Vmn1r183是一种位于小鼠基因组上的基因,属于Vmn1r家族。Vmn1r家族是一类嗅觉受体基因,它们编码的蛋白质能够识别并响应特定的气味分子。Vmn1r183基因的产物是一种嗅觉受体蛋白,它在大脑的嗅球中表达,参与嗅觉信号传导过程。嗅觉受体基因的多样性对于动物识别不同气味分子至关重要,因为它们决定了动物对气味的感知能力。
在进化过程中,基因复制和基因丢失是常见的现象,这些动态过程对于动物基因组中基因数量的差异产生了重要影响。在基因复制后,通常两个复制的基因会以大约相同的速度积累序列变化。然而,在某些情况下,序列变化的积累是不均匀的,其中一个复制基因会与它的同源基因发生显著的分化。这种“非对称进化”现象在串联基因复制后比在全基因组复制后更为常见,并且可以产生具有实质性新颖性的基因。例如,在蛾类、软体动物和哺乳动物的复制同源基因中,非对称进化产生了新的同源基因,这些基因被招募到新的发育功能中[1]。
乳腺癌是一种异质性疾病,大多数病例(约70%)被认为是散发性的。家族性乳腺癌(约30%的患者),通常在乳腺癌发病率高的家族中出现,与多种高、中、低渗透率的易感基因相关。家族连锁研究已经确定了高渗透率基因,如BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53,这些基因负责遗传综合征。此外,基于家族和人群的方法表明,参与DNA修复的基因,如CHEK2、ATM、BRIP1(FANCJ)、PALB2(FANCN)和RAD51C(FANCO),与中等的乳腺癌风险相关。乳腺癌的全基因组关联研究(GWAS)发现了一些与乳腺癌风险略微增加或降低的常见低渗透率等位基因。目前,只有高渗透率基因在临床实践中被广泛使用。随着下一代测序技术的发展,预计所有家族性乳腺癌基因都将纳入遗传测试。然而,在多基因面板测试完全应用于临床工作流程之前,还需要对中低风险变异体的临床管理进行额外研究[2]。
基因电路是后基因组时代研究的一个核心焦点,旨在理解基因和蛋白质的连通性如何产生细胞现象。这种连通性产生类似于复杂电路的分子网络图,系统性的理解需要开发描述电路的数学框架。从工程的角度来看,构建和分析构成网络的底层子模块是通往这一框架的自然路径。在测序和遗传工程方面的实验进展使得通过设计和实施适合数学建模和定量分析的合成基因网络来实现这一途径成为可能。这些发展标志着基因电路学科的兴起,该学科为预测和评估细胞过程的动力学提供了一个框架。合成基因网络还将导致新的细胞控制逻辑形式,这可能对功能基因组学、纳米技术和基因与细胞治疗具有重要意义[3]。
基因敲除是一种常用的方法,用于探究基因功能,通过产生完全的基因功能丧失的基因型。基因敲除的最严重表型后果是致死性。具有致死性基因敲除表型的基因被称为必需基因。在酵母菌的全基因组敲除分析中,大约四分之一的基因可能是必需的。像其他基因型-表型关系一样,基因必需性受背景效应的影响,并且可能因基因-基因相互作用而变化。对于某些必需基因,基因敲除引起的致死性可以通过基因间相互作用得到拯救。这种“必需性绕过”(BOE)基因-基因相互作用是一种尚未得到充分研究的遗传抑制类型。最近的一项系统性分析发现,在裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中,几乎30%的必需基因的必需性可以通过BOE相互作用得到绕过[4]。
基因调控网络在细胞过程中发挥着重要作用。它们由相互作用的基因、蛋白质和调节因子组成,共同控制基因的表达和蛋白质的产生。基因调控网络通过复杂的相互作用和反馈机制,确保细胞过程的精确调控和适应性。这些网络在细胞分化、发育、代谢和疾病发生等方面发挥着重要作用。对基因调控网络的深入研究有助于揭示细胞过程的复杂性和机制,并为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略[5]。
基因片段是指在基因组中不完整的基因序列。这些片段可能由于基因复制、基因丢失或基因重组等进化过程而产生。基因片段的存在对于基因组进化和物种适应具有重要意义。它们可能参与基因家族的扩展和基因功能的多样化。此外,基因片段还可能与其他基因或非编码RNA相互作用,影响基因表达和细胞过程。对基因片段的研究有助于深入理解基因组的结构和功能,以及进化过程中的基因变化[6]。
植物抗病基因依赖的植物防御反应是指植物在遭受病原体攻击时,通过抗病基因的激活来启动一系列的防御机制。这些防御机制包括细胞壁加固、活性氧爆发、抗微生物物质的产生和信号传导途径的激活等。植物抗病基因的激活通常依赖于病原体相关分子模式(PAMPs)或效应子触发免疫(ETI)信号。这些信号激活抗病基因的表达,进而引发植物防御反应。植物抗病基因依赖的植物防御反应对于植物的抗病能力和生存具有重要意义[7]。
MHC基因的表达受到多种转录因子的调控。这些转录因子包括H-2RIIBP/RXR beta、NK kappa B、I-kappa B、hXBP-1和NF-Y等。这些转录因子通过与MHC基因启动子区域的DNA结合,调控MHC基因的表达水平。此外,新的研究进展还揭示了MHC相关基因的调节机制。例如,基因组原位足迹分析等新技术的应用,为研究MHC基因启动子区域蛋白质-DNA相互作用提供了新的见解。这些研究进展有助于深入理解MHC基因的表达调控机制,以及MHC相关基因在免疫系统中的功能[8]。
综上所述,基因Vmn1r183是一种重要的嗅觉受体基因,参与嗅觉信号传导过程。基因复制和基因丢失是动物基因组中常见的进化事件,非对称进化可以产生具有实质性新颖性的基因。基因电路、基因调控网络、基因片段、植物抗病基因依赖的植物防御反应和MHC基因表达调控等研究进展,为深入理解基因功能和生物学过程提供了重要的理论基础和方法学工具。
参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/
5. Davidson, Eric, Levin, Michael. 2005. Gene regulatory networks. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 102, 4935. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15809445/
6. Mateles, R I. . Gene fragments. In Bio/technology (Nature Publishing Company), 10, 456. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/1368495/
7. Hammond-Kosack, K E, Jones, J D. . Resistance gene-dependent plant defense responses. In The Plant cell, 8, 1773-91. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8914325/
8. Ting, J P, Baldwin, A S. . Regulation of MHC gene expression. In Current opinion in immunology, 5, 8-16. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8452678/