Rpl32基因编码60S核糖体蛋白L32,是核糖体生物合成和功能中不可或缺的组成部分。核糖体是细胞中蛋白质合成的机器,其结构和功能的完整性对细胞的生存和正常功能至关重要。Rpl32蛋白在核糖体中与rRNA和其它r蛋白相互作用,共同构成核糖体大亚基,参与翻译过程。
在植物中,Rpl32基因的表达受到非生物胁迫的调控。例如,水稻中的Rpl32基因(rpL32)在盐胁迫下会转录下调,这可能与转录因子从启动子区域的移除有关。研究表明,水稻中的rpL32基因在盐敏感品种中比耐受品种表现出更高的下调程度,并且在胁迫解除后,其表达会恢复到原始水平[1]。此外,核小体定位、组蛋白修饰和基因环结构的改变也与rpL32基因在胁迫下的下调相关[7]。
在植物进化过程中,Rpl32基因经历了从叶绿体基因组到核基因组的转移。例如,杨树和韩国黄连的叶绿体基因组中已经失去了rpl32基因,而在核基因组中发现了相应的基因。这些核基因在转移过程中获得了编码转运肽的序列,以便将Rpl32蛋白转运到叶绿体中[2,3,6,8]。这种基因转移事件在植物进化中具有重要的意义,它反映了细胞器基因组与核基因组之间复杂的相互作用和协调。
Rpl32基因在非植物生物中也有重要作用。例如,小鼠的Rpl32基因对于细胞内蛋白质合成的调控至关重要。研究表明,小鼠Rpl32基因的内含子序列对于其表达具有重要作用,其中内含子1包含一个转录调控元件,可以增加基因的表达水平[4]。此外,Rpl32基因的表达还受到细胞内其他因子的影响,例如自噬相关蛋白LAMP2A可以促进Rpl32的表达[5]。
综上所述,Rpl32基因在细胞内蛋白质合成和细胞器基因组的进化中发挥着重要作用。Rpl32基因的表达受到非生物胁迫的调控,并且经历了从叶绿体基因组到核基因组的转移。这些研究结果有助于我们深入理解Rpl32基因的功能和调控机制,并为相关生物学过程的研究提供新的思路和策略。
参考文献:
1. Mukhopadhyay, Pradipto, Reddy, Malireddy K, Singla-Pareek, Sneh Lata, Sopory, Sudhir K. 2011. Transcriptional downregulation of rice rpL32 gene under abiotic stress is associated with removal of transcription factors within the promoter region. In PloS one, 6, e28058. doi:10.1371/journal.pone.0028058. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22132208/
2. Ueda, Minoru, Fujimoto, Masaru, Arimura, Shin-ichi, Tsutsumi, Nobuhiro, Kadowaki, Koh-ichi. 2007. Loss of the rpl32 gene from the chloroplast genome and subsequent acquisition of a preexisting transit peptide within the nuclear gene in Populus. In Gene, 402, 51-6. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17728076/
3. Park, Seongjun, Jansen, Robert K, Park, SeonJoo. 2015. Complete plastome sequence of Thalictrum coreanum (Ranunculaceae) and transfer of the rpl32 gene to the nucleus in the ancestor of the subfamily Thalictroideae. In BMC plant biology, 15, 40. doi:10.1186/s12870-015-0432-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25652741/
4. Chung, S, Perry, R P. . Importance of introns for expression of mouse ribosomal protein gene rpL32. In Molecular and cellular biology, 9, 2075-82. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/2747643/
5. Issa, Abdul-Raouf, Sun, Jun, Petitgas, Céline, Chérif-Zahar, Baya, Birman, Serge. 2018. The lysosomal membrane protein LAMP2A promotes autophagic flux and prevents SNCA-induced Parkinson disease-like symptoms in the Drosophila brain. In Autophagy, 14, 1898-1910. doi:10.1080/15548627.2018.1491489. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29989488/
6. Alqahtani, Aldanah A, Jansen, Robert K. 2021. The evolutionary fate of rpl32 and rps16 losses in the Euphorbia schimperi (Euphorbiaceae) plastome. In Scientific reports, 11, 7466. doi:10.1038/s41598-021-86820-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33811236/
7. Mukhopadhyay, Pradipto, Singla-Pareek, Sneh Lata, Reddy, Malireddy K, Sopory, Sudhir K. 2013. Stress-mediated alterations in chromatin architecture correlate with down-regulation of a gene encoding 60S rpL32 in rice. In Plant & cell physiology, 54, 528-40. doi:10.1093/pcp/pct012. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23359423/
8. Claude, Sivagami-Jean, Park, Seongjun, Park, SeonJoo. 2022. Gene loss, genome rearrangement, and accelerated substitution rates in plastid genome of Hypericum ascyron (Hypericaceae). In BMC plant biology, 22, 135. doi:10.1186/s12870-022-03515-x. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35321651/