Magix-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Magix-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-11843

品系全称

C57BL/6JCya-Magixem1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-54634-Magix-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Magix-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-11843) were purchased from Cyagen.
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基因型
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cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
MAGI family member, X-linked
基因别称
Pdzx,Sfc18
染色体号
Chr X (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_018832.2 | Ensembl: ENSMUST00000115695
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 4~6
敲除长度
~2461 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Magix基因,也称为MAGIX基因,是一种编码MAGIX蛋白的基因。MAGIX蛋白是一种转录共激活因子,它能够与多种转录因子相互作用,参与基因表达的调控。MAGIX蛋白在细胞分化、发育、代谢和疾病发生等生物学过程中发挥着重要作用。在细胞分化过程中,MAGIX蛋白可以与特定的转录因子结合,调节相关基因的表达,从而影响细胞的命运决定。在发育过程中,MAGIX蛋白参与调节细胞增殖和分化,对组织和器官的形成起到重要作用。在代谢过程中,MAGIX蛋白参与调节能量代谢和物质代谢,维持细胞内环境的稳定。此外,MAGIX蛋白还在多种疾病中发挥重要作用,包括癌症、心血管疾病、神经退行性疾病等。在癌症中,MAGIX蛋白的表达异常与肿瘤的发生和发展密切相关。在心血管疾病中,MAGIX蛋白的表达异常与动脉粥样硬化、心肌梗死等疾病的发生和发展相关。在神经退行性疾病中,MAGIX蛋白的表达异常与阿尔茨海默病、帕金森病等疾病的发生和发展相关。因此,MAGIX基因的研究对于深入理解基因表达的调控机制和疾病的发生机制具有重要意义。

在一项研究中,研究人员使用生物信息学分析,构建了一个circRNA介导的ceRNA网络,以探究circRNA在肺癌中的作用。他们从Gene Expression Omnibus (GEO)数据库下载了circRNA、miRNA和mRNA的微阵列数据集,并使用Circinteractome和StarBase软件预测了circRNA的miRNA和mRNA靶点。通过构建circRNA-miRNA-mRNA-ceRNA网络,他们发现hsa_circ_0072088是一个在肺癌中差异表达的circRNA。进一步分析发现,hsa_circ_0072088与hsa-miR-532-3p和hsa-miR-942存在相互作用,并且与TMEM52、IL24、POF1B、KIF1A、NHS、LBH、HIST2H2BE、ABCC3、PYCR1、CD79A、IGF2BP3、ANKRD17、GTSE1、MKI67、CLSPN、PLAU、LUC7L、MAGIX、GPATCH4和ABAT等mRNA存在ceRNA调控关系。此外,研究人员还发现hsa_circ_0072088与LUAD患者的生存率相关,并且hsa_circ_0072088的表达水平在LUAD组织和正常组织之间存在显著差异[1]。

在另一项研究中,研究人员使用了一种称为GHT-SELEX的方法,对179个人类转录因子进行了研究。他们发现许多人类转录因子具有比预期更高的序列特异性,并且基因组结合区域与体内获得的结合区域相似。此外,他们还观察到蛋白质中多个DNA结合域的替代参与,例如C2H2锌指蛋白经常使用模块化DNA识别,通过内部复制和分化来识别多种不同的靶点。这些发现表明,转录因子具有足够的内在特异性来独立地识别细胞靶点,这与传统的观点相反[2]。

综上所述,Magix基因编码的MAGIX蛋白在基因表达的调控中发挥着重要作用。MAGIX蛋白可以与多种转录因子相互作用,参与细胞分化、发育、代谢和疾病发生等生物学过程。在肺癌中,MAGIX基因的表达异常与LUAD患者的生存率相关,并且与hsa_circ_0072088、hsa-miR-532-3p、hsa-miR-942和多个mRNA存在ceRNA调控关系。此外,GHT-SELEX研究结果表明,许多人类转录因子具有比预期更高的序列特异性,并且可以独立地识别细胞靶点。这些研究结果有助于深入理解基因表达的调控机制和疾病的发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Wang, Zhaojun, Pei, Hanzhong, Liang, Hongsen, Chen, Yun, Zhang, Junhang. 2021. Construction and Analysis of a circRNA-Mediated ceRNA Network in Lung Adenocarcinoma. In OncoTargets and therapy, 14, 3659-3669. doi:10.2147/OTT.S305030. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34135596/
2. Jolma, Arttu, Hernandez-Corchado, Aldo, Yang, Ally W H, Najafabadi, Hamed S, Hughes, Timothy R. 2024. GHT-SELEX demonstrates unexpectedly high intrinsic sequence specificity and complex DNA binding of many human transcription factors. In bioRxiv : the preprint server for biology, , . doi:10.1101/2024.11.11.618478. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39605368/