智鼠故事 
C57BL/6JCya-Tfip11em1flox/Cya 条件性基因敲除小鼠
复苏/繁育服务
产品名称：
Tfip11-flox
产品编号：
S-CKO-11878
品系背景：
C57BL/6JCya
* 使用本品系发表的文献需注明：Tfip11-flox mice (Strain S-CKO-11878) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
只
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-Tfip11em1flox/Cya
品系编号
CKOCMP-54723-Tfip11-B6J-VA
产品编号
S-CKO-11878
基因名
Tfip11
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
Srr1；TIP33；Tip39；2810002G02Rik
NCBI号
修饰方式
条件性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
活体
环境标准
SPF
供应地区
中国
品系详情
Tfip11位于小鼠的5号染色体，采用基因编辑技术，通过高通量电转受精卵方式，获得Tfip11基因条件性敲除小鼠，性成熟后取精子冻存。
Tfip11-flox小鼠模型是由赛业生物（Cyagen）利用基因编辑技术构建的条件性敲除小鼠。该小鼠模型以小鼠C57BL/6JCya为背景，主要用于研究Tfip11基因在小鼠体内的功能。Tfip11基因位于小鼠5号染色体上，包含14个外显子，其ATG起始密码子位于3号外显子，TAG终止密码子位于14号外显子。本研究选择6号外显子作为条件性敲除区域（cKO区域），该区域包含128个碱基对的编码序列。删除该区域会导致小鼠Tfip11基因功能的丧失。
构建Tfip11-flox小鼠模型的过程包括利用PCR技术，以BAC克隆RP24-393E10为模板，生成同源臂和cKO区域。随后，将这些片段插入到靶向载体中，构建出条件性敲除载体。接着，将构建好的载体和核糖核蛋白（RNP）共同注入受精卵，通过体外受精和胚胎移植技术，最终获得Tfip11-flox小鼠。出生后的小鼠通过PCR和测序分析进行基因型鉴定，以确保模型构建成功。
此外，该模型中loxP位点的插入位置分别位于第5号内含子和第6号内含子，其中第5号内含子长度为1187个碱基对，第6号内含子长度为649个碱基对。有效的cKO区域大小约为0.6千碱基对。需要注意的是，由于生物过程的复杂性，目前技术无法预测loxP插入对基因转录、RNA剪接和蛋白质翻译的影响。
综上所述，Tfip11-flox小鼠模型可用于研究Tfip11基因在小鼠体内的功能，为相关研究提供有力的工具。
基因研究概述
基因Tfip11，也称为Tuftelin Interacting Protein 11，是一种与多种生物学过程相关的蛋白质。Tfip11在细胞内的定位主要在核仁和Cajal小体，与核糖核蛋白复合物——剪接体的组装、重塑和去组装过程密切相关。
剪接体是负责前体mRNA(pre-mRNA)剪接的多兆达尔顿核糖核蛋白复合物。在pre-mRNA剪接过程中，剪接体需要经历组装、重塑和去组装三个阶段。最近的研究揭示了剪接体的组装和重塑机制，但剪接体去组装的机制仍然不清楚。参考文献1报道了剪接体去组装的机制，通过冷冻电子断层扫描技术观察线虫和人类终末内含子套索剪接体的结构，并使用生物化学和遗传学数据分析了剪接体去组装的过程。研究发现，四个去组装因子和保守的RNA解旋酶DHX15参与了剪接体的去组装。这些去组装因子探测剪接体的内表面和外表面的释放，并检测到连接的mRNA的释放。其中两个因子TFIP11和C19L1以及三个普遍的剪接体亚单位SYF1、SYF2和SDE2，然后在催化性的U6 snRNA上停靠并激活DHX15，从而启动剪接体的去组装。因此，U6不仅控制了pre-mRNA剪接的开始，也控制了其结束[1]。
此外，Tfip11还在DNA复制叉的逆转中发挥作用。DNA复制叉逆转是一种重要的保护机制，可以防止复制压力导致细胞损伤。参考文献2报道了Tfip11在DNA复制叉逆转中的作用。研究发现，Tfip11与Bloom综合征基因产物BLM解旋酶形成复合物，并表现出对模拟复制叉停滞结构的DNA底物的偏好性结合。Tfip11和BLM的缺失导致另一种蛋白质在停滞的复制叉上异常积累，从而损害RAD51介导的复制叉逆转和减缓，使细胞对复制压力诱导剂的敏感性增加，并增强染色体不稳定性。这些发现揭示了一种以前未知的调节机制，它可以调节BLM和RAD51在停滞的复制叉上的活性，从而影响基因组完整性[2]。
除了在剪接体去组装和DNA复制叉逆转中的作用，Tfip11还参与了U6 snRNA的修饰、U4/U6.U5三小核RNA颗粒（tri-snRNP）的组装和pre-mRNA剪接的保真度。参考文献3报道了Tfip11在U6 snRNA修饰中的作用。研究发现，Tfip11是酵母剪接体去组装因子Ntr1的人类同源物，它定位于核仁和Cajal小体，并对U6的2'-O-甲基化至关重要。Tfip11敲低减少了U6 snRNA与fibrillarin和相关的snoRNA的关联，从而改变了U6的2'-O-甲基化。U6 snRNA的低甲基化与U4/U6.U5 tri-snRNP的组装改变有关，导致剪接体的组装缺陷和剪接保真度的改变。值得注意的是，Tfip11的这种功能独立于其在酵母中的已知伴侣RNA解旋酶DHX15。总的来说，这项研究表明Tfip11在U6 snRNP修饰和U4/U6.U5 tri-snRNP组装中发挥了重要作用，并确定Tfip11是剪接体组装的关键调节因子[3]。
此外，Tfip11还与牙齿的矿化过程有关。牙齿的矿化过程对于牙齿的发育和健康至关重要。参考文献4报道了与牙齿矿化相关的基因和蛋白质相互作用。研究发现，Tfip11与牙齿矿化相关基因的相互作用网络中至少有10个其他基因。这些基因的相互作用对于牙齿矿化的过程至关重要，并可能为牙齿矿化疾病的治疗和控制提供新的思路和策略[4]。
牙齿的矿化过程也受到遗传因素的影响。参考文献5报道了牙齿矿化基因上的单核苷酸多态性（SNPs）对牙齿矿化轨迹的影响。研究发现，Tfip11基因上的SNP rs5997096与低牙齿矿化轨迹相关。这些发现表明，牙齿矿化基因上的SNPs可能对牙齿矿化轨迹有显著影响，并可能为牙齿矿化疾病的治疗和控制提供新的思路和策略[5]。
牙齿矿化过程还与牙齿龋坏有关。牙齿龋坏是一种常见的口腔疾病，其发生发展受到多种因素的影响，包括遗传因素。参考文献6报道了牙齿矿化基因上的SNPs与牙齿龋坏风险的相关性。研究发现，Tfip11基因上的SNP rs134136与高牙齿龋坏风险相关。这些发现表明，牙齿矿化基因上的SNPs可能与牙齿龋坏的发生发展有关，并可能为牙齿龋坏的治疗和控制提供新的思路和策略[6]。
此外，牙齿矿化过程还与牙齿氟斑牙有关。牙齿氟斑牙是一种由于过量摄入氟化物而导致的牙齿病变。参考文献7报道了与牙齿氟斑牙相关的SNPs。研究发现，Tfip11基因上的SNP与高牙齿氟斑牙风险相关。这些发现表明，牙齿矿化基因上的SNPs可能与牙齿氟斑牙的发生发展有关，并可能为牙齿氟斑牙的治疗和控制提供新的思路和策略[7]。
牙齿矿化过程还与牙齿全龋无齿状态有关。牙齿全龋无齿状态是一种极端的牙齿龋坏状态，可能受到遗传因素的影响。参考文献8报道了与牙齿全龋无齿状态相关的SNPs。研究发现，Tfip11基因上的SNP rs5997096与牙齿全龋无齿状态相关。这些发现表明，牙齿矿化基因上的SNPs可能与牙齿全龋无齿状态的发生发展有关，并可能为牙齿全龋无齿状态的治疗和控制提供新的思路和策略[8]。
此外，Tfip11的N端区域还表现出内在无序性和盐依赖性构象变化。参考文献9报道了Tfip11 N端区域的内在无序性和盐依赖性构象变化。研究发现，Tfip11 N端区域是一种多聚电解质内在无序蛋白（IDP），表现出有序和无序组装的结构二元性，取决于离子强度。增加盐浓度增强了蛋白质的构象灵活性，呈现更球状的形状和更模糊的无序排列，这可能有利于液-液相分离（LLPS）和蛋白质-RNA相互作用。最带电和亲水的区域受到的影响最大，包括对Tfip11功能至关重要的G-补丁结构域。这项研究为Tfip11 N端区域盐依赖性构象行为提供了更好的理解，支持了形成不同类型蛋白质组装的假设，这与Tfip11的多种生物学功能一致[9]。
综上所述，Tfip11是一种与多种生物学过程相关的蛋白质，包括剪接体的去组装、DNA复制叉的逆转、U6 snRNA的修饰、U4/U6.U5 tri-snRNP的组装、pre-mRNA剪接的保真度、牙齿的矿化过程、牙齿龋坏、牙齿氟斑牙和牙齿全龋无齿状态等。Tfip11在细胞内的定位主要在核仁和Cajal小体，与核糖核蛋白复合物——剪接体的组装、重塑和去组装过程密切相关。Tfip11的研究有助于深入理解剪接体的去组装机制、DNA复制叉的逆转机制、U6 snRNA的修饰机制、U4/U6.U5 tri-snRNP的组装机制、pre-mRNA剪接的保真度机制、牙齿的矿化过程、牙齿龋坏、牙齿氟斑牙和牙齿全龋无齿状态的机制，为这些生物学过程的研究和治疗提供新的思路和策略。
参考文献：
1. Vorländer, Matthias K, Rothe, Patricia, Kleifeld, Justus, Cochella, Luisa, Plaschka, Clemens. 2024. Mechanism for the initiation of spliceosome disassembly. In Nature, 632, 443-450. doi:10.1038/s41586-024-07741-1. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38925148/
2. Chen, Junliang, Wu, Mingjie, Yang, Yulan, Yang, Bing, Liu, Ting. 2024. TFIP11 promotes replication fork reversal to preserve genome stability. In Nature communications, 15, 1262. doi:10.1038/s41467-024-45684-3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38341452/
3. Duchemin, Amandine, O'Grady, Tina, Hanache, Sarah, Lafontaine, Denis L J, Mottet, Denis. 2021. DHX15-independent roles for TFIP11 in U6 snRNA modification, U4/U6.U5 tri-snRNP assembly and pre-mRNA splicing fidelity. In Nature communications, 12, 6648. doi:10.1038/s41467-021-26932-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34789764/
4. Cavallari, Tayla, Arima, Letícia Yumi, Ferrasa, Adriano, Hirochi Herai, Roberto, Iani Werneck, Renata. 2019. Dental caries: Genetic and protein interactions. In Archives of oral biology, 108, 104522. doi:10.1016/j.archoralbio.2019.104522. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31476523/
5. Chisini, Luiz Alexandre, Santos, Francine da Costa, de Carvalho, Rodrigo Varella, Demarco, Flávio Fernando, Correa, Marcos Britto. 2023. Impact of tooth mineral tissues genes on dental caries: A birth-cohort study. In Journal of dentistry, 133, 104505. doi:10.1016/j.jdent.2023.104505. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37031884/
6. Chisini, Luiz Alexandre, Cademartori, Mariana Gonzalez, Conde, Marcus Cristian Muniz, Tovo-Rodrigues, Luciana, Correa, Marcos Britto. 2020. Genes in the pathway of tooth mineral tissues and dental caries risk: a systematic review and meta-analysis. In Clinical oral investigations, 24, 3723-3738. doi:10.1007/s00784-019-03146-x. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32945961/
7. González-Casamada, Carlos, Nevarez-Rascón, Martina, Nevarez-Rascón, Alfredo, Sánchez-Pérez, Leonor, Molina-Frechero, Nelly. 2022. Single Nucleotide Polymorphisms and Dental Fluorosis: A Systematic Review. In Dentistry journal, 10, . doi:10.3390/dj10110211. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36354656/
8. Kelly, Ariana M, Bezamat, Mariana, Modesto, Adriana, Vieira, Alexandre R. 2020. Biomarkers for Lifetime Caries-Free Status. In Journal of personalized medicine, 11, . doi:10.3390/jpm11010023. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33396693/
9. Küchler, Erika Calvano, Dea Bruzamolin, Carolina, Ayumi Omori, Marjorie, Vieira, Alexandre Rezende, Brancher, João Armando. 2017. Polymorphisms in Nonamelogenin Enamel Matrix Genes Are Associated with Dental Fluorosis. In Caries research, 52, 1-6. doi:10.1159/000479826. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29207377/
