Gar1-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Gar1-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-14074

品系全称

C57BL/6JCya-Gar1em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-68147-Gar1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Gar1-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-14074) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
GAR1 ribonucleoprotein
基因别称
C430047J18Rik,Nola1
染色体号
Chr 3 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_026578 | Ensembl: ENSMUST00000029643
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 3~4
敲除长度
~1.8 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
GAR1,也称为GAR1 ribonucleoprotein,是一种重要的核仁蛋白。它主要与H/ACA小核仁核糖核蛋白颗粒(snoRNPs)相互作用,参与调控rRNA的修饰和加工过程。GAR1在多种生物过程中发挥重要作用,包括细胞生长、发育、代谢和疾病发生。

在哺乳动物细胞中,GAR1主要与H/ACA snoRNPs相互作用,参与rRNA的修饰和加工过程。H/ACA snoRNPs是一类小核仁核糖核蛋白颗粒,它们通过识别rRNA上的特定序列,引导rRNA的修饰和加工过程。GAR1与H/ACA snoRNPs的结合,对于维持细胞生长和发育至关重要。例如,在慢性淋巴细胞白血病(CLL)中,GAR1的表达水平显著降低,与不良预后相关[3]。

在酵母细胞中,GAR1是一种非核糖体蛋白,定位于酵母核仁,对于细胞生长至关重要。GAR1与一部分snoRNAs相互作用,包括snR10和snR30,参与rRNA的加工过程。例如,在Schizosaccharomyces pombe酵母中,SpGAR1基因编码的蛋白与Saccharomyces cerevisiae中的GAR1蛋白具有功能上的相似性,均定位于核仁,参与rRNA的加工过程[1]。

在古菌细胞中,GAR1与Cbf5蛋白相互作用,参与rRNA的修饰过程。Cbf5蛋白是一种RNA:pseudouridine-synthase (PUS),与L7Ae、Nop10和Gar1蛋白以及H/ACA sRNAs形成复合物,确保rRNA中尿苷转化为假尿苷(Ψs)。例如,在Thermococcus kodakarensis古菌中,Gar1蛋白对于Cbf5蛋白的RNA引导和RNA非依赖性rRNA:Ψ-synthase活性至关重要[2]。

GAR1的生物学功能与其与snoRNPs的相互作用密切相关。snoRNPs是一类小核仁核糖核蛋白颗粒,它们通过识别rRNA上的特定序列,引导rRNA的修饰和加工过程。GAR1与snoRNPs的结合,对于维持细胞生长和发育至关重要。例如,在慢性淋巴细胞白血病(CLL)中,GAR1的表达水平显著降低,与不良预后相关[3]。此外,GAR1还与脊髓性肌萎缩症(SMA)相关蛋白SMN相互作用,参与snRNP的组装和代谢过程[4][5]。

综上所述,GAR1是一种重要的核仁蛋白,主要与H/ACA snoRNPs相互作用,参与调控rRNA的修饰和加工过程。GAR1在多种生物过程中发挥重要作用,包括细胞生长、发育、代谢和疾病发生。GAR1的研究有助于深入理解rRNA修饰的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Girard, J P, Caizergues-Ferrer, M, Lapeyre, B. . The SpGAR1 gene of Schizosaccharomyces pombe encodes the functional homologue of the snoRNP protein GAR1 of Saccharomyces cerevisiae. In Nucleic acids research, 21, 2149-55. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8502556/
2. Fujikane, Ryosuke, Behm-Ansmant, Isabelle, Tillault, Anne-Sophie, Motorin, Yuri, Charpentier, Bruno. 2018. Contribution of protein Gar1 to the RNA-guided and RNA-independent rRNA:Ψ-synthase activities of the archaeal Cbf5 protein. In Scientific reports, 8, 13815. doi:10.1038/s41598-018-32164-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30218085/
3. Dos Santos, Patricia Carolina, Panero, Julieta, Stanganelli, Carmen, Bezares, Raimundo, Slavutsky, Irma. 2017. Dysregulation of H/ACA ribonucleoprotein components in chronic lymphocytic leukemia. In PloS one, 12, e0179883. doi:10.1371/journal.pone.0179883. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28666010/
4. Pellizzoni, L, Baccon, J, Charroux, B, Dreyfuss, G. . The survival of motor neurons (SMN) protein interacts with the snoRNP proteins fibrillarin and GAR1. In Current biology : CB, 11, 1079-88. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11509230/
5. Whitehead, Sarah E, Jones, Kevin W, Zhang, Xing, Terns, Rebecca M, Terns, Michael P. 2002. Determinants of the interaction of the spinal muscular atrophy disease protein SMN with the dimethylarginine-modified box H/ACA small nucleolar ribonucleoprotein GAR1. In The Journal of biological chemistry, 277, 48087-93. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12244096/