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C57BL/6JCya-Taf9bem1flox/Cya 条件性基因敲除小鼠
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产品名称:
Taf9b-flox
产品编号:
S-CKO-11190
品系背景:
C57BL/6JCya
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编辑策略
品系名称
C57BL/6JCya-Taf9bem1flox/Cya
品系编号
CKOCMP-407786-Taf9b-B6J-VA
产品编号
S-CKO-11190
基因名
Taf9b
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
Taf9l
NCBI ID
修饰方式
条件性基因敲除
NCBI RefSeq
NM_001167988.1
Ensembl ID
ENSMUST00000113495
靶向范围
Exon 2~5
敲除长度
~3.4 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
MGI:3039562 Male chimeras hemizygous for a gene trapped allele appear normal at E9.5.
基因研究概述
Taf9b,也称为TBP-associated factor 9B,是TBP(TATA box binding protein)相关因子家族的一员。TBP是转录因子TFIID复合体的核心组成部分,而TFIID复合体是RNA聚合酶II转录复合物的重要组成部分。Taf9b作为一种转录因子,在基因表达调控中发挥着重要作用。
研究发现,Taf9b在神经元的基因表达中起着关键作用。在体外神经元分化过程中,Taf9b的表达水平会升高,并且对于特定神经元基因的转录诱导至关重要[1]。此外,Taf9b还能够与神经元基因的启动子和远端增强子结合,部分地与OLIG2结合位点重叠,而OLIG2是神经元分化的重要激活因子[1]。这些结果表明,Taf9b通过与其他转录因子的相互作用,在神经元基因的转录调控中发挥着重要作用。
除了在神经元中的作用,Taf9b在其他生物学过程中也发挥着重要作用。研究发现,miR-199可以通过靶向Taf9b来加重阿霉素诱导的心肌毒性[2]。此外,Taf9b的基因表达在牛的繁殖相关基因中也存在差异,这表明Taf9b在繁殖过程中也发挥着重要作用[3]。此外,Taf9b的基因表达在胚胎生殖细胞发育过程中也存在动态和调控性的变化[4]。这些研究结果表明,Taf9b在多种生物学过程中发挥着重要作用,并且与多种疾病的发生和发展密切相关。
此外,研究发现,Taf9b与p53之间存在调控关系。p53是一种重要的肿瘤抑制因子,参与调控细胞周期、DNA损伤修复和细胞凋亡等生物学过程。研究发现,p53可以转录抑制sno-miR-28,而sno-miR-28可以靶向Taf9b,进而影响p53的稳定性和下游p53调控的信号通路[5]。这表明Taf9b与p53之间存在复杂的调控关系,并且这种调控关系可能参与了肿瘤的发生和发展。
此外,研究发现,Taf9b在骨关节炎的转录调控中也发挥着重要作用。在骨关节炎的转录调控中,Taf9b与其他基因之间存在差异性的共表达网络,并且这些共表达网络与骨关节炎的发病机制密切相关[6]。这表明Taf9b在骨关节炎的转录调控中发挥着重要作用。
此外,研究发现,Taf9b与其他TAF家族成员存在一些相似性和差异性。Taf9b与TAF9在TFIID复合体中具有一些相似的功能,但它们在转录调控过程中也存在着一些差异性的作用[7]。这表明Taf9b与其他TAF家族成员之间存在一些相似性和差异性,并且这种差异性的作用可能参与了基因表达的精细调控。
综上所述,Taf9b作为一种转录因子,在基因表达调控中发挥着重要作用。Taf9b在神经元的基因表达、心肌毒性、繁殖相关基因表达、胚胎生殖细胞发育、肿瘤的发生和发展、骨关节炎的转录调控以及与其他TAF家族成员的相互作用等方面发挥着重要作用。深入研究Taf9b的功能和调控机制,有助于我们更好地理解基因表达的调控过程,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献:
1. Herrera, Francisco J, Yamaguchi, Teppei, Roelink, Henk, Tjian, Robert. 2014. Core promoter factor TAF9B regulates neuronal gene expression. In eLife, 3, e02559. doi:10.7554/eLife.02559. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25006164/
2. Yu, Yangsheng, Guo, Degang, Zhao, Lin. 2022. MiR-199 Aggravates Doxorubicin-Induced Cardiotoxicity by Targeting TAF9b. In Evidence-based complementary and alternative medicine : eCAM, 2022, 4364779. doi:10.1155/2022/4364779. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35873641/
3. Ross, Elizabeth M, Sanjana, Hari, Nguyen, Loan T, Moore, Stephen S, Hayes, Ben J. 2022. Extensive Variation in Gene Expression is Revealed in 13 Fertility-Related Genes Using RNA-Seq, ISO-Seq, and CAGE-Seq From Brahman Cattle. In Frontiers in genetics, 13, 784663. doi:10.3389/fgene.2022.784663. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35401673/
4. Gura, Megan A, Mikedis, Maria M, Seymour, Kimberly A, Page, David C, Freiman, Richard N. 2020. Dynamic and regulated TAF gene expression during mouse embryonic germ cell development. In PLoS genetics, 16, e1008515. doi:10.1371/journal.pgen.1008515. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31914128/
5. Yu, Feng, Bracken, Cameron P, Pillman, Katherine A, Callen, David F, Neilsen, Paul M. 2015. p53 Represses the Oncogenic Sno-MiR-28 Derived from a SnoRNA. In PloS one, 10, e0129190. doi:10.1371/journal.pone.0129190. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26061048/
6. Buzzatto-Leite, I, Afonso, J, Silva-Vignato, B, Coutinho, L L, Alvares, L E. 2022. Differential gene co-expression network analyses reveal novel molecules associated with transcriptional dysregulation of key biological processes in osteoarthritis knee cartilage. In Osteoarthritis and cartilage open, 4, 100316. doi:10.1016/j.ocarto.2022.100316. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36474801/
7. Frontini, Mattia, Soutoglou, Evi, Argentini, Manuela, Scheer, Elisabeth, Tora, Làszlò. . TAF9b (formerly TAF9L) is a bona fide TAF that has unique and overlapping roles with TAF9. In Molecular and cellular biology, 25, 4638-49. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15899866/
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