Nkpd1-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Nkpd1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-13102

品系全称

C57BL/6JCya-Nkpd1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-69547-Nkpd1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Nkpd1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-13102) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
NTPase, KAP family P-loop domain containing 1
基因别称
2310015G09Rik
染色体号
Chr 7 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_027116.1 | Ensembl: ENSMUST00000078908
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1~4
敲除长度
~6042 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
基因NKPD1,也称为Necrostatin-1-like protein domain containing 1,是一种编码NKPD1蛋白的基因。NKPD1蛋白被认为与细胞死亡过程和细胞膜功能有关。NKPD1基因在人类疾病中的作用目前尚不清楚,但是最近的研究表明,该基因可能与一些遗传性皮肤病和其他疾病有关。

据一项研究报道,NKPD1基因中的杂合错义变异(ENST00000686631.1:c.1372G>T, p.[Val458Phe])与常染色体显性鱼鳞病有关。鱼鳞病是一种罕见的皮肤病,其特点是皮肤干燥、鳞片状。这项研究通过全外显子测序在7个来自德国四代家族的受影响个体中发现了这种变异。该变异在受影响个体中存在,并通过分离分析得到了证实,其优势比分数为3.31。NKPD1基因编码的NKPD1蛋白被认为与细胞膜有关,其在人类疾病中的作用目前尚不清楚。皮肤组织学检查显示受影响个体有中度棘层肥厚和致密正角化,超微结构与ASPRV1相关常染色体显性鱼鳞病有明显差异。虽然NKPD1 mRNA在角质形成细胞分化过程中表达增加,但角质层神经酰胺没有显著变化。然而,受影响个体显示出结合蛋白的神经酰胺与ω-酯化神经酰胺的比例升高。这突出了NKPD1在常染色体显性鱼鳞病中的作用,影响神经酰胺代谢和皮肤脂质屏障形成,这通过功能特征得到了证实[1]。

另一项研究表明,NKPD1基因中的非同义变异与欧洲人群中抑郁症状的增加有关。尽管抑郁症状的遗传性很高,但通过全基因组关联研究来映射与抑郁相关特征的遗传决定因素并没有取得很大成功。为了确定与抑郁症状相关的基因,研究人员对来自荷兰的一个遗传隔离人群(n = 1999)进行了基于基因的非同义变异分析,这些变异是通过外显子测序和外显子芯片基因分型捕获的。他们还在一个独立的基于人群的队列(n = 1604)中重复了他们的显著发现。研究人员发现,抑郁症状与NKPD1基因显著相关(p = 3.7 × 10-08)。NKPD1基因中的非同义变异解释了发现研究中抑郁症状的性别和年龄调整变异性的0.9%,相当于总估计遗传率的3.8%(h2 = 0.24)。在独立的复制样本中,也观察到了抑郁症状与NKPD1显著相关(n = 1604;p = 1.5 × 10-03),尽管发现队列和复制队列在NKPD1基因中观察到的非同义遗传变异集重叠较少。发现研究和复制研究的荟萃分析增强了关联信号(p = 1.0 × 10-09)。这项研究表明,NKPD1基因中的非同义变异影响一般人群的抑郁症状。NKPD1基因预测参与鞘脂质的从头合成,而鞘脂质与抑郁的发病机制有关[2]。

综上所述,NKPD1基因编码的NKPD1蛋白在皮肤屏障功能和神经酰胺代谢中发挥重要作用,并与常染色体显性鱼鳞病有关。此外,NKPD1基因中的非同义变异与抑郁症状的增加有关,提示该基因可能参与抑郁的发病机制。这些发现为理解NKPD1基因的功能和其在人类疾病中的作用提供了新的见解,并为开发针对相关疾病的治疗策略提供了潜在靶点。

参考文献:
1. Komlosi, Katalin, Glocker, Cristina, Hsu-Rehder, Hao-Hsiang, Oji, Vinzenz, Fischer, Judith. 2024. Autosomal Dominant Lamellar Ichthyosis Due to a Missense Variant in the Gene NKPD1. In The Journal of investigative dermatology, 144, 2754-2763.e6. doi:10.1016/j.jid.2024.03.041. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38642798/
2. Amin, Najaf, Belonogova, Nadezhda M, Jovanova, Olivera, Axenovich, Tatiana I, van Duijn, Cornelia M. 2016. Nonsynonymous Variation in NKPD1 Increases Depressive Symptoms in European Populations. In Biological psychiatry, 81, 702-707. doi:10.1016/j.biopsych.2016.08.008. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27745872/