明HTATSF1可能参与了ASD的发病机制[6]。
综上所述，HTATSF1是一种重要的转录延伸因子，参与调控RNA聚合酶II的转录过程。HTATSF1在多种生物学过程中发挥作用，包括肿瘤发生、DMD、mdx小鼠模型和转录延伸过程。此外，HTATSF1在结直肠癌和ASD中也发挥重要作用。因此，深入研究HTATSF1的生物学功能和作用机制，有助于理解RNA表观遗传修饰的生物学功能和疾病发生机制，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献：
1. Guo, Qiushi, Zhao, Jiao, Li, Yuan, Qin, Yan, Shi, Lei. 2024. CK2-HTATSF1-TOPBP1 signaling axis modulates tumor chemotherapy response. In The Journal of biological chemistry, 300, 107377. doi:10.1016/j.jbc.2024.107377. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38762174/
2. Boccanegra, Brigida, Lenti, Roberta, Mantuano, Paola, Hildyard, John C W, De Luca, Annamaria. 2024. Determination of qPCR reference genes suitable for normalizing gene expression in a novel model of Duchenne muscular dystrophy, the D2-mdx mouse. In PloS one, 19, e0310714. doi:10.1371/journal.pone.0310714. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39535998/
3. Hildyard, John C W, Finch, Amber M, Wells, Dominic J. 2019. Identification of qPCR reference genes suitable for normalizing gene expression in the mdx mouse model of Duchenne muscular dystrophy. In PloS one, 14, e0211384. doi:10.1371/journal.pone.0211384. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30699165/
4. Boddu, Prajwal C, Gupta, Abhishek, Roy, Rahul, Neugebauer, Karla M, Pillai, Manoj M. 2023. Transcription elongation defects link oncogenic splicing factor mutations to targetable alterations in chromatin landscape. In bioRxiv : the preprint server for biology, , . doi:10.1101/2023.02.25.530019. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36891287/
5. Jeong, Euna, Lee, Yejin, Kim, Youngju, Lee, Jieun, Yoon, Sukjoon. 2020. Analysis of Cross-Association between mRNA Expression and RNAi Efficacy for Predictive Target Discovery in Colon Cancers. In Cancers, 12, . doi:10.3390/cancers12113091. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33114107/
6. Al-Mubarak, Bashayer, Abouelhoda, Mohamed, Omar, Aisha, Monies, Dorota, Al Tassan, Nada. 2017. Whole exome sequencing reveals inherited and de novo variants in autism spectrum disorder: a trio study from Saudi families. In Scientific reports, 7, 5679. doi:10.1038/s41598-017-06033-1. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28720891/
