Rnps1-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Rnps1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-04109

品系全称

C57BL/6JCya-Rnps1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-19826-Rnps1-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Rnps1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-04109) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
RNA binding protein with serine rich domain 1
基因别称
-
染色体号
Chr 17 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001080127 | Ensembl: ENSMUST00000088512
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 4~6
敲除长度
~2.8 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
RNPS1,即RNA结合蛋白含丝氨酸丰富域1,是一种重要的RNA结合蛋白。它在RNA代谢的多个阶段发挥作用,包括剪接、转录后调控、翻译和mRNA的降解。RNPS1是凋亡和剪接相关蛋白复合体(ASAP)的组成部分,ASAP复合体还包含Acinus和SAP18等蛋白质。RNPS1在转录过程中参与防止R-loop的形成,而Acinus和SAP18则通过组蛋白脱乙酰化酶的帮助来抑制转录。在剪接过程中,RNPS1和Acinus作为剪接激活因子,而ASAP复合体在体外实验中表现出剪接抑制因子的特性。此外,ASAP复合体的各个成员与外显子连接复合体(EJC)相互作用,参与剪接和翻译过程。RNPS1通过参与mRNA的3'端加工和多聚体结合,提高了翻译效率。在无义介导的mRNA降解(NMD)过程中,RNPS1通过与EJC相互作用,帮助招募降解因子[2]。

RNPS1在多种癌症中发挥重要作用。在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中,RNPS1通过直接与锌指SWIM结构域蛋白6(ZSWIM6)相互作用,抑制NAT10蛋白的泛素化降解,从而提高NAT10的表达水平。NAT10的稳定上调促进了特定tRNA ac4C修饰的增加,进而增强了与HNSCC恶性进展相关的基因的翻译过程,如IL-6信号通路、IL-8信号通路和PTEN信号通路,最终影响HNSCC患者的生存和预后[1]。在宫颈癌细胞中,RNPS1的表达水平高于正常组织,RNPS1通过调节肿瘤相关基因的剪接,如Rac1b、RhoA、MDM4和WDR1,促进了宫颈癌细胞的增殖、集落形成、迁移和侵袭能力。此外,RNPS1的敲低增加了宫颈癌细胞对化疗药物多柔比星的敏感性。RNPS1还通过调节Rac1前mRNA的剪接,促进了其致癌剪接变体Rac1b的形成,而RhoA的表达则通过剪接过程被下调。因此,RNPS1的表达增加可能与宫颈癌的肿瘤进展相关,RNPS1介导的剪接过程有利于Rac1b/RhoA信号轴的激活,这可能有助于宫颈癌细胞的侵袭和转移[3]。

RNPS1还与长链非编码RNA(lncRNA)的相互作用有关。例如,RNPS1与lncRNA MALAT1相互作用,共同调节剪接和基因表达。MALAT1是一种高度保守的lncRNA,其过表达与癌症发展相关。RNPS1与MALAT1的M区域、E区域和全长结构相互作用,可能通过调节剪接来影响基因表达[4]。

此外,RNPS1还与细胞周期的调控有关。RNPS1与PNN和SAP18形成PSAP复合体,控制细胞周期中周期性的前mRNA剪接。例如,RNPS1在细胞周期中控制着AURKB基因内含子5的精确剪接,这对于有丝分裂和细胞分裂至关重要。RNPS1蛋白的表达水平与细胞周期中周期性的剪接事件相协调,而PNN蛋白的表达水平则没有这种周期性变化。RNPS1蛋白水平的周期性降低与泛素-蛋白酶体途径有关[5]。

综上所述,RNPS1是一种多功能RNA结合蛋白,在RNA代谢的多个阶段发挥作用,包括剪接、转录后调控、翻译和mRNA的降解。RNPS1在多种癌症中发挥重要作用,通过调节肿瘤相关基因的剪接和表达,影响肿瘤的发生和发展。RNPS1还与lncRNA的相互作用有关,共同调节剪接和基因表达。此外,RNPS1还与细胞周期的调控有关,控制细胞周期中周期性的前mRNA剪接。RNPS1的研究有助于深入理解RNA代谢的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略[1-10]。

参考文献:
1. Wang, Xiaochen, Ling, Rongsong, Peng, Yurong, Qiu, Weiqiong, Chen, Demeng. 2024. RNPS1 stabilizes NAT10 protein to facilitate translation in cancer via tRNA ac4C modification. In International journal of oral science, 16, 6. doi:10.1038/s41368-023-00276-7. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38246918/
2. Deka, Bhagyashree, Singh, Kusum Kumari. 2017. Multifaceted Regulation of Gene Expression by the Apoptosis- and Splicing-Associated Protein Complex and Its Components. In International journal of biological sciences, 13, 545-560. doi:10.7150/ijbs.18649. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28539829/
3. Deka, Bhagyashree, Chandra, Pratap, Yadav, Priyanka, Kunnumakkara, Ajaikumar B, Singh, Kusum Kumari. 2022. RNPS1 functions as an oncogenic splicing factor in cervical cancer cells. In IUBMB life, 75, 514-529. doi:10.1002/iub.2686. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36300671/
4. Mishra, Aanchal, Mishra, Seema. 2024. Metastasis-Associated Lung Adenocarcinoma Transcript 1 (MALAT1) lncRNA Conformational Dynamics in Complex with RNA-Binding Protein with Serine-Rich Domain 1 (RNPS1) in the Pan-cancer Splicing and Gene Expression. In ACS omega, 9, 42212-42226. doi:10.1021/acsomega.4c04467. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39431102/
5. Fukumura, Kazuhiro, Masuda, Akio, Takeda, Jun-Ichi, Ohno, Kinji, Mayeda, Akila. 2024. RNPS1 in PSAP complex controls periodic pre-mRNA splicing over the cell cycle. In iScience, 27, 111400. doi:10.1016/j.isci.2024.111400. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39687031/