智鼠故事 
C57BL/6NCya-Upf3aem1flox/Cya 条件性基因敲除小鼠
复苏/繁育服务
产品名称：
Upf3a-flox
产品编号：
S-CKO-13459
品系背景：
C57BL/6NCya
* 使用本品系发表的文献需注明：Upf3a-flox mice (Strain S-CKO-13459) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
只
基本信息
品系名称
C57BL/6NCya-Upf3aem1flox/Cya
品系编号
CKOCMP-67031-Upf3a-B6N-VA
产品编号
S-CKO-13459
基因名
Upf3a
品系背景
C57BL/6NCya
基因别称
UPF3；RENT3A；2600001C03Rik；4930546M19Rik
NCBI号
修饰方式
条件性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
MGI:1914281 The gene product protects against mRNA transcript degradation. Homozygous constitutive KO is embryonic lethal. Homozygous conditional KO in testes leads to reduced male fertility.
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
活体
环境标准
SPF
供应地区
中国
品系详情
Upf3a位于小鼠的8号染色体，采用基因编辑技术，通过高通量电转受精卵方式，获得Upf3a基因条件性敲除小鼠，性成熟后取精子冻存。
Upf3a-flox小鼠模型由赛业生物（Cyagen）采用基因编辑技术构建的条件性敲除小鼠。Upf3a基因位于小鼠8号染色体上，由9个外显子组成，其中ATG起始密码子在1号外显子，TAG终止密码子在9号外显子。条件性敲除区域（cKO区域）位于3号外显子，包含107个碱基对的编码序列。删除该区域会导致小鼠Upf3a基因功能的丧失。Upf3a基因的产物保护mRNA转录本不被降解。纯合子组成型敲除是胚胎致死的。纯合子条件性敲除在睾丸中会导致男性生育能力下降。敲除3号外显子将导致基因移码，覆盖8.45%的编码区域。2号内含子中5'-loxP位点的插入大小为1111 bp，3号内含子中3'-loxP位点的插入大小为4410 bp。有效的cKO区域大小约为1.8 kb。cKO区域没有其他已知基因。Upf3a-flox小鼠模型的构建过程包括将核糖核蛋白（RNP）和靶向载体共同注入受精卵。随后，对出生的小鼠进行PCR和测序分析进行基因型鉴定。
基因研究概述
Upf3a，也称为up-frameshift 3A，是一种在哺乳动物中发现的基因，编码一个蛋白质，它在无义介导的mRNA降解（NMD）过程中发挥重要作用。NMD是一种保守的细胞机制，用于降解包含早期终止密码子（PTC）的mRNA，从而防止不完整或功能异常的蛋白质的合成。Upf3a在NMD途径中的确切功能仍然存在争议，一些研究表明它可能是一个NMD抑制剂，而其他研究则表明它可能在某些情况下促进NMD。
Upf3a与另一个基因Upf3b是同源基因，这两个基因在进化过程中由于基因复制而产生。Upf3b是NMD途径中的一个关键因子，而Upf3a的功能则更为复杂。Upf3a和Upf3b的这种功能上的差异说明了基因复制如何导致了具有不同功能的基因的进化。
Upf3a在多种生物过程中发挥作用，包括细胞分化、发育、代谢和疾病发生。在肌肉萎缩症和2型糖尿病这两种疾病中，Upf3a的表达与这两种疾病都相关[1]。此外，在结直肠癌中，Upf3a通过上调SRSF3基因的表达来促进肿瘤的转移[2]。这些研究表明，Upf3a在多种疾病的发生和发展中发挥重要作用。
除了在疾病中的作用外，Upf3a还参与了遗传补偿反应（GCR）。GCR是一种细胞机制，当基因发生突变时，细胞会通过上调其他基因的表达来补偿突变基因的功能缺失。研究表明，Upf3a在GCR中发挥重要作用，它可以通过上调其他基因的表达来补偿突变基因的功能缺失[3,4]。
综上所述，Upf3a是一种重要的基因，它在多种生物过程中发挥作用，包括细胞分化、发育、代谢和疾病发生。Upf3a在NMD途径中的功能仍然存在争议，但它无疑是一个功能复杂的基因，它在多种疾病的发生和发展中发挥重要作用。此外，Upf3a还参与了GCR，这表明它可能在维持细胞功能稳定性方面发挥重要作用。
参考文献：
1. Huang, Shiyuan, Xiang, Chunhua, Song, Yi. 2022. Identification of the shared gene signatures and pathways between sarcopenia and type 2 diabetes mellitus. In PloS one, 17, e0265221. doi:10.1371/journal.pone.0265221. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35271662/
2. Xu, Weimin, Ou, Weijun, Feng, Yuan, Cui, Long, Du, Peng. 2023. Genetic compensation response could exist in colorectal cancer: UPF3A upregulates the oncogenic homologue gene SRSF3 expression corresponding to SRSF6 to promote colorectal cancer metastasis. In Journal of gastroenterology and hepatology, 38, 634-647. doi:10.1111/jgh.16152. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36807382/
3. Peng, Jinrong. 2019. Gene redundancy and gene compensation: An updated view. In Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao, 46, 329-333. doi:10.1016/j.jgg.2019.07.001. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31377237/
4. Xie, Aixuan, Ma, Zhipeng, Wang, Jinyang, Chen, Jun, Peng, Jinrong. 2023. Upf3a but not Upf1 mediates the genetic compensation response induced by leg1 deleterious mutations in an H3K4me3-independent manner. In Cell discovery, 9, 63. doi:10.1038/s41421-023-00550-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37369707/
