ZZEF1,全称为ZZ-type zinc finger and EF-hand domain protein 1,是一种多结构域蛋白,包含锌指和EF手结构域。它被发现与多种人类疾病有关,如糖尿病和癌症,但其具体功能尚不完全清楚。近年来,随着研究的深入,人们对ZZEF1的功能有了更深入的认识。
一项研究表明,ZZEF1是一种组蛋白H3阅读器,其第二个ZZ结构域(ZZEF1ZZ2)可以与组蛋白H3的N端结合,并能够容纳H3尾部上的常见表观遗传标记。ZZEF1ZZ2与H3的N端氨基酸,尤其是Ala1,以及ZZEF1ZZ2的酸性腔室对于ZZ-H3的相互作用至关重要。在人类肺癌细胞系H1299中进行的RNA-seq分析显示,ZZEF1耗竭会导致Kruppel样因子(KLF)调控的基因下调。事实上,ZZEF1与KLF9和KLF6发生物理相互作用,并调节这些转录因子的共同目标基因。这些发现表明,ZZEF1通过与组蛋白H3尾部结合,促进KLF9/6介导的基因调控[1]。
另一项研究报道了一种与常染色体显性黄斑营养不良相关的染色体17串联重复。该研究通过基因组和RNA测序,确定了一种新的ZZEF1-ALOX15融合基因,该基因通过ZZEF1启动子驱动ALOX15的过表达。ALOX15编码一种参与多不饱和脂肪酸代谢的脂氧合酶。功能研究表明,在鼠视网膜中电穿孔融合基因转录本会导致视网膜组织紊乱和感光细胞及视网膜色素上皮(RPE)损伤。电穿孔原生的ALOX15转录本也会导致感光细胞损伤,而电穿孔近零ALOX15转录本则不会。受影响患者的淋巴细胞中ALOX15底物水平较低,中性脂质积累。研究结果表明,融合基因是导致该家族黄斑营养不良的原因,由于ALOX15的错位和过表达。这是首次报道融合基因导致黄斑营养不良或遗传性视网膜营养不良的病例,强调了在未解决的视网膜营养不良中进行复制分析的重要性[2]。
此外,一项全基因组关联研究(GWAS)和纯合性片段(ROH)分析揭示了与韩国杜洛克、兰德瑞斯和约克夏猪繁殖性能相关的遗传标记。在约克夏猪中,发现与ZZEF1相关的SNP标记与繁殖性能相关。这些基因具有不同的功能,包括突触传递、细胞骨架组织、DNA修复和细胞能量生产。通过GWAS和ROH分析,研究人员确定了与NBA和TNB相关的品种特异性SNP标记,为提高繁殖性能效率和未来的育种策略提供了见解[3]。
综上所述,ZZEF1是一种重要的蛋白质,参与组蛋白阅读和基因调控。它通过与组蛋白H3的结合,影响KLF9/6介导的基因调控。此外,ZZEF1的异常表达与黄斑营养不良有关。这些发现为理解ZZEF1的功能和其在人类疾病中的作用提供了重要的信息。
参考文献:
1. Yu, Yucong, Tencer, Adam, Xuan, Hongwen, Kutateladze, Tatiana G, Shi, Xiaobing. 2020. ZZEF1 is a Histone Reader and Transcriptional Coregulator of Krüppel-Like Factors. In Journal of molecular biology, 433, 166722. doi:10.1016/j.jmb.2020.11.021. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33227311/
2. Adele, Rabiat, Hussein, Rowaida, Tavares, Erika, Héon, Elise, Vincent, Ajoy. 2024. Autosomal-dominant macular dystrophy linked to a chromosome 17 tandem duplication. In JCI insight, 9, . doi:10.1172/jci.insight.178768. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39436697/
3. Mekonnen, Kefala Taye, Lee, Dong-Hui, Cho, Young-Gyu, Son, Ah-Yeong, Seo, Kang-Seok. 2024. Genome-Wide Association Studies and Runs of Homozygosity Reveals Genetic Markers Associated with Reproductive Performance in Korean Duroc, Landrace, and Yorkshire Breeds. In Genes, 15, . doi:10.3390/genes15111422. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39596622/