Ccdc198-KO 基因敲除小鼠

基因CCDC198，也称为C14orf105或1700011H14Rik，是一个在哺乳动物和鸟类中具有高度进化分歧的基因。该基因编码的蛋白质被命名为FAME（Factor Associated with Metabolism and Energy），意味着它与代谢和能量平衡有关。通过基因敲除实验，研究者发现FAME基因的缺失会导致动物体重增加和能量消耗减少，这与人类中FAME基因与较高体重指数相关的全基因组关联研究结果一致。此外，FAME基因的表达和亚细胞定位分析表明，FAME是一种在肾脏中富集的膜结合蛋白。尽管基因敲除的动物肾脏结构正常，但研究者发现尿液中的白蛋白含量增加，血液中的铁蛋白含量降低。通过实验验证，研究者证实了FAME与铁蛋白之间的相互作用，并展示了它们在囊泡和质膜中的共定位[1]。

在另一项研究中，研究者分析了西非矮种羊Djallonké的拷贝数变异（CNV）区域。他们使用Ovine 50K SNP BeadChip基因分型数据和两种不同的CNV调用平台：PennCNV和QuantiSNP，对184只Djallonké羊进行分析。通过基因注释富集分析，研究者确定了751个潜在的候选绵羊基因，这些基因位于候选CNVR的边界上。功能注释揭示了5个具有统计学意义的富集功能簇（FC；富集因子>1.3），涉及61个候选基因。所有形成显著富集FC的基因都位于绵羊染色体（OAR）21上。FC1（包括PAG4和PAG6）和FC5（包括CTSC、CTSW和CTSF），编码蛋白酶（肽酶和溶酶体），参与生殖性能和妊娠的调节。FC3和FC4涉及炎症和免疫反应，分别编码血清淀粉样蛋白A和B-box型锌指蛋白。FC2由27个基因组成（包括OR10G6和OR8B8），这些基因参与嗅觉受体活性，对于动物适应新的食物资源至关重要。在至少15%的个体中发现的CNVR热点与先前报道的与脂质代谢、乳腺差异表达和乳制品性状相关的数量性状位点（QTL）重叠。在OAR5上跨越基因SKP1、TCF7、JADE2、UBE2B和SAR1B的CNVR热点与脂质代谢相关的QTL重叠，在OAR7上跨越基因CCDC198和SLC35F4的CNVR热点与乳蛋白产量和乳脂百分比相关的QTL重叠。从自然适应恶劣环境的当地绵羊群体中获得的这些信息有助于增加我们对CNV基因组重要性的理解[2]。

综上所述，基因CCDC198编码的FAME蛋白在代谢和能量平衡中发挥重要作用。FAME基因的缺失会导致体重增加和能量消耗减少，并且与肾脏功能和铁蛋白代谢相关。此外，CCDC198基因在绵羊中的CNV区域与脂质代谢和乳制品性状相关，表明该基因可能在动物适应环境方面发挥重要作用。这些研究结果有助于我们深入理解FAME蛋白的生物学功能和其在动物和人类健康中的作用机制。