Rpp40,也称为Ribonuclease P/MRP Subunit P40,是核糖核酸酶P和多聚核糖核酸酶P复合物的一个组成部分。核糖核酸酶P是一种在真核生物中存在的核糖核酸酶,参与tRNA的加工过程,对于tRNA成熟和功能发挥至关重要。Rpp40作为核糖核酸酶P复合物的一部分,与其它亚基共同组成一个多蛋白复合体,负责识别和切割tRNA前体分子中的特定序列,使其转变为成熟的tRNA分子。此外,Rpp40还与多聚核糖核酸酶P复合物一起参与rRNA的加工过程,对核糖体的生物合成至关重要。
在生物信息学领域,对Rpp40的研究主要集中在其在疾病发生和发展中的作用。研究表明,Rpp40的表达水平与多种癌症的预后相关。例如,在子宫体子宫内膜癌(UCEC)中,Rpp40的表达水平显著上调,并与患者的临床病理特征相关,包括临床分期、初始治疗效果、组织学类型、组织学分级、总生存事件、疾病特异性生存事件和无进展生存事件等。此外,Rpp40的表达水平与肿瘤微环境中的细胞外基质和免疫细胞浸润相关,表明Rpp40可能在UCEC的发生和发展中发挥重要作用[1]。在低级别胶质瘤(LGG)中,Rpp40的表达水平也与预后相关。研究表明,Rpp40的表达水平与LGG的进展相关,可能是LGG的潜在生物标志物和治疗靶点[2]。此外,Rpp40还被发现与RNA的加工和修饰过程相关。例如,Rpp40的缺失会导致tRNA的加工缺陷,影响细胞内蛋白质合成和细胞代谢[3]。Rpp40还与其他核糖核酸酶P亚基相互作用,参与核糖核酸酶P复合物的组装和功能发挥[4]。
除了在RNA加工中的作用,Rpp40还与RNA的降解和修饰相关。例如,RNase MRP/RNase P是一种内切核糖核酸酶,负责降解特定的mRNA分子。研究表明,Rpp40可以与RNase MRP/RNase P相互作用,参与mRNA的降解和修饰过程[7]。此外,Rpp40的表达水平还与RNA的稳定性和功能相关。例如,在呼吸系统疾病中,Rpp40的表达水平可能与病毒的复制和传播相关,影响疾病的进展和预后[5][6]。
综上所述,Rpp40作为一种重要的核糖核酸酶P亚基,在RNA的加工、降解和修饰过程中发挥重要作用。Rpp40的表达水平与多种癌症的预后相关,可能是这些癌症的潜在生物标志物和治疗靶点。此外,Rpp40还与RNA的稳定性和功能相关,影响疾病的进展和预后。深入研究Rpp40的功能和机制,有助于揭示RNA的加工、降解和修饰过程在疾病发生和发展中的作用,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献:
1. Tang, Jianming, Tian, Xiaoli, Min, Jie, Hu, Ming, Hong, Li. 2022. RPP40 is a prognostic biomarker and correlated with tumor microenvironment in uterine corpus endometrial carcinoma. In Frontiers in oncology, 12, 957472. doi:10.3389/fonc.2022.957472. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36091104/
2. Dai, Jingyuan, Gao, Jiahui, Dong, Hongchao. 2024. Prognostic relevance and validation of ARPC1A in the progression of low-grade glioma. In Aging, 16, 11162-11184. doi:10.18632/aging.205952. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39012280/
3. Jarrous, N, Eder, P S, Wesolowski, D, Altman, S. . Rpp14 and Rpp29, two protein subunits of human ribonuclease P. In RNA (New York, N.Y.), 5, 153-7. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/10024167/
4. Jiang, T, Altman, S. 2001. Protein-protein interactions with subunits of human nuclear RNase P. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 98, 920-5. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11158571/
5. Yang, Yun-Song, Ren, Yi-Xing, Liu, Cheng-Lin, Jiang, Yi-Zhou, Shao, Zhi-Ming. 2022. The early-stage triple-negative breast cancer landscape derives a novel prognostic signature and therapeutic target. In Breast cancer research and treatment, 193, 319-330. doi:10.1007/s10549-022-06537-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35334008/
6. Todd, Angela K, Costa, Anna-Maria, Waller, Gregory, Barr, Ian G, Deng, Yi-Mo. 2021. Rapid detection of human respiratory syncytial virus A and B by duplex real-time RT-PCR. In Journal of virological methods, 294, 114171. doi:10.1016/j.jviromet.2021.114171. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33984394/
7. Mattijssen, Sandy, Hinson, Ella R, Onnekink, Carla, Cresswell, Peter, Pruijn, Ger J M. 2010. Viperin mRNA is a novel target for the human RNase MRP/RNase P endoribonuclease. In Cellular and molecular life sciences : CMLS, 68, 2469-80. doi:10.1007/s00018-010-0568-3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21053045/