Ly6g6c-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Ly6g6c-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-12723

品系全称

C57BL/6JCya-Ly6g6cem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-68468-Ly6g6c-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Ly6g6c-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-12723) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
lymphocyte antigen 6 family member G6C
基因别称
1110003M04Rik,G6c,NG24
染色体号
Chr 17 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_023463.3 | Ensembl: ENSMUST00000173478
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~3
敲除长度
~665 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
基因Ly6g6c,也称为Lymphocyte Antigen 6 (Ly-6)家族成员,编码一种细胞表面蛋白。Ly-6家族成员是一类富含半胱氨酸的蛋白,通常具有糖基化修饰,并可能在细胞粘附、迁移、免疫调节和细胞信号传导中发挥作用[4]。Ly6g6c基因位于主要组织相容性复合体(MHC)的Ⅲ类区域,与人类和小鼠基因组中的其他Ly-6家族成员紧密相连。

在人类和小鼠的MHC区域,共有27个Ly-6家族成员被描述,而Ly6g6c是其中一个[4]。Ly6g6c基因编码的蛋白是一种糖基化、GPI锚定的细胞表面蛋白,主要在细胞的尖端和丝状伪足中高度表达,这些区域通常参与细胞粘附和迁移[4]。此外,研究发现,Ly6g6c基因的表达受到内含子保留和转录诱导的嵌合体(TIC)的调控[5]。内含子保留事件会导致生成一个非编码的转录本,该转录本富含细胞,并具有稳定性,不易受到无义介导的降解(NMD)的影响[5]。此外,Ly6g6c基因还可以与其邻近的基因形成嵌合体转录本,如CSNKbeta-LY6G5B和G6F-LY6G6C,这些嵌合体转录本可能具有不同的生物学功能[5]。

在功能上,Ly6g6c基因的表达与多种生物学过程相关。例如,研究发现,在结直肠癌中,Ly6g6c基因的表达与患者总生存期相关,是结直肠癌患者的独立预后因素[3]。此外,Ly6g6c基因的表达还与克罗恩病的发生发展相关,其在克罗恩病患者中的表达水平显著高于健康人群[2]。此外,研究发现,Ly6g6c基因的表达与口腔黏膜炎的严重程度相关,在临床无/轻度黏膜炎患者中,Ly6g6c基因的表达上调,而在溃疡性黏膜炎患者中则没有上调[1]。

综上所述,基因Ly6g6c编码一种重要的细胞表面蛋白,参与细胞粘附、迁移、免疫调节和细胞信号传导等生物学过程。Ly6g6c基因的表达受到内含子保留和转录诱导的嵌合体(TIC)的调控。此外,Ly6g6c基因的表达与多种疾病的发生发展相关,包括结直肠癌、克罗恩病和口腔黏膜炎等。因此,Ly6g6c基因可能是一个有价值的生物标志物和治疗靶点。

参考文献:
1. Marcussen, Mette, Sønderkær, Mads, Bødker, Julie Støve, Vyberg, Mogens, Johnsen, Hans Erik. 2018. Oral mucosa tissue gene expression profiling before, during, and after radiation therapy for tonsil squamous cell carcinoma. In PloS one, 13, e0190709. doi:10.1371/journal.pone.0190709. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29338018/
2. Brodziak, Frances, Meharg, Caroline, Blaut, Michael, Loh, Gunnar. 2013. Differences in mucosal gene expression in the colon of two inbred mouse strains after colonization with commensal gut bacteria. In PloS one, 8, e72317. doi:10.1371/journal.pone.0072317. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23951309/
3. Zhang, Zhiqiao, Huang, Liwen, Li, Jing, Wang, Peng. 2022. Bioinformatics analysis reveals immune prognostic markers for overall survival of colorectal cancer patients: a novel machine learning survival predictive system. In BMC bioinformatics, 23, 124. doi:10.1186/s12859-022-04657-3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35395711/
4. Mallya, Meera, Campbell, R Duncan, Aguado, Begoña. . Characterization of the five novel Ly-6 superfamily members encoded in the MHC, and detection of cells expressing their potential ligands. In Protein science : a publication of the Protein Society, 15, 2244-56. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17008713/
5. Calvanese, Vincenzo, Mallya, Meera, Campbell, R Duncan, Aguado, Begoña. 2008. Regulation of expression of two LY-6 family genes by intron retention and transcription induced chimerism. In BMC molecular biology, 9, 81. doi:10.1186/1471-2199-9-81. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18817541/