Nctc1-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Nctc1-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-18326

品系全称

C57BL/6JCya-Nctc1em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-330677-Nctc1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Nctc1-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-18326) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
non-coding transcript 1
基因别称
9530074L01,Rhit1
染色体号
Chr 7 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NR_002452 | Ensembl: ENSMUST00000132167
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 1~3
敲除长度
~18.7 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Nctc1是一种长链非编码RNA(lncRNA),它位于小鼠7号染色体的Igf2-H19-Nctc1位点,与Igf2和H19基因相邻。Nctc1的表达受到父系印记的调控,仅从父系染色体上表达[3]。Nctc1的转录对于Igf2/H19增强子的功能至关重要,因为Nctc1的转录与增强子的活性相关联[2]。Nctc1的印记表达是由父系染色体上的增强子元件调控的,这些增强子元件与母系染色体上的H19基因启动子相互作用[4]。

在Igf2/H19/Nctc1印记位点中,Nctc1的表达受到一个共享的肌肉特异性增强子的调控。这个增强子同时与Igf2和H19的父系启动子相互作用,导致Nctc1的父系偏倚表达[3]。此外,Nctc1与Igf2和H19的启动子之间存在物理相互作用,这些相互作用对于Nctc1的印记表达和增强子功能至关重要[4]。Nctc1的印记表达还受到其自身的启动子元件的调控,这些元件与Igf2和H19的启动子相互作用,形成了一个复杂的调控网络[2]。

Nctc1的表达还受到H19长链非编码RNA的调控。H19能够结合并抑制S-腺苷高半胱氨酸水解酶(SAHH)的活性,进而影响DNA甲基化水平。研究发现,H19的敲低导致SAHH的激活,进而导致DNMT3B介导的Nctc1基因的甲基化水平升高[1]。基因组范围的甲基化分析揭示了H19对SAHH的调控导致了许多基因位点的甲基化水平发生变化,这表明H19能够通过广泛的表观遗传调控影响基因表达[1]。

综上所述,Nctc1是一种父系印记的长链非编码RNA,其表达受到父系染色体上的增强子和启动子元件的调控。Nctc1的表达对于Igf2/H19增强子的功能至关重要,并且受到H19长链非编码RNA的调控。Nctc1的印记表达和调控机制的研究有助于深入理解印记基因的表达调控和表观遗传调控的机制,对于研究发育和疾病的发生机制具有重要意义。

参考文献:
1. Zhou, Jichun, Yang, Lihua, Zhong, Tianyu, Taylor, Hugh S, Huang, Yingqun. 2015. H19 lncRNA alters DNA methylation genome wide by regulating S-adenosylhomocysteine hydrolase. In Nature communications, 6, 10221. doi:10.1038/ncomms10221. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26687445/
2. Eun, Bokkee, Sampley, Megan L, Van Winkle, Matthew T, Kachman, Marika M, Pfeifer, Karl. 2013. The Igf2/H19 muscle enhancer is an active transcriptional complex. In Nucleic acids research, 41, 8126-34. doi:10.1093/nar/gkt597. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23842673/
3. Kim, Jae-Young, Youn, Hwa Young, Pfeifer, Karl, Eun, Bokkee. 2019. Paternal bias expression of Igf2as is enhancer-dependent on the imprinting cluster of Igf2, H19 and Nctc1 in muscle cells. In Animal cells and systems, 23, 288-293. doi:10.1080/19768354.2019.1612780. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31489250/
4. Eun, Bokkee, Sampley, Megan L, Good, Austin L, Gebert, Claudia M, Pfeifer, Karl. 2012. Promoter cross-talk via a shared enhancer explains paternally biased expression of Nctc1 at the Igf2/H19/Nctc1 imprinted locus. In Nucleic acids research, 41, 817-26. doi:10.1093/nar/gks1182. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23221643/