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Tbp-KO 基因敲除小鼠

Tbp-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Tbp-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-04956

品系全称

C57BL/6JCya-Tbpem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-21374-Tbp-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明： Tbp-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-04956) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
KO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
TATA box binding protein
基因别称
GTF2D1，Gtf2d，SCA17，TFIID
染色体号
Chr 17 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_013684 | Ensembl: ENSMUST00000162505
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3
敲除长度
~0.4 kb
下载方案
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:101838Mice homozygous for one null allele exhibit embryonic lethality caused by hemorrhaging and clotting in the placenta and surviving embryos die prior to weaning. Mice homozygous for another null allele undergo growth arrest after hatching and apoptosis.
更多信息
基因Tbp（TATA box binding protein）是一种在真核生物中普遍存在的转录因子，它在基因转录的起始过程中发挥着至关重要的作用。Tbp的主要功能是结合到DNA上的TATA盒序列，这是许多基因启动子区域的一种共有序列。通过结合TATA盒，Tbp可以招募其他转录因子和RNA聚合酶，从而启动基因的转录。Tbp是转录前起始复合物（pre-initiation complex, PIC）的关键组成部分，其正确的定位对于基因转录的精确调控至关重要。

Tbp的功能不仅限于TATA盒的结合。它还可以与多种转录因子和其他蛋白质相互作用，形成一个复杂的转录调控网络。例如，Tbp可以与TBP-associated factors（TAFs）结合，形成TBP/TAFs复合物，进一步参与基因转录的调控。此外，Tbp还可以与SAGA（Spt-Ada-Gcn5-Acetyltransferase）等转录辅激活因子相互作用，共同调节基因的表达。

在基因表达研究中，选择合适的参考基因对于准确评估目标基因的表达水平至关重要。近年来，一些研究报道了Tbp作为参考基因的潜力。例如，一项研究评估了多种常规参考基因在结直肠癌细胞系、类器官和患者组织中对放疗反应的表达稳定性。研究发现，YWHAZ和TBP在放疗后的表达更为稳定，因此它们可能成为结直肠癌放疗实验中qPCR结果正常化的潜在候选基因[1]。

另一项研究发现，TBP与多种蛋白质相互作用，共同调节基因的表达。这些蛋白质包括TBP-associated factors（TAFs）和SAGA等转录辅激活因子。这些相互作用为TBP在转录调控中的作用提供了分子基础[2]。

此外，还有研究关注了TBP基因启动子的调控机制。例如，一项研究发现，TBP基因在Acanthamoeba castellanii中的转录受到TATA box binding protein promoter binding factor（TPBF）的调控。TPBF与TBP基因启动子区域的特定序列结合，刺激或抑制转录。这些发现为TBP基因的表达调控提供了新的见解[3]。

在植物中，TBP基因也受到调控。例如，一项研究发现，植物β-微管蛋白基因中的内含子长度多态性（ILP）可以用于植物基因分型。这种Tubulin-based polymorphism（TBP）方法通过PCR扩增植物β-微管蛋白基因中的两个保守的内含子，从而得到独特的基因组图谱[4]。

综上所述，基因Tbp在基因转录的起始过程中发挥着至关重要的作用。Tbp通过结合TATA盒序列，招募其他转录因子和RNA聚合酶，启动基因的转录。Tbp的功能不仅限于TATA盒的结合，它还可以与多种转录因子和蛋白质相互作用，形成一个复杂的转录调控网络。近年来，一些研究报道了Tbp作为参考基因的潜力，这为基因表达研究提供了新的思路。此外，Tbp基因的表达也受到多种因素的调控，包括TBP-associated factors（TAFs）、SAGA等转录辅激活因子以及TBP基因启动子区域的特定序列。这些研究有助于深入理解Tbp在基因转录和调控中的作用机制，为基因表达研究和相关疾病的诊断、治疗提供新的思路和策略。

参考文献：
1. Kim, Shin, Park, Jee Young, Lee, Hye Won, Byun, Sang Jun, Seo, Incheol. 2023. YWHAZ and TBP are potential reference gene candidates for qPCR analysis of response to radiation therapy in colorectal cancer. In Scientific reports, 13, 12902. doi:10.1038/s41598-023-39488-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37558778/
2. Lee, T I, Young, R A. . Regulation of gene expression by TBP-associated proteins. In Genes & development, 12, 1398-408. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9585500/
3. Chen, Li, Peng, Zhihua, Bateman, Erik. 2004. In vivo interactions of the Acanthamoeba TBP gene promoter. In Nucleic acids research, 32, 1251-60. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/14976219/
4. Braglia, Luca, Gavazzi, Floriana, Gianì, Silvia, Morello, Laura, Breviario, Diego. . Tubulin-Based Polymorphism (TBP) in Plant Genotyping. In Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 2638, 387-401. doi:10.1007/978-1-0716-3024-2_28. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36781658/

资料下载

S-KO-04956_6J_21374_Tbp_Exon 3_strategy.pdf
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