Tmem233,也称为transmembrane protein 233,是一种跨膜蛋白,属于dispanins家族。dispanins是一类含有15个跨膜蛋白的家族,它们在生理和神经疾病中具有多样化的功能。许多dispanins,包括synapse differentiation induced gene 1 (SynDIG1)、proline-rich transmembrane protein 1 (PRRT1)/SynDIG4和PRRT2,在中枢神经系统(CNS)中表达,参与突触的发生、神经递质的释放以及与离子通道的相互作用,包括AMPA受体(AMPARs)。而其他一些dispanins,如TMEM233和trafficking regulator of GLUT4-1 (TRARG1),在周围神经系统(PNS)中表达,但它们的功能尚不明确[1]。最近的研究发现,来自澳大利亚巨型刺痛树的神经毒素家族可以靶向TMEM233,调节电压门控钠(NaV)通道的功能,这表明dispanins具有潜在的药物靶标价值[1]。
Ehrlich等人研究了骨骼肌相关基因的表观遗传学,包括来自LRRC、OSBPL、ASB和TMEM基因家族的基因。他们选择了21个在人类骨骼肌(SkM)中相对于52种其他组织类型优先表达的基因,并分析了它们在组织特异性表观遗传学和表达之间的相关性。他们还比较了这些基因的遗传学、蛋白质组学和文献描述。在研究中,他们发现了一些在SkM功能方面鲜有或没有描述的基因(ASB4、ASB8、ASB10、ASB12、ASB16、LRRC14B、LRRC20、LRRC30、TMEM52和TMEM233)以及一些在SkM功能方面已有描述的基因(ASB2、ASB5、ASB11、ASB15、LRRC2、LRRC38、LRRC39、TMEM38A/TRIC-A和TMEM38B/TRIC-B)。其中一些基因与SkM或心脏病、癌症、骨病或其他疾病有关。此外,他们还发现了与转录相关的SkM表观遗传特征,包括超增强子、启动子DNA低甲基化、组成型低甲基化启动子区域的延长以及嵌入邻近基因中的SkM相关增强子(例如,ASB8-PFKM、LRRC39-DBT和LRRC14B-PLEKHG4B基因对)。此外,高度或低度共表达的长非编码RNA(lncRNA)基因可能调节这些基因。这些发现为SkM中相关基因的表观遗传模式和功能提供了见解,并可以阐明SkM中基因表达的正常和疾病相关调节[2]。
Zhang等人建立了一个与细胞衰老相关的6基因风险模型,用于预测乳腺癌的预后。他们从TCGA获得了BRCA的RNA-seq表达谱和临床数据,并使用pam算法根据衰老相关基因对病人进行聚类。他们使用加权基因共表达网络分析来识别共表达基因,并使用LASSO-Cox分析来构建风险预后模型。该模型在训练集、验证集和整个BRCA数据集中的表现都良好且稳定。此外,与其他已发表模型相比,该模型也表现出优越性。6基因风险模型(ADAMTS8、DCAF12L2、PCDHA10、PGK1、SLC16A2和TMEM233)被证明是预后的独立风险因素。此外,机制预测表明,在衰老条件下,糖代谢过程(如糖酵解和TCA循环)被激活。糖代谢途径进一步被发现与CD8 T细胞和自然杀伤细胞的浸润水平呈负相关,但与M2巨噬细胞的浸润和组织退化生物标志物的表达呈正相关,这表明免疫监视的缺陷和肿瘤迁移的风险。基于细胞衰老构建的6基因模型可以成为预测BRCA预后的有效指标[3]。
综上所述,TMEM233作为一种dispanins家族的跨膜蛋白,在神经系统和骨骼肌中表达,但其功能尚不明确。研究表明,TMEM233可能参与神经递质的释放和电压门控钠通道的调节,具有潜在的药物靶标价值[1]。此外,TMEM233在骨骼肌的表观遗传学和表达中发挥作用,并与一些疾病相关[2]。最近的研究还表明,TMEM233与细胞衰老相关,可能成为预测乳腺癌预后的有效指标[3]。这些研究结果为TMEM233的生物学功能和疾病发生机制提供了新的见解,并为疾病的治疗和预防提供了潜在的靶标和策略。
参考文献:
1. Deuis, Jennifer R, Klasfauseweh, Tabea, Walker, Lucinda, Vetter, Irina. 2024. The 'dispanins' and related proteins in physiology and neurological disease. In Trends in neurosciences, 47, 622-634. doi:10.1016/j.tins.2024.06.004. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39025729/
2. Ehrlich, Kenneth C, Lacey, Michelle, Ehrlich, Melanie. 2020. Epigenetics of Skeletal Muscle-Associated Genes in the ASB, LRRC, TMEM, and OSBPL Gene Families. In Epigenomes, 4, . doi:10.3390/epigenomes4010001. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34968235/
3. Zhang, Xiu-Xia, Yu, Xin, Zhu, Li, Luo, Jun-Hua. . Establishment of a 6-signature risk model associated with cellular senescence for predicting the prognosis of breast cancer. In Medicine, 102, e35923. doi:10.1097/MD.0000000000035923. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37986376/