Pxdc1-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Pxdc1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-11983

品系全称

C57BL/6JCya-Pxdc1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-66895-Pxdc1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Pxdc1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-11983) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
PX domain containing 1
基因别称
1300014I06Rik
染色体号
Chr 13 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_025831.3 | Ensembl: ENSMUST00000053459
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~4
敲除长度
~8748 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
PXDC1(Pyroglutamyl peptidase domain containing 1)是一种基因,其编码的蛋白质包含一个焦谷氨酸肽酶结构域。PXDC1基因位于人类染色体13q21.2,这个区域在多个研究中都被认为是基因组印记区域。基因组印记是指来自父母双方的等位基因中,一个等位基因的表达被抑制,而另一个等位基因的表达被激活。PXDC1基因与FAM50B基因相邻,FAM50B是一个已知由父亲表达的印记基因。PXDC1基因的印记特性是通过分析RNA测序数据来确定的,这些数据来自296个家庭的三代成员,这些数据被用于构建了一个高分辨率的基因组印记图谱。研究发现,PXDC1基因显示出2:1的父系表达偏倚,这意味着该基因主要表达来自父亲遗传的等位基因[1]。

在另一项研究中,研究者使用来自306个胡特尔人(Hutterites)的淋巴母细胞系进行等位基因特异性表达分析,这些胡特尔人具有单一的家族谱系。通过这种方式,他们确定了PXDC1基因是一个新的印记基因候选者,并发现PXDC1基因的表达具有父系偏倚[2]。此外,研究还发现PXDC1基因的表达模式与其他印记基因相似,其启动子区域与已知印记基因的DNA甲基化模式相一致,这为PXDC1基因的印记特性提供了独立验证。

PXDC1基因的研究不仅局限于人类,还包括小鼠和大鼠等动物模型。在比较毒理蛋白质组学的研究中,研究者评估了不同小鼠和大鼠对2,3,7,8-四氯二苯并-p-二噁英(TCDD)毒性的反应。研究发现,PXDC1基因在所有三种对TCDD敏感的动物模型中都被显著抑制。这表明PXDC1基因可能在TCDD的毒性反应中发挥作用,尽管其具体机制尚不清楚[3]。

综上所述,PXDC1基因是一个印记基因,主要表达来自父亲遗传的等位基因。PXDC1基因的表达模式与印记基因相似,并且与DNA甲基化模式相一致。PXDC1基因的研究有助于深入理解基因组印记的生物学功能和疾病发生机制。此外,PXDC1基因在TCDD毒性反应中的作用也需要进一步研究。

参考文献:
1. Jadhav, Bharati, Monajemi, Ramin, Gagalova, Kristina K, Sharp, Andrew J, Kiełbasa, Szymon M. 2019. RNA-Seq in 296 phased trios provides a high-resolution map of genomic imprinting. In BMC biology, 17, 50. doi:10.1186/s12915-019-0674-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31234833/
2. Mozaffari, Sahar V, Stein, Michelle M, Magnaye, Kevin M, Nicolae, Dan L, Ober, Carole. 2018. Parent of origin gene expression in a founder population identifies two new candidate imprinted genes at known imprinted regions. In PloS one, 13, e0203906. doi:10.1371/journal.pone.0203906. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30204804/
3. Prokopec, Stephenie D, Lu, Aileen, Lee, Sandy Che-Eun S, Pohjanvirta, Raimo, Boutros, Paul C. 2019. Comparative toxicoproteogenomics of mouse and rat liver identifies TCDD-resistance genes. In Archives of toxicology, 93, 2961-2978. doi:10.1007/s00204-019-02560-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31511937/