智鼠故事 
C57BL/6JCya-Phf3em1flox/Cya 条件性基因敲除小鼠
复苏/繁育服务
产品名称：
Phf3-flox
产品编号：
S-CKO-05687
品系背景：
C57BL/6JCya
* 使用本品系发表的文献需注明：Phf3-flox mice (Strain S-CKO-05687) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
只
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-Phf3em1flox/Cya
品系编号
CKOCMP-213109-Phf3-B6J-VA
产品编号
S-CKO-05687
基因名
Phf3
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
2310061N19Rik
NCBI号
修饰方式
条件性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
在研小鼠
环境标准
SPF
供应地区
中国
品系详情
Phf3位于小鼠的1号染色体，采用基因编辑技术，通过高通量电转受精卵方式，获得Phf3基因条件性敲除小鼠，性成熟后取精子冻存。
Phf3-flox小鼠模型是由赛业生物（Cyagen）采用基因编辑技术构建的条件性敲除小鼠。Phf3基因位于小鼠1号染色体上，由15个外显子组成，其中ATG起始密码子在1号外显子，TGA终止密码子在15号外显子。条件性敲除区域（cKO区域）位于9号和10号外显子，包含约1575个碱基对的编码序列。删除该区域会导致小鼠Phf3基因功能的丧失。Phf3-flox小鼠模型的构建过程包括将核糖核蛋白（RNP）和靶向载体共同注入受精卵。随后，对出生的小鼠进行PCR和测序分析进行基因型鉴定。该模型可用于研究Phf3基因在小鼠体内的功能。
基因研究概述
PHF3，也称为PHD finger protein 3，是一种转录调控因子。它通过其PHD finger结构域结合到RNA聚合酶II（Pol II）的C端结构域（CTD），从而调节转录延伸过程。PHF3在神经元基因表达和神经元分化中起着重要作用。PHF3与另一个蛋白质DIDO3形成复合物，共同调节转录延伸，并影响基因表达和RNA处理。此外，PHF3还与染色质和RNA处理因子相互作用，将Pol II固定在相分离的微环境中。
PHF3通过其SPOC结构域结合到Pol II CTD的磷酸化丝氨酸-2位点，从而调节转录和mRNA稳定性。PHF3促进磷酸化Pol II的液-液相分离，与Pol II簇共定位，并随着Pol II在基因长度上的移动。PHF3敲除或SPOC结构域的缺失导致Pol II停滞增加，延伸速率降低，mRNA稳定性增加，并显著去抑制神经元基因的表达。在PHF3敲除的小鼠胚胎干细胞中，关键神经元基因表达异常，导致神经元分化受损。这些数据表明，PHF3通过连接转录和mRNA降解，在神经元基因调节中起着重要作用[1]。
此外，PHF3的基因区域与酒精依赖的风险相关。全基因组关联研究（GWAS）发现，PHF3-PTP4A1基因座附近的遗传变异与酒精依赖相关。这些变异在非洲裔美国人、欧洲裔美国人和澳大利亚人中得到了验证，并且具有强烈的顺式作用调节效应，影响PHF3-PTP4A1 mRNA的表达。这表明PHF3和/或PTP4A1蛋白可能在酒精依赖中发挥功能作用[2]。
PHF3还与胶质母细胞瘤的发生和进展相关。PHF3的表达在胶质母细胞瘤、胶质母细胞瘤细胞系、间变型星形细胞瘤和星形细胞瘤中显著降低或丢失。PHF3蛋白序列包含几个蛋白质结构域，这些结构域通常在转录因子中发现，包括PHD finger结构域，该结构域能够结合大量的DNA。PHF3在胶质母细胞瘤中的表达减少或丢失可能对胶质瘤的发生和发展有影响[4]。
此外，PHF3的表达与胶质母细胞瘤患者的预后相关。PHF3特异性抗体反应在超过60%的胶质母细胞瘤患者中观察到，而在健康人中则没有。胶质母细胞瘤患者中存在PHF3特异性抗体的患者表现出更好的生存率。这表明PHF3在胶质母细胞瘤的发生和进展中起着重要作用，并且可能成为治疗胶质母细胞瘤的潜在靶点[3]。
综上所述，PHF3是一种重要的转录调控因子，在神经元基因表达和神经元分化中发挥着重要作用。PHF3还与酒精依赖、胶质母细胞瘤和胶质母细胞瘤患者的预后相关。PHF3的研究有助于深入理解转录调控和疾病发生机制，为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献：
1. Appel, Lisa-Marie, Franke, Vedran, Bruno, Melania, Djinovic-Carugo, Kristina, Slade, Dea. 2021. PHF3 regulates neuronal gene expression through the Pol II CTD reader domain SPOC. In Nature communications, 12, 6078. doi:10.1038/s41467-021-26360-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34667177/
2. Zuo, Lingjun, Zhang, Clarence K, Wang, Fei, Krystal, John H, Luo, Xingguang. 2011. A novel, functional and replicable risk gene region for alcohol dependence identified by genome-wide association study. In PloS one, 6, e26726. doi:10.1371/journal.pone.0026726. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22096494/
3. Struss, A K, Romeike, B F, Munnia, A, Fischer, U, Meese, E. . PHF3-specific antibody responses in over 60% of patients with glioblastoma multiforme. In Oncogene, 20, 4107-14. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11464277/
4. Fischer, U, Struss, A K, Hemmer, D, Steudel, W I, Meese, E. . PHF3 expression is frequently reduced in glioma. In Cytogenetics and cell genetics, 94, 131-6. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11856869/
