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Prkrip1-KO 基因敲除小鼠

Prkrip1-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Prkrip1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-11918

品系全称

C57BL/6JCya-Prkrip1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-66801-Prkrip1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明： Prkrip1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-11918) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
KO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
Prkr interacting protein 1 (IL11 inducible)
基因别称
8430424D23Rik，C114
染色体号
Chr 5 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_025774.3 | Ensembl: ENSMUST00000151786
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~5
敲除长度
~8307 bp
下载方案
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
更多信息
Prkrip1，即PRKR-interacting protein 1，是一种在生物医学领域受到关注的基因。该基因编码的蛋白质是剪接体C复合体的一部分，而剪接体C复合体是负责选择和连接剪接位点的关键因子。剪接体在基因表达过程中起着至关重要的作用，它能够将非编码的内含子序列从RNA前体分子中移除，并将编码的外显子序列连接起来，从而生成成熟的mRNA分子。Prkrip1在剪接体的结构和功能中发挥着不可或缺的作用。

Prkrip1的表达水平与结直肠癌（CRC）的预后密切相关。研究表明，Prkrip1的高表达与结直肠癌患者的不良预后相关[1]。在The Cancer Genome Atlas (TCGA)和Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE)数据集中，Prkrip1的表达与拷贝数变异显著相关，且其突变频率低于5%。此外，免疫组化染色结果显示，Prkrip1主要定位于肿瘤细胞的细胞质中。基因集富集分析（GSEA）表明，Prkrip1的表达与凋亡相关基因集相关。这些发现表明，Prkrip1的表达可能与结直肠癌的进展和不良预后相关。

为了进一步了解Prkrip1在剪接体中的功能，科学家们利用冷冻电子断层扫描技术获得了人类剪接体的原子结构。在剪接体C*复合体中，Prkrip1形成了一个长约100Å的α螺旋，连接了U2 snRNP和剪接体的催化中心[2]。这一结构特征揭示了Prkrip1在剪接体中的重要作用，它可能参与了剪接体的组装和功能调节。

此外，Prkrip1还与中性粒细胞胞外陷阱（NETs）的形成相关。研究发现，Prkrip1与SERTAD2、ELFN1和LINC00672共同构成了一个预测结直肠癌患者预后的四基因模型。该模型能够准确预测患者预后，并揭示了NETs高水平与更好的生存率相关[3]。这些发现表明，Prkrip1不仅与剪接体的结构和功能相关，还可能参与了免疫调节和肿瘤微环境的形成。

综上所述，Prkrip1作为一种剪接体C复合体的关键因子，在基因表达调控和结直肠癌的发生发展中发挥着重要作用。其表达水平与结直肠癌患者的不良预后相关，且与中性粒细胞胞外陷阱的形成相关。进一步研究Prkrip1的功能和调控机制，有望为结直肠癌的治疗和预后评估提供新的思路和策略。

参考文献：
1. Ozato, Yuki, Masuda, Takaaki, Kobayashi, Yuta, Mori, Masaki, Mimori, Koshi. . PRKRIP1, A Splicing Complex Factor, Is a Marker of Poor Prognosis in Colorectal Cancer. In Anticancer research, 42, 4701-4706. doi:10.21873/anticanres.15974. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36192001/
2. Zhang, Xiaofeng, Yan, Chuangye, Hang, Jing, Lei, Jianlin, Shi, Yigong. 2017. An Atomic Structure of the Human Spliceosome. In Cell, 169, 918-929.e14. doi:10.1016/j.cell.2017.04.033. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28502770/
3. Qian, Junwen, Duan, Jiyun, Cao, Dong. . Identification of a Novel 4-gene Prognostic Model Related to Neutrophil Extracellular Traps for Colorectal Cancer. In The Turkish journal of gastroenterology : the official journal of Turkish Society of Gastroenterology, 35, 849-858. doi:10.5152/tjg.2024.24131. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39549020/

资料下载

S-KO-11918_6J_66801_Prkrip1_Exon 2~5_A_strategy.pdf
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