Rpp21-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Rpp21-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-12388

品系全称

C57BL/6JCya-Rpp21em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-67676-Rpp21-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Rpp21-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-12388) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
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基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
ribonuclease P 21 subunit
基因别称
0610037N01Rik
染色体号
Chr 17 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_026308.2 | Ensembl: ENSMUST00000025319
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1~5
敲除长度
~2122 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Rpp21,也称为Ribonuclease P/mrp 21kDa Subunit,是人体核糖核蛋白核糖核酸酶P(RNase P)的一个亚基。RNase P是一种负责生成成熟tRNA分子5'端的内切酶。Rpp21蛋白由位于主要组织相容性复合体(MHC)I类基因簇中的基因编码,与高度纯化的RNase P相关,并能够结合前体tRNA。Rpp21主要定位于核质中,但在高水平表达时也可在核仁和Cajal小体中被观察到。Rpp21前体mRNA中的内含子保留和剪接位点选择调节了蛋白产物的细胞核内分布及其与RNase P全酶的结合。研究表明,动态的核结构,包括核仁、核仁周围区域和Cajal小体,都参与了人类RNase P的产生和组装过程[4]。

在疾病研究中,Rpp21的表达与肝细胞癌(HCC)的细胞增殖和迁移相关。有研究发现,索非布韦(SOF)作为一种直接作用的抗病毒药物(DAA),在治疗丙型肝炎病毒(HCV)时,可能会增加发生HCC的风险。研究发现,SOF上调了包括PHOSPHO2和RPP21在内的多个基因的表达,这些基因在HCC的肿瘤组织中显著升高,并与HCC患者的预后不良相关[2]。此外,Rpp21的表达下调可以抑制SOF引起的HCC细胞增殖和迁移。

在遗传疾病研究中,Rpp21的变异与阿拉伯马幼年特发性癫痫(JIE)有关。一项研究发现,在JIE病例组中,TRIM39-RPP21基因读通区域的19bp缺失和三倍C插入(Δ19InsCCC)变异在所有病例中都有发现,而在其他阿拉伯马对照中没有发现。然而,另一项研究通过对埃及阿拉伯马的进一步研究,发现Δ19InsCCC变异与JIE之间没有显著的关联,表明这个变异可能是阿拉伯马种群中的常见变异,但与JIE的发生没有直接关联[1][3]。

在植物研究中,Rpp21的同源基因与拟南芥的抗病性相关。研究发现,拟南芥中的一些抗病性基因同源物,包括RPS2、RPM1、N和L6,与已知的抗病性位点RPS5、RAC1、RPP9、CAR1、RPP7、RPW2、RPP1、RPP10、RPP14、RPP5、RPP4、RPS2、RPW6、HRT、RPS4、RPP8、RPP21、RPP22、RPP23、RPP24和TTR1相关联[5]。

在自身免疫疾病研究中,Rpp21与系统性红斑狼疮(SLE)的皮肤表现——皮肤型红斑狼疮(CLE)相关。研究发现,TRIM39/RPP21读通转录本是干扰素反应的已知介质,而干扰素反应是CLE和SLE发病机制中的中心途径。这表明,Rpp21可能在CLE的发病机制中通过干扰素反应的失调发挥作用[6]。

在DNA甲基化研究中,Rpp21与多种癌症的DNA甲基化模式相关。研究发现,在烟草相关的癌症中,包括Rpp21在内的多个基因的DNA甲基化状态发生了改变。其中,Rpp21的甲基化状态改变与膀胱癌的预后相关,表明Rpp21的DNA甲基化可能在膀胱癌的发生发展中发挥作用[7][9]。

此外,Rpp21还与cGMP依赖性蛋白激酶I(PKGI)相互作用,这是一种调节血管平滑肌细胞(SMC)细胞骨架动力学和表型的激酶。研究发现,TRIM39R,一种含有Rpp21结构域的TRIM39变体,与PKGI相互作用,并被PKGI磷酸化。这表明,Rpp21可能通过影响PKGI的活性,进而调节细胞骨架动力学和基因表达[8]。

综上所述,Rpp21作为RNase P的一个亚基,在RNA的加工和成熟中发挥重要作用。同时,Rpp21的表达和变异与多种疾病的发生发展相关,包括肝细胞癌、幼年特发性癫痫、系统性红斑狼疮和膀胱癌等。Rpp21还可能通过影响PKGI的活性,进而调节细胞骨架动力学和基因表达。因此,Rpp21的研究对于理解RNA的加工和成熟、疾病的发生发展和细胞骨架动力学等方面具有重要意义。

参考文献:
1. Polani, S, Dean, M, Lichter-Peled, A, Avni, G, Kahila Bar-Gal, G. . Sequence Variant in the TRIM39-RPP21 Gene Readthrough is Shared Across a Cohort of Arabian Foals Diagnosed with Juvenile Idiopathic Epilepsy. In Journal of genetic mutation disorders, 1, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35465405/
2. Tsai, Wei-Lun, Cheng, Jin-Shiung, Liu, Pei-Feng, Chen, Wen-Chi, Shu, Chih-Wen. 2022. Sofosbuvir induces gene expression for promoting cell proliferation and migration of hepatocellular carcinoma cells. In Aging, 14, 5710-5726. doi:10.18632/aging.204170. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35833210/
3. Rivas, Victor N, Aleman, Monica, Peterson, Janel A, Hales, Erin N, Finno, Carrie J. 2019. TRIM39-RPP21 Variants (∆19InsCCC) Are Not Associated with Juvenile Idiopathic Epilepsy in Egyptian Arabian Horses. In Genes, 10, . doi:10.3390/genes10100816. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31623255/
4. Jarrous, N, Reiner, R, Wesolowski, D, Guerrier-Takada, C, Altman, S. . Function and subnuclear distribution of Rpp21, a protein subunit of the human ribonucleoprotein ribonuclease P. In RNA (New York, N.Y.), 7, 1153-64. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11497433/
5. Speulman, E, Bouchez, D, Holub, E B, Beynon, J L. . Disease resistance gene homologs correlate with disease resistance loci of Arabidopsis thaliana. In The Plant journal : for cell and molecular biology, 14, 467-74. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9670562/
6. Kunz, Manfred, König, Inke R, Schillert, Arne, Kuhn, Annegret, Ibrahim, Saleh M. 2015. Genome-wide association study identifies new susceptibility loci for cutaneous lupus erythematosus. In Experimental dermatology, 24, 510-5. doi:10.1111/exd.12708. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25827949/
7. Liu, Xingyu, Chen, Jiarui, Li, Jiali, Gong, Yan, Xie, Conghua. 2021. Comprehensive analysis reveals common DNA methylation patterns of tobacco-associated cancers: A pan-cancer analysis. In Gene, 804, 145900. doi:10.1016/j.gene.2021.145900. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34400279/
8. Roberts, Jesse D, Chiche, Jean-Daniel, Kolpa, Emily M, Bloch, Donald B, Bloch, Kenneth D. 2007. cGMP-dependent protein kinase I interacts with TRIM39R, a novel Rpp21 domain-containing TRIM protein. In American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology, 293, L903-12. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17601797/
9. Zhang, Jianzhong, Chen, Junyan, Xu, Manrou, Zhu, Tong. 2024. Exploring prognostic DNA methylation genes in bladder cancer: a comprehensive analysis. In Discover oncology, 15, 331. doi:10.1007/s12672-024-01206-7. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39095590/