智鼠故事 
C57BL/6JCya-F3em1flox/Cya 条件性基因敲除小鼠
复苏/繁育服务
产品名称：
F3-flox
产品编号：
S-CKO-02322
品系背景：
C57BL/6JCya
* 使用本品系发表的文献需注明：F3-flox mice (Strain S-CKO-02322) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
只
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-F3em1flox/Cya
品系编号
CKOCMP-14066-F3-B6J-VA
产品编号
S-CKO-02322
基因名
F3
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
TF；Cf3；Cf-3；CD142
NCBI号
修饰方式
条件性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
MGI:88381 Homozygotes for targeted null mutations exhibit impaired blood vessel development, retarded growth, and, in most cases, midgestational lethality. On a mixed background, some mutants survive to birth and appear to be normal.
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
活体
环境标准
SPF
供应地区
中国
品系详情
F3位于小鼠的3号染色体，采用基因编辑技术，通过高通量电转受精卵方式，获得F3基因条件性敲除小鼠，性成熟后取精子冻存。
F3-flox小鼠模型是由赛业生物（Cyagen）利用基因编辑技术构建的条件性敲除小鼠。F3基因位于小鼠3号染色体上，包含6个外显子，其中ATG起始密码子在1号外显子，TAG终止密码子在6号外显子。条件性敲除区域（cKO区域）位于2号外显子，包含106个碱基对的编码序列。删除该区域会导致小鼠F3基因功能的丧失。F3-flox小鼠模型的构建过程包括将核糖核蛋白（RNP）和靶向载体共同注入受精卵。随后，对出生的小鼠进行PCR和测序分析进行基因型鉴定。携带条件性敲除等位基因的小鼠表现出血管发育受损、生长迟缓和在大多数情况下中孕期死亡。在混合背景下，一些突变体能够存活至出生并表现出正常状态。此外，对携带敲除等位基因的小鼠的敲除2号外显子会导致基因移码，覆盖了编码区域的12.02%。5'-loxP位点的插入区域位于第一号内含子，大小为1174个碱基对，3'-loxP位点的插入区域位于第二号内含子，大小为4254个碱基对。有效的cKO区域大小约为1.2 kb。该策略是基于现有数据库中的遗传信息设计的。由于生物过程的复杂性，现有技术水平的限制，不能预测loxP插入对基因转录、RNA剪接和蛋白质翻译的风险。F3-flox小鼠模型可用于研究F3基因在小鼠体内的功能。
基因研究概述
F3基因是一种重要的基因，在多种生物学过程中发挥着关键作用。F3基因属于免疫球蛋白超基因家族（IgSF），编码一种神经细胞表面黏附糖蛋白，分子量约为135 kDa。F3基因在神经细胞之间介导异嗜性接触形成，参与控制神经突生长，并在神经发育过程中发挥重要作用。F3基因的表达受到精细调控，仅在特定的神经亚群中表达，提示F3基因的表达调控可能具有形态发生的相关性[1]。
F3基因的启动子区域包括一个短的114 bp序列，能够指导报告基因在F3表达和非表达细胞中的表达。此外，F3基因的启动子区域还包括一个细胞类型特异性增强子，仅在F3表达的细胞中活性，表明F3基因的表达可能受到细胞类型特异性和/或发育调节的转录因子的调控。这些转录因子主要包括同源盒含有转录因子，这表明F3基因的表达调控可能是发育程序的一部分[1]。
F3基因的编码区由多个外显子组成，包括两个C2结构域编码的外显子和N端、信号肽和5'非翻译区编码的外显子。F3基因的5'非翻译区包含四个未翻译的外显子，这些外显子经过复杂的剪接事件，可以形成11种不同的F3 mRNA 5'端排列。F3基因的调控区域超过80 kb，包含非常大的内含子，并包括四个未翻译的外显子，这些外显子经过复杂的剪接事件，可以形成11种不同的F3 mRNA 5'端排列。F3基因的调控区域包含三个神经特异性启动子，分别与三个不同的5'外显子（A1、C1、0）相关联，这些启动子驱动两种不同的F3基因表达模式。A1外显子相关启动子的活性仅发生微小的发育变化，可能对F3基因的基础水平表达有贡献；而C1外显子和0外显子相关启动子的活性在出生后第一周结束时显著上调。这些数据表明，F3基因在发育过程中的差异表达可能依赖于不同启动子元件的替代利用，并可能涉及5'非翻译区外显子的复杂剪接事件。F3基因的调控区域还包含多个同源盒转录因子的保守序列，与同源盒基因调控神经形态发生分子的假设相符[2]。
F3基因在神经系统的发育和功能中发挥重要作用。F3基因的表达在出生后逐渐增加，并在出生后第七天达到峰值，然后在大脑皮层中逐渐下降，而在小脑中持续增加。F3基因的表达主要发生在辅助嗅觉球、大脑皮层II/III和V层、梨形皮层、前丘脑核、桥脑蓝斑和脑桥三叉神经核以及小脑浦肯野细胞中。F3基因的剪接异构体缺乏原始NB-3中的62至78位氨基酸残基，这部分构成了第一个免疫球蛋白样结构域的一部分。通过报告基因分析，发现F3基因5'侧翼区域的1.2 kb片段在潜在的转录起始位点上游具有基础启动子活性[4]。
F3基因的突变和表达异常与多种疾病的发生和发展相关。例如，F3基因的突变可能导致神经发育障碍和神经系统疾病。此外，F3基因的表达异常可能与癌症的发生和发展相关。F3基因的过表达可能导致神经母细胞瘤等癌症的发生和发展，而F3基因的沉默可能导致某些神经退行性疾病的发生[3]。
综上所述，F3基因是一种重要的基因，在神经系统的发育和功能中发挥重要作用。F3基因的表达受到精细调控，并与多种疾病的发生和发展相关。F3基因的研究有助于深入理解神经系统的发育和功能，以及相关疾病的发生机制，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献：
1. Buttiglione, M, Cangiano, G, Goridis, C, Gennarini, G. . Characterization of the 5' and promoter regions of the gene encoding the mouse neuronal cell adhesion molecule F3. In Brain research. Molecular brain research, 29, 297-309. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/7609617/
2. De Benedictis, L, Polizzi, A, Cangiano, G, Rocchi, M, Gennarini, G. . Alternative promoters drive the expression of the gene encoding the mouse axonal glycoprotein F3/contactin. In Brain research. Molecular brain research, 95, 55-74. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11687277/
3. McLachlan, A. . Drosophila forked locus. In Molecular and cellular biology, 6, 1-6. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/3023816/
4. Lee, S, Takeda, Y, Kawano, H, Takahashi, N, Watanabe, K. . Expression and regulation of a gene encoding neural recognition molecule NB-3 of the contactin/F3 subgroup in mouse brain. In Gene, 245, 253-66. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/10717476/
