Polr2b-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Polr2b-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-06432

品系全称

C57BL/6JCya-Polr2bem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-231329-Polr2b-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Polr2b-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-06432) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide B
基因别称
Pol2rb,Rpb140,Rpb2
染色体号
Chr 5 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_153798 | Ensembl: ENSMUST00000031167
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~6
敲除长度
~8.0 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:2388280Mice homozygous for a knock-out allele show abnormal morula morphology and complete embryonic lethality before implantation. In vitro, embryos fail to hatch from the zona pellucida and die after 3 days in culture.
POLR2B是RNA聚合酶II的一个亚基,编码的是该聚合酶中第二大的亚基,即RNA聚合酶II亚基B(RPB2)。RNA聚合酶II是负责转录DNA模板生成前体信使RNA(pre-mRNA)的关键酶。POLR2B在基因表达调控中发挥着重要作用,其功能的异常与多种疾病的发病机制有关,包括癌症、神经退行性疾病等。

在胶质瘤的研究中,POLR2B基因的表达异常被发现与肿瘤的生长和恶性表型有关。一项研究发现,在胶质瘤干细胞中,YTHDC1的高表达促进了N6-甲基腺苷(m6A)修饰的circPOLR2B从细胞核转移到细胞质。这种转移导致核内circPOLR2B水平的降低,进而减少了circPOLR2B与其亲本基因POLR2B形成的R-loop结构。R-loop结构的减少解除了对POLR2B转录的抑制,通过替代性多腺苷酸化(APA)作用上调了PBX1的表达,从而促进了胶质瘤干细胞的恶性生物学行为。该研究还发现,敲低YTHDC1、POLR2B和PBX1的表达可以减少异种移植瘤体积,延长裸鼠的生存时间[1]。

另一项研究发现,POLR2B基因在胶质母细胞瘤(GBM)中存在基因组的改变和过度表达。通过shRNA敲低POLR2B的表达,可以抑制GBM细胞的生长。RNA测序分析揭示了RPB2调控的基因集,并突出了DNA损伤诱导转录4基因作为POLR2B基因的下游靶标。该研究提供了证据表明RPB2在GBM中作为生长调节因子,可能是治疗该疾病的潜在靶点[2]。

除了在胶质瘤中的作用,POLR2B在鸡的下丘脑中也作为内参基因被研究。该研究旨在评估10个候选内参基因在鸡下丘脑中的稳定性,用于定量实时PCR(qPCR)研究中的基因表达数据归一化。研究发现,TBP和POLR2B是最适合的内参基因,而B2M和RN18S是最不稳定的内参基因。尽管RN18S是鸡基因表达研究中常用的内参基因之一,但其适用性应在每次qPCR实验前进行评估[3]。

在年龄相关性黄斑变性(AMD)的研究中,RAD51基因的多态性与AMD的发病风险相关。然而,REST-C4ORF14-POLR2B-IGFBP7基因座的多态性并未发现与AMD相关[4]。另一项研究发现,TNFRSF10A基因的多态性与AMD的风险相关,而REST-C4orf14-POLR2B-IGFBP7基因座的多态性并未发现与AMD相关[7]。

在肺动脉高压(PAH)的研究中,TFRC被鉴定为PAH的潜在生物标志物。通过生物信息学和实验验证,发现TFRC在PAH患者的肺组织和血清中表达上调。TFRC的表达水平与PAH相关的生物学功能和通路丰富相关[5]。

在糖尿病肾病(DN)的研究中,基于机器学习的方法识别了与DN诊断相关的代谢相关基因(MRGs)特征和免疫浸润景观。研究发现,ADI1、PTGS2、DGKH和POLR2B是DN的诊断特征生物标志物,并与免疫细胞浸润景观密切相关[6]。

综上所述,POLR2B在多种疾病中发挥着重要作用,包括胶质瘤、GBM、AMD、PAH和DN。其在疾病发生和发展中的作用机制复杂,涉及基因表达调控、RNA修饰和染色质调控等多个层面。POLR2B的研究为深入理解疾病发生机制和寻找新的治疗靶点提供了重要的线索。

参考文献:
1. Lin, Hongda, Cui, Zheng, E, Tiange, Liu, Libo, Xue, Yixue. 2024. M6A-methylated circPOLR2B forms an R-loop and regulates the biological behavior of glioma stem cells through positive feedback loops. In Cell death & disease, 15, 554. doi:10.1038/s41419-024-06946-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39090090/
2. Li, Xiao-Lu, Xie, Yi, Chen, Yan-Ling, Li, Zhi-Heng, Pan, Jian. 2023. The RNA polymerase II subunit B (RPB2) functions as a growth regulator in human glioblastoma. In Biochemical and biophysical research communications, 674, 170-182. doi:10.1016/j.bbrc.2023.06.088. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37423037/
3. Simon, Á, Jávor, A, Bai, P, Oláh, J, Czeglédi, L. 2017. Reference gene selection for reverse transcription quantitative polymerase chain reaction in chicken hypothalamus under different feeding status. In Journal of animal physiology and animal nutrition, 102, 286-296. doi:10.1111/jpn.12690. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28294410/
4. Zhou, Jie, Wang, Dan, Zhang, Junjun, Zhang, Ming, Su, Zhiguang. 2013. RAD51 gene is associated with advanced age-related macular degeneration in Chinese population. In Clinical biochemistry, 46, 1689-93. doi:10.1016/j.clinbiochem.2013.07.002. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23868022/
5. Yang, Chuang, Liu, Yi-Hang, Zheng, Hai-Kuo. 2024. Identification of TFRC as a biomarker for pulmonary arterial hypertension based on bioinformatics and experimental verification. In Respiratory research, 25, 296. doi:10.1186/s12931-024-02928-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39097701/
6. Zhang, Huangjie, Hu, Jinguo, Zhu, Junfeng, Li, Qinglin, Fang, Luo. 2022. Machine learning-based metabolism-related genes signature and immune infiltration landscape in diabetic nephropathy. In Frontiers in endocrinology, 13, 1026938. doi:10.3389/fendo.2022.1026938. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36482994/
7. Sun, Yaoyao, Li, Shanshan, Li, Haiping, Huang, Lvzhen, Li, Xiaoxin. 2013. TNFRSF10A-LOC389641 rs13278062 but not REST-C4orf14-POLR2B-IGFBP7 rs1713985 was found associated with age-related macular degeneration in a Chinese population. In Investigative ophthalmology & visual science, 54, 8199-203. doi:10.1167/iovs.13-12867. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24235014/