OTOP2,也称为Otopetrin 2,是一种在生物医学领域具有重要研究价值的基因。OTOP2编码的蛋白质属于Otopetrin家族,是一种质子选择性离子通道蛋白。这种通道蛋白在细胞信号传导、生长和发育中发挥关键作用,并且与多种生物学过程密切相关,包括肿瘤的发生发展、免疫调节和内耳的生理功能。
OTOP2基因的表达异常与多种肿瘤的发生发展相关。研究表明,OTOP2在结直肠腺癌(COAD)患者中表达显著下调,并且与患者的生存率相关。OTOP2的表达水平与抗原呈递途径和T细胞反应呈正相关,提示其在肿瘤免疫中的作用[1]。此外,OTOP2的表达水平与MHC分子表达和CD8+ T细胞浸润呈正相关,进一步支持其在肿瘤免疫中的重要作用[1]。OTOP2的缺失可能促进结直肠腺癌细胞的增殖、迁移、侵袭和粘附,表明OTOP2可能作为肿瘤抑制因子发挥作用[1]。此外,OTOP2的表达水平与大肠癌患者的预后相关,提示其可能作为大肠癌预后的预测指标和免疫治疗反应的预测因子[1]。
OTOP2的转录受到野生型p53(wtp53)的调节。wtp53可以调节OTOP2的转录,而突变型p53(mtp53)则没有这种调节作用[3]。这表明OTOP2的转录受到p53信号通路的调控,并且与肿瘤的发生发展相关。
OTOP2基因在进化上保守,并且在多种脊椎动物中存在。OTOP1是OTOP2-Otop3基因家族中唯一功能上被描述的成员,负责重力感知耳石的形成[4]。OTOP1在酸味检测的味觉受体细胞中丰富表达,并且对于它们的锌敏感性质子传导至关重要[4]。OTOP2和OTOP3也与质子通道的形成有关[4]。OTOP家族基因的进化保守性和广泛的组织分布表明,质子通道在生理和病理生理学中发挥着广泛的作用[4]。
OTOP2的表达水平与大肠癌患者的复发风险相关。研究发现,OTOP2在大肠癌患者的肿瘤组织中表达下调,并且与患者的复发风险相关[5]。这表明OTOP2可能作为大肠癌复发的预测指标。
OTOP2的表达受到微小RNA(miRNA)的调控。研究表明,miR-3148可以反向调节OTOP2的表达,抑制结直肠癌细胞迁移、增殖和上皮-间质转化[2]。这表明miRNA与OTOP2的表达和功能相关,并可能参与结直肠癌的发生发展。
OTOP2基因的突变与某些疾病的发生相关。研究表明,OTOP1基因的突变与内耳异常有关[6]。此外,OTOP2基因的罕见编码变异与儿童的非综合征性前庭功能障碍相关[6]。这表明OTOP2基因的突变可能与内耳结构和前庭功能障碍相关。
综上所述,OTOP2基因是一种具有重要研究价值的基因。OTOP2编码的蛋白质在细胞信号传导、生长和发育中发挥关键作用,并且与多种生物学过程密切相关,包括肿瘤的发生发展、免疫调节和内耳的生理功能。OTOP2基因的表达异常与多种肿瘤的发生发展相关,并且可能作为肿瘤抑制因子发挥作用。OTOP2的转录受到p53信号通路的调控,并且与肿瘤的发生发展相关。OTOP2基因在进化上保守,并且在多种脊椎动物中存在。OTOP2的表达水平与大肠癌患者的复发风险相关。OTOP2的表达受到miRNA的调控。OTOP2基因的突变与某些疾病的发生相关。OTOP2基因的研究有助于深入理解其在生理和病理生理学中的作用,并为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献:
1. Lu, Chenglu, Chen, Shuai, Liu, Shasha, Sun, Lin, Sun, Yan. 2024. Determination of the Immunomodulatory Role of OTOP2 in Colon Adenocarcinoma. In Journal of Cancer, 15, 4838-4852. doi:10.7150/jca.95622. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39132149/
2. Guo, Shuai, Sun, Yang. 2022. OTOP2, Inversely Modulated by miR-3148, Inhibits CRC Cell Migration, Proliferation and Epithelial-Mesenchymal Transition: Evidence from Bioinformatics Data Mining and Experimental Verification. In Cancer management and research, 14, 1371-1384. doi:10.2147/CMAR.S345299. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35418782/
3. Qu, Huajun, Su, Yi, Yu, Lianzhi, Zhao, Hongchao, Xin, Chunxia. 2018. Wild-type p53 regulates OTOP2 transcription through DNA loop alteration of the promoter in colorectal cancer. In FEBS open bio, 9, 26-34. doi:10.1002/2211-5463.12554. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30652071/
4. Tu, Yu-Hsiang, Cooper, Alexander J, Teng, Bochuan, Smith, Andrew D, Liman, Emily R. 2018. An evolutionarily conserved gene family encodes proton-selective ion channels. In Science (New York, N.Y.), 359, 1047-1050. doi:10.1126/science.aao3264. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29371428/
5. Sallinger, Katja, Gruber, Michael, Müller, Christin-Therese, Kroneis, Thomas, El-Heliebi, Amin. 2023. Spatial tumour gene signature discriminates neoplastic from non-neoplastic compartments in colon cancer: unravelling predictive biomarkers for relapse. In Journal of translational medicine, 21, 528. doi:10.1186/s12967-023-04384-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37543577/
6. Sumalde, Angelo Augusto M, Scholes, Melissa A, Kalmanson, Olivia A, Hadley-Miller, Nancy, Santos-Cortez, Regie Lyn P. 2023. Rare Coding Variants in Patients with Non-Syndromic Vestibular Dysfunction. In Genes, 14, . doi:10.3390/genes14040831. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37107589/