Gar1-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Gar1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-12619

品系全称

C57BL/6JCya-Gar1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-68147-Gar1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Gar1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-12619) were purchased from Cyagen.
交付类型
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性别
基因型
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基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
GAR1 ribonucleoprotein
基因别称
C430047J18Rik,Nola1
染色体号
Chr 3 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_026578.3 | Ensembl: ENSMUST00000029643
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~7
敲除长度
~5641 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
GAR1,全称为GAR1 ribonucleoprotein,是H/ACA snoRNP(small nucleolar ribonucleoprotein)复合物的一个重要组分,参与前核糖体RNA(pre-rRNA)的加工和修饰过程。GAR1蛋白富含甘氨酸和精氨酸残基,这些残基构成了GAR结构域,这一结构域在多个核仁蛋白中都有发现,是核仁蛋白的一个特征性结构。GAR1蛋白与一小部分小核仁RNA(snoRNA)结合,这些snoRNA通过识别特定的RNA序列,指导GAR1蛋白对pre-rRNA进行修饰,如假尿苷化(pseudouridylation)和2'-O-甲基化(2'-O-methylation),这些修饰对于核糖体的成熟和功能至关重要。

在多种真核生物中,GAR1蛋白的同源物都被发现具有相似的功能。例如,酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)中的GAR1蛋白是细胞存活所必需的,它参与了pre-rRNA的加工过程,并且与一小部分snoRNA相关联,包括snR10和snR30[3]。在裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)中,GAR1蛋白的同源物SpGAR1也具有相似的功能,并且能够在酿酒酵母中取代GAR1蛋白的功能[2]。

GAR1蛋白在多种细胞过程中发挥重要作用,包括核糖体生物合成、细胞生长和维持细胞内环境的稳定。此外,GAR1蛋白的表达和功能异常与多种疾病的发生发展密切相关。例如,在慢性淋巴细胞白血病(CLL)中,GAR1蛋白的表达水平显著降低,这可能与CLL患者的基因组不稳定和端粒功能障碍有关[5]。在肝细胞癌(HCC)中,GAR1蛋白的表达水平显著升高,并且与患者的预后不良相关,这表明GAR1蛋白可能作为HCC的诊断和预后生物标志物[1]。

在核糖体生物合成过程中,GAR1蛋白与Cbf5蛋白形成复合物,Cbf5蛋白是一种RNA:假尿苷合成酶(PUS),负责将尿苷转化为假尿苷(Ψ)在rRNA中。研究发现,GAR1蛋白对于Cbf5蛋白在RNA引导和非RNA引导的rRNA假尿苷化过程中都起着重要作用[4]。此外,GAR1蛋白还与核糖体RNA加工相关的其他蛋白质相互作用,如纤维拉林(fibrillarin)和SMN蛋白,这些相互作用对于核糖体RNA的成熟和功能也具有重要意义[6][7]。

GAR1蛋白在核仁中的定位对于其功能的发挥至关重要。研究发现,GAR1蛋白的中央结构域足以将其定位到核仁中,并且能够恢复GAR1缺陷菌株的生长[6]。此外,GAR1蛋白的核定位与其与其他核仁蛋白的相互作用有关,这表明GAR1蛋白可能通过与其他核仁蛋白的相互作用来定位到核仁[6]。

综上所述,GAR1蛋白是H/ACA snoRNP复合物的一个重要组分,参与前核糖体RNA的加工和修饰过程,对于核糖体的成熟和功能至关重要。GAR1蛋白在多种细胞过程中发挥重要作用,并且与多种疾病的发生发展密切相关。GAR1蛋白的研究有助于深入理解核糖体生物合成和RNA修饰的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Zhang, Mi, Zhao, Wei, Liu, Shanshan, Du, Chengyou, Jiang, Ning. 2021. H/ACA snoRNP Gene Family as Diagnostic and Prognostic Biomarkers for Hepatocellular Carcinoma. In Pharmacogenomics and personalized medicine, 14, 1331-1345. doi:10.2147/PGPM.S333838. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34703278/
2. Girard, J P, Caizergues-Ferrer, M, Lapeyre, B. . The SpGAR1 gene of Schizosaccharomyces pombe encodes the functional homologue of the snoRNP protein GAR1 of Saccharomyces cerevisiae. In Nucleic acids research, 21, 2149-55. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8502556/
3. Girard, J P, Lehtonen, H, Caizergues-Ferrer, M, Tollervey, D, Lapeyre, B. . GAR1 is an essential small nucleolar RNP protein required for pre-rRNA processing in yeast. In The EMBO journal, 11, 673-82. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/1531632/
4. Fujikane, Ryosuke, Behm-Ansmant, Isabelle, Tillault, Anne-Sophie, Motorin, Yuri, Charpentier, Bruno. 2018. Contribution of protein Gar1 to the RNA-guided and RNA-independent rRNA:Ψ-synthase activities of the archaeal Cbf5 protein. In Scientific reports, 8, 13815. doi:10.1038/s41598-018-32164-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30218085/
5. Dos Santos, Patricia Carolina, Panero, Julieta, Stanganelli, Carmen, Bezares, Raimundo, Slavutsky, Irma. 2017. Dysregulation of H/ACA ribonucleoprotein components in chronic lymphocytic leukemia. In PloS one, 12, e0179883. doi:10.1371/journal.pone.0179883. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28666010/
6. Girard, J P, Bagni, C, Caizergues-Ferrer, M, Amalric, F, Lapeyre, B. . Identification of a segment of the small nucleolar ribonucleoprotein-associated protein GAR1 that is sufficient for nucleolar accumulation. In The Journal of biological chemistry, 269, 18499-506. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8034598/
7. Pellizzoni, L, Baccon, J, Charroux, B, Dreyfuss, G. . The survival of motor neurons (SMN) protein interacts with the snoRNP proteins fibrillarin and GAR1. In Current biology : CB, 11, 1079-88. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11509230/