Thumpd1-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Thumpd1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-06654

品系全称

C57BL/6JCya-Thumpd1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-233802-Thumpd1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Thumpd1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-06654) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
THUMP domain containing 1
基因别称
6330575P11Rik
染色体号
Chr 7 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_145585 | Ensembl: ENSMUST00000033236
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1~4
敲除长度
~5.7 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
THUMPD1(也称为Tan1或THUMP Domain-containing 1)是一种参与RNA乙酰化修饰的基因。它编码的蛋白质与NAT10(N-乙酰转移酶10)相互作用,帮助NAT10对tRNA进行N4-乙酰胞嘧啶(ac4C)的修饰。这种修饰在从古菌到真核生物的广泛生物体中普遍存在,是一种高度保守的RNA后转录化学修饰。ac4C修饰在翻译过程中有助于正确读取特定的核苷酸序列,稳定mRNA,并提高转录效率[1]。

THUMPD1在人类疾病中也扮演着重要角色。NAT10催化的ac4C修饰的mRNA已被证实与多种人类疾病有关,特别是癌症。NAT10和THUMPD1在tRNA上的ac4C修饰有助于稳定tRNA的结构[1]。THUMPD1的突变可能导致tRNA乙酰化缺失,进而引发一系列疾病,包括认知和神经发育障碍。研究发现,THUMPD1的双等位基因突变会导致一种综合征性神经发育障碍,患者表现为全球发育延迟、言语延迟、中重度智力缺陷、行为异常、面部畸形和眼科异常[2]。

此外,THUMPD1还与胃癌细胞行为和化疗耐药性相关。研究发现,miR-873-5p可以靶向THUMPD1,抑制胃癌细胞行为和化疗耐药性。THUMPD1作为miR-873-5p的下游分子,在胃癌细胞的细胞行为和化疗耐药性中发挥着重要作用[3]。

THUMPD1在多种癌症中的表达水平与其预后和免疫治疗效果相关。在泛癌分析中,THUMPD1在大多数癌症类型中高表达,其高表达与不同癌症的预后改善或恶化相关。此外,THUMPD1与免疫细胞浸润、肿瘤突变负荷(TMB)、微卫星不稳定性(MSI)、免疫检查点和新生抗原在许多癌症类型中显著相关。进一步研究发现,高THUMPD1表达的患者在临床治疗中显示出更多的优势和治疗反应。因此,THUMPD1可能作为一种新型预测因子,用于评估癌症预后和免疫治疗效果[4]。

综上所述,THUMPD1是一种参与RNA乙酰化修饰的重要基因,在人类疾病中扮演着重要角色。THUMPD1的突变可能导致tRNA乙酰化缺失,引发认知和神经发育障碍。THUMPD1还与胃癌细胞行为和化疗耐药性相关,可能作为胃癌治疗的潜在靶点。此外,THUMPD1在多种癌症中的表达水平与其预后和免疫治疗效果相关,可能作为一种新型预测因子,用于评估癌症预后和免疫治疗效果。THUMPD1的研究有助于深入理解RNA表观遗传修饰的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Luo, Jie, Cao, Jingsong, Chen, Cong, Xie, Haitao. 2023. Emerging role of RNA acetylation modification ac4C in diseases: Current advances and future challenges. In Biochemical pharmacology, 213, 115628. doi:10.1016/j.bcp.2023.115628. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37247745/
2. Broly, Martin, Polevoda, Bogdan V, Awayda, Kamel M, Cogné, Benjamin, O'Connell, Mitchell R. 2022. THUMPD1 bi-allelic variants cause loss of tRNA acetylation and a syndromic neurodevelopmental disorder. In American journal of human genetics, 109, 587-600. doi:10.1016/j.ajhg.2022.02.001. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35196516/
3. Chen, Qinggui, Lin, Li, Xiong, Boliang, Shi, Huibo, Wang, Zhenfa. . MiR-873-5p targets THUMPD1 to inhibit gastric cancer cell behavior and chemoresistance. In Journal of gastrointestinal oncology, 12, 2061-2072. doi:10.21037/jgo-21-641. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34790374/
4. Li, Kuangxun, Liu, Junzhe, Yang, Xinyu, Huang, Kai, Zhu, Xingen. . Pan-cancer analysis of N4-acetylcytidine adaptor THUMPD1 as a predictor for prognosis and immunotherapy. In Bioscience reports, 41, . doi:10.1042/BSR20212300. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34762107/