智鼠故事 
C57BL/6JCya-Serpinb6bem1flox/Cya 条件性基因敲除小鼠
复苏/繁育服务
产品名称：
Serpinb6b-flox
产品编号：
S-CKO-05201
品系背景：
C57BL/6JCya
* 使用本品系发表的文献需注明：Serpinb6b-flox mice (Strain S-CKO-05201) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
只
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-Serpinb6bem1flox/Cya
品系编号
CKOCMP-20708-Serpinb6b-B6J-VA
产品编号
S-CKO-05201
基因名
Serpinb6b
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
NK13；Spi12；ovalbumin
NCBI号
修饰方式
条件性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
在研小鼠
环境标准
SPF
供应地区
中国
品系详情
Serpinb6b位于小鼠的13号染色体，采用基因编辑技术，通过高通量电转受精卵方式，获得Serpinb6b基因条件性敲除小鼠，性成熟后取精子冻存。
Serpinb6b-flox小鼠模型是由赛业生物（Cyagen）采用基因编辑技术构建的条件性敲除小鼠。该模型旨在研究Serpinb6b基因在小鼠体内的功能。Serpinb6b基因位于小鼠13号染色体上，由7个外显子组成，其中ATG起始密码子在2号外显子，TGA终止密码子在7号外显子。条件性敲除区域（cKO区域）位于5号外显子，包含约643个碱基对的编码序列。删除该区域会导致小鼠Serpinb6b基因功能的丧失。
Serpinb6b-flox小鼠模型的构建过程包括将基因编辑技术产生的靶向载体和核糖核蛋白（RNP）共同注入受精卵。随后，对出生的小鼠进行PCR和测序分析进行基因型鉴定。
基因研究概述
Serpinb6b，也称为Serpin B6b，是一种属于丝氨酸蛋白酶抑制因子（serine protease inhibitor）家族的基因。该基因编码的蛋白质是一种分泌型丝氨酸蛋白酶抑制剂，能够抑制多种丝氨酸蛋白酶的活性，包括凝血酶、纤溶酶、胰蛋白酶等。丝氨酸蛋白酶在许多生物学过程中发挥着重要作用，包括凝血、纤溶、炎症反应和细胞凋亡等。因此，Serpinb6b在维持这些过程的正常进行中发挥着重要作用。
在动脉粥样硬化中，血管平滑肌细胞（vascular smooth muscle cells，SMCs）和其衍生物是动脉粥样硬化发生的关键因素。一项研究应用翻译核糖体亲和纯化测序技术，直接从组织中分析SMC特异性基因表达。为了促进SMC特异性翻译组分析，研究人员生成了一种表达增强型绿色荧光蛋白（EGFP）标记的核糖体蛋白L10a（EGFP-L10a）的转基因小鼠系（SMCTRAP小鼠）。这些小鼠进一步与动脉粥样硬化模型小鼠（Ldlr-/-，ApoB100/100）交配，生成了SMCTRAP-AS小鼠，用于分析动脉粥样硬化相关的SMCs。研究显示，EGFP-L10a的表达定位于SMCs中，包括主动脉壁和斑块。通过TRAP技术，研究人员发现Serpinb6b是动脉粥样硬化相关的SMCs中表达的基因之一[1]。
在急性胰腺炎中，Serpinb6b的表达上调。研究人员使用Affymetrix GeneChip系统对暴露于caerulein的胰腺中的基因表达谱进行了研究。结果显示，Serpinb6b的表达上调，与胰腺的细胞间连接形成、细胞凋亡和自噬等过程有关。这些基因的上调可能涉及内源性自我保护机制，以对抗急性胰腺炎的发生[2]。
在消化系统肿瘤的免疫治疗中，Serpinb6b的表达水平与TIM-3免疫治疗的有效性相关。研究人员使用GEO数据库来识别与消化系统肿瘤和TIM-3作用相关的数据集。通过GEO2R工具，研究人员鉴定了57个差异表达基因（DEGs），其中包括Serpinb6b。这些DEGs富集于生物途径，如激活白细胞、细胞和免疫系统的发展。此外，还确定了四个显著的KEGG途径，涉及消化系统肿瘤的免疫治疗和TIM-3。蛋白质-蛋白质互作（PPI）网络分析确定了10个hub基因，包括Serpinb6b，与消化系统肿瘤免疫治疗靶点TIM-3相关[3]。
在骨吸收过程中，Serpinb6b的表达上调。研究人员使用定量质谱技术，串联质谱标签（tandem mass tagging），对从RAW264.7细胞分化而来的骨吸收性巨噬细胞样细胞在受体激活核因子κ-B配体（receptor activator of nuclear factor κ-B ligand）诱导下的蛋白质组变化进行了量化。结果显示，Serpinb6b是138个新发现的骨吸收相关蛋白质之一。进一步分析表明，CSE在骨吸收的早期阶段发挥作用，并且CSE的沉默可以抑制骨吸收相关标记物的表达[4]。
在基孔肯雅病毒（Chikungunya virus，CHIKV）感染中，Serpinb6b的表达上调。研究人员对CHIKV感染小鼠的脚和淋巴结进行了RNA-Seq分析。结果显示，Serpinb6b在CHIKV感染后上调。此外，使用Serpinb6b（granzyme A抑制剂）治疗可以减少关节炎炎症。在非人灵长类动物和人类CHIKV患者中，granzyme A水平升高，与病毒载量相关。这些结果提示granzyme A是关节炎炎症的重要驱动因素，并可能成为治疗靶点[5]。
综上所述，Serpinb6b在多种生物学过程中发挥着重要作用，包括动脉粥样硬化、急性胰腺炎、消化系统肿瘤免疫治疗、骨吸收和CHIKV感染。Serpinb6b的表达上调可能与这些疾病的发生和发展相关，并且可能成为潜在的药物靶点。进一步的研究将有助于深入理解Serpinb6b的生物学功能和在疾病发生中的作用机制。
参考文献：
1. Ravindran, Aarthi, Holappa, Lari, Niskanen, Henri, Örd, Tiit, Kaikkonen, Minna U. . Translatome profiling reveals Itih4 as a novel smooth muscle cell-specific gene in atherosclerosis. In Cardiovascular research, 120, 869-882. doi:10.1093/cvr/cvae028. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38289873/
2. Nakada, Shinji, Tsuneyama, Koichi, Kato, Ichiro, Takano, Yasuo, Shimada, Yutaka. 2009. Identification of candidate genes involved in endogenous protection mechanisms against acute pancreatitis in mice. In Biochemical and biophysical research communications, 391, 1342-7. doi:10.1016/j.bbrc.2009.12.047. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/20026013/
3. Wang, Zexin, Li, Xibin, Tian, Litao, Sun, Qinhui, Wang, Jinshen. 2024. Application of Bioinformatics in Predicting the Efficacy of Digestive Tumour Immunotherapy Target TIM-3 and its Inhibitors. In Journal of Cancer, 15, 1954-1965. doi:10.7150/jca.92446. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38434966/
4. Itou, Takahiro, Maldonado, Natalia, Yamada, Iwao, Singh, Sasha, Aikawa, Elena. 2013. Cystathionine γ-lyase accelerates osteoclast differentiation: identification of a novel regulator of osteoclastogenesis by proteomic analysis. In Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology, 34, 626-34. doi:10.1161/ATVBAHA.113.302576. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24357058/
5. Wilson, Jane A C, Prow, Natalie A, Schroder, Wayne A, Bird, Phillip I, Suhrbier, Andreas. 2017. RNA-Seq analysis of chikungunya virus infection and identification of granzyme A as a major promoter of arthritic inflammation. In PLoS pathogens, 13, e1006155. doi:10.1371/journal.ppat.1006155. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28207896/
