智鼠故事 
C57BL/6JCya-Rykem1flox/Cya 条件性基因敲除小鼠
复苏/繁育服务
产品名称：
Ryk-flox
产品编号：
S-CKO-04891
品系背景：
C57BL/6JCya
* 使用本品系发表的文献需注明：Ryk-flox mice (Strain S-CKO-04891) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
只
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-Rykem1flox/Cya
品系编号
CKOCMP-20187-Ryk-B6J-VA
产品编号
S-CKO-04891
基因名
Ryk
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
Vik；ERK-3
NCBI号
修饰方式
条件性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
MGI:101766 Homozygous null mice have a distinctive craniofacial appearance, shortened limbs and postnatal mortality due to feeding and respiratory complications associated with a complete cleft of the secondary palate.
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
活体
环境标准
SPF
供应地区
中国
品系详情
Ryk位于小鼠的9号染色体，采用基因编辑技术，通过高通量电转受精卵方式，获得Ryk基因条件性敲除小鼠，性成熟后取精子冻存。
Ryk-flox小鼠模型是由赛业生物（Cyagen）采用基因编辑技术构建的条件性敲除小鼠。Ryk基因位于小鼠9号染色体上，包含15个外显子，其中ATG起始密码子在1号外显子，TGA终止密码子在最后一个外显子。该模型的构建过程选择了3号外显子作为条件性敲除区域（cKO区域），该区域包含100个碱基对的编码序列。删除该区域会导致小鼠Ryk基因功能的丧失。
赛业生物（Cyagen）使用基因编辑技术构建Ryk-flox小鼠模型的过程包括，首先通过PCR技术从BAC克隆RP23-274G21中扩增出同源臂和cKO区域。然后将扩增得到的片段与靶向载体连接，构建出靶向载体。接下来，将构建好的靶向载体通过显微注射技术注入小鼠受精卵中，从而实现基因的敲除。出生的小鼠通过PCR和测序分析进行基因型鉴定，以确认基因敲除是否成功。
需要注意的是，Ryk-flox小鼠模型在基因敲除后，携带敲除等位基因的小鼠表现出明显的表型变化，包括独特的颅面外观、缩短的四肢，并且由于与次级腭完全裂隙相关的喂食和呼吸并发症，导致出生后死亡率较高。
此外，Ryk-flox小鼠模型可用于研究Ryk基因在小鼠体内的功能，特别是3号外显子编码序列的缺失对基因功能的影响。同时，该模型也适用于研究Ryk基因在小鼠发育和生理过程中的作用，以及相关疾病的发生发展机制。
基因研究概述
RYK基因，也称为受体酪氨酸激酶相关基因，是一种重要的受体酪氨酸激酶家族成员。该基因编码的蛋白在多种生物学过程中发挥着关键作用，包括细胞增殖、迁移、分化和极性等。RYK蛋白具有Wnt结合域，能够与Wnt蛋白结合，参与Wnt信号传导通路。Wnt信号通路是一种保守的信号传导通路，在多种生物体的发育过程中发挥着重要作用，包括细胞生长、分裂、分化和轴突引导等。
在肿瘤治疗领域，RYK基因的表达与药物响应和临床预后密切相关。例如，在胶质瘤患者中，RYK基因的表达与替莫唑胺（TMZ）化疗药物的响应和患者的总体生存期（OS）和进展无病生存期（PFS）相关[1]。在IDH突变型胶质瘤中，RYK表达和肿瘤分级是显著的生存预测因子。而在IDH野生型胶质母细胞瘤（GBM）中，MGMT状态是唯一的显著预测因子。此外，RYK表达与MGMT状态结合可以作为一种额外的生物标志物，用于预测GBM患者的生存情况。
在炎症性肺部疾病中，RYK信号传导通路发挥着抗炎作用。研究发现，RYK基因在肺间质组织中作为细胞生存和抗炎调节因子发挥作用。RYK突变小鼠表现出肺部发育不良、炎症和肺泡简化，这是由于次级肺泡隔的缺陷引起的。通过分析野生型和突变小鼠肺部的转录组，研究人员发现了一组上调的促凋亡和炎症基因，这些基因的表达可以被Wnt/RYK信号传导通路抑制。此外，在出生后和成年阶段特异性地删除间质细胞中的Ryk基因也会导致肺部炎症，这表明Wnt/RYK信号传导通路在肺部稳态中发挥着持续的作用[2]。RYK信号传导通过β-连环蛋白和核因子κB（NF-κB）是保护间质细胞免受死亡、过度的炎症细胞因子产生和炎症细胞募集和积累的机制之一。值得注意的是，RYK表达在肺炎患者肺间质细胞中下调。这些数据表明，RYK信号传导在肺部发育和稳态中发挥着关键的抗炎作用，并为进一步研究炎症性肺部疾病的发病机制和治疗方法提供了动物模型。
在造血细胞中，RYK基因的表达具有谱系和阶段特异性。研究发现，RYK基因在骨髓细胞中表达增加，尤其是在5-氟尿嘧啶处理的骨髓细胞中。RT-PCR分析显示，RYK基因在CD3-、CD4-、CD8- T细胞（低水平表达）、前T细胞、胸腺上皮细胞和成熟髓系细胞中表达，但在髓系前体或B细胞前体中不表达。流式细胞术分析表明，RYK+细胞占低密度骨髓细胞的36.7%，而Lin+/Ryk+细胞占33.7%，而Ryk+细胞仅占Lin-群体的0.3%。这表明RYK基因的表达在造血发育过程中受到谱系承诺和成熟阶段的影响[3]。
RYK基因在Wnt/平面细胞极性（PCP）信号传导通路中也发挥着重要作用。研究发现，哺乳动物RYK与Wnt/PCP通路相互作用。在体外分析中，RYK的Wnt抑制因子结构域对于Wnt结合是必要的。对两种脊椎动物模型生物的详细分析显示，RYK表型与PCP信号传导一致。在斑马鱼中，使用morpholinos进行基因敲低揭示了RYK和Wnt11在PCP通路调节的胚胎收敛扩展过程中的遗传相互作用。RYK缺陷小鼠胚胎显示出耳蜗毛细胞极性受损，这是PCP信号传导受损的特征。此外，RYK缺陷小鼠胚胎和RYK/Looptail双杂合子小鼠胚胎（含有Wnt/PCP通路基因Vangl2的突变）也显示出PCP缺陷，这表明RYK和Vangl2之间存在遗传相互作用。共免疫沉淀研究表明，RYK和VANGL2蛋白形成复合物，而RYK还激活PCP信号传导通路的下游效应因子RhoA。这些数据表明，RYK在脊椎动物发育过程中通过Vangl2信号传导通路在Wnt/PCP信号传导中发挥着重要作用[4]。
此外，RYK基因的表达与唇腭裂患者的组织病变相关。研究发现，唇腭裂患者软骨中IL7和β-防御素2的表达显著增加，而IL10在软骨中的表达也较高。这些结果表明，在唇腭裂患者的硬组织中存在着显著的免疫反应。而在骨组织中，MSX1、PAX9、RYK和IRF6基因蛋白的表达较低，这可能是唇腭裂硬组织细胞分化、增殖和迁移事件不完整的表现[5]。
在胃腺癌中，RYK基因的表达与肿瘤发生和肝转移的潜在能力相关。研究发现，RYK基因的表达与胃腺癌患者的肝转移相关，并且与上皮-间质转化（EMT）标记物的表达趋势相关。RYK基因的表达也与胃腺癌细胞的转移潜能相关。RYK基因敲低不仅抑制了胃腺癌细胞的迁移、侵袭和EMT，还抑制了胃腺癌细胞在裸鼠异种移植模型中的肿瘤生长和肝转移。这表明RYK基因是胃腺癌发生和肝转移的潜在致癌因子，可能参与非经典Wnt信号传导通路[6]。
综上所述，RYK基因在多种生物学过程中发挥着重要作用，包括细胞增殖、迁移、分化和极性等。RYK基因的表达与肿瘤治疗、炎症性肺部疾病、造血细胞发育、Wnt/PCP信号传导通路、唇腭裂和胃腺癌等密切相关。RYK基因的研究有助于深入理解其在生物学过程和疾病发生中的作用机制，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献：
1. Gonzalez, Ricardo D, Small, George W, Green, Adrian J, Motsinger-Reif, Alison A, Wiltshire, Tim. 2023. RYK Gene Expression Associated with Drug Response Variation of Temozolomide and Clinical Outcomes in Glioma Patients. In Pharmaceuticals (Basel, Switzerland), 16, . doi:10.3390/ph16050726. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37242509/
2. Kim, Hyun-Taek, Panza, Paolo, Kikhi, Khrievono, Guenther, Andreas, Stainier, Didier Y R. 2022. WNT/RYK signaling functions as an antiinflammatory modulator in the lung mesenchyme. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 119, e2201707119. doi:10.1073/pnas.2201707119. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35671428/
3. Simoneaux, D K, Fletcher, F A, Jurecic, R, Patel, P, Belmont, J W. . The receptor tyrosine kinase-related gene (ryk) demonstrates lineage and stage-specific expression in hematopoietic cells. In Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950), 154, 1157-66. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/7822791/
4. Macheda, Maria L, Sun, Willy W, Kugathasan, Kumudhini, Dabdoub, Alain, Stacker, Steven A. 2012. The Wnt receptor Ryk plays a role in mammalian planar cell polarity signaling. In The Journal of biological chemistry, 287, 29312-23. doi:10.1074/jbc.M112.362681. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22773843/
5. Jankovska, Iveta, Pilmane, Mara, Akota, Ilze. . Expression of gene proteins, interleukins and β-defensin in cleft-affected tissue. In Stomatologija, 19, 103-108. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29806648/
6. Eisenmann, David M. 2005. Wnt signaling. In WormBook : the online review of C. elegans biology, , 1-17. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18050402/
