Ddi2-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Ddi2-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-12851

品系全称

C57BL/6NCya-Ddi2em1/Cya

品系背景

C57BL/6NCya

品系编号

KOCMP-68817-Ddi2-B6N-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Ddi2-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-12851) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
DNA-damage inducible protein 2
基因别称
1110056G13Rik,1700027M01Rik,9130022E05Rik
染色体号
Chr 4 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001017966 | Ensembl: ENSMUST00000102484
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~4
敲除长度
~2.5 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Ddi2,全称为DNA损伤诱导基因2(DNA-damage inducible 1 homolog 2),是一种在多种生物过程中发挥重要作用的基因。在酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)中,Ddi2基因编码一种称为Ddi2的蛋白质,该蛋白质是一种金属酶,具有氰酰胺(CY)水解酶的活性。氰酰胺是一种常用的植物生长调节剂和戒酒药物,其生物效应需要催化酶Ddi2的参与。Ddi2在细胞中具有多种功能,包括调节基因表达、细胞应激适应、DNA损伤修复和金属毒性响应等。

Ddi2基因的表达可以被氰酰胺和甲基甲烷磺酸盐(MMS)等DNA损伤剂诱导,这表明Ddi2可能参与了DNA损伤响应过程。此外,Ddi2基因的表达还可以被转录因子Fzf1激活,Fzf1是一种锌指转录激活因子,在氰酰胺和MMS处理下,Fzf1可以被化学修饰,进而激活Ddi2基因的表达[2]。

Ddi2蛋白是一种金属酶,属于HD结构域金属酶家族,具有锌离子结合位点。Ddi2蛋白在细胞中具有多种功能,包括氰酰胺水解酶活性、蛋白酶活性、泛素连接酶活性等。Ddi2蛋白可以催化氰酰胺的水解,将其转化为尿素,从而减轻氰酰胺对细胞的毒性。此外,Ddi2蛋白还具有蛋白酶活性,可以切割转录因子NRF1,从而激活NRF1介导的基因表达程序。NRF1是一种重要的转录因子,参与调节细胞的应激适应和解毒代谢过程。Ddi2蛋白的蛋白酶活性还可以切割其他蛋白质,例如转录因子NFE2L1,从而影响细胞内的信号传导和基因表达[1]。

Ddi2蛋白的泛素连接酶活性可以介导蛋白质的泛素化修饰,从而影响蛋白质的降解和功能。例如,Ddi2蛋白可以与泛素连接酶E3结合,将泛素分子连接到其他蛋白质上,从而促进这些蛋白质的降解。此外,Ddi2蛋白还可以与DDB1-CUL4复合物结合,参与DNA损伤修复和细胞应激响应过程[3]。

Ddi2基因和蛋白在多种生物过程中发挥重要作用,包括基因表达调控、细胞应激适应、DNA损伤修复和金属毒性响应等。Ddi2基因和蛋白的研究有助于深入理解这些生物过程的分子机制,为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Dirac-Svejstrup, A Barbara, Walker, Jane, Faull, Peter, Powell, David J, Svejstrup, Jesper Q. 2020. DDI2 Is a Ubiquitin-Directed Endoprotease Responsible for Cleavage of Transcription Factor NRF1. In Molecular cell, 79, 332-341.e7. doi:10.1016/j.molcel.2020.05.035. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32521225/
2. Lin, Aiyang, Chumala, Paulos, Du, Ying, Katselis, George S, Xiao, Wei. 2022. Transcriptional activation of budding yeast DDI2/3 through chemical modifications of Fzf1. In Cell biology and toxicology, 39, 1531-1547. doi:10.1007/s10565-022-09745-x. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35809138/
3. Gao, Lanyang, Yang, Shuzhang, Zhu, Yunye, Liu, Yongsheng, Wang, Songhu. 2015. The tomato DDI2, a PCNA ortholog, associating with DDB1-CUL4 complex is required for UV-damaged DNA repair and plant tolerance to UV stress. In Plant science : an international journal of experimental plant biology, 235, 101-10. doi:10.1016/j.plantsci.2015.03.007. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25900570/