Polr3e-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Polr3e-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-09791

品系全称

C57BL/6JCya-Polr3eem1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-26939-Polr3e-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Polr3e-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-09791) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide E
基因别称
RPC5,Sin
染色体号
Chr 7 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_025298.4 | Ensembl: ENSMUST00000033173
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 4~6
敲除长度
~2067 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Polr3e基因编码RNA聚合酶III(Pol III)的一个亚基,Pol III是一种在真核细胞中负责转录小非编码RNA(如5S核糖体RNA、转移RNA和U6小核RNA)的酶。Pol III的转录对于RNA成熟和翻译至关重要,因为这些非编码RNA在蛋白质合成过程中发挥关键作用。Pol III的转录活动受到多种调节机制的精细控制,包括转录起始、延伸和终止的调控。

近年来,研究发现Polr3e基因的突变与多种遗传疾病相关,包括易患带状疱疹病毒(VZV)诱导的脑炎和肺炎,以及一系列神经退行性疾病,如髓鞘发育不良性脑白质营养不良。Polr3e基因的突变导致Pol III的功能受损,进而影响小非编码RNA的合成,可能影响细胞的代谢、免疫反应和发育过程。

研究发现,Polr3e基因的表达受到转录干扰的调控。在Polr3e基因的第一个内含子中,存在一个与Polr3e基因反义方向重叠的哺乳动物散在重复序列(MIR)。MIR由Pol III转录,其转录过程可以干扰Polr3e基因的表达。通过CRISPR/Cas9介导的MIR删除实验和染色质免疫沉淀实验,研究者发现MIR可以通过转录干扰机制影响Polr3e基因的表达[1]。

此外,Polr3e基因的表达还与先天免疫反应相关。Pol III在先天免疫系统中具有非典型的病毒DNA感受功能,它可以将病毒基因组转录成RNA,进而诱导I型干扰素(IFNs)的产生。研究发现,在患有反复和系统性病毒感染以及朗格汉斯细胞组织细胞增多症的患者中,POLR3E基因存在一个罕见的纯合突变(D40H)。该突变导致Pol III起始复合物的组装缺陷,从而影响Pol III的功能。患者细胞表现出I型IFN诱导受损和人类巨细胞病毒(HCMV)感染易感性增加[2]。

Polr3e基因的表达还与非编码RNA的调控有关。研究发现,Pol III可以转录一个与Polr3e基因反义方向重叠的非编码RNA,称为POLAR(POLR3E反义RNA)。POLAR具有极短的半衰期,定位于细胞核内的斑点结构(paraspeckles),并与其他斑点相关蛋白相互作用[4]。

综上所述,Polr3e基因编码RNA聚合酶III的一个亚基,Pol III负责转录小非编码RNA,对RNA成熟和翻译至关重要。Polr3e基因的表达受到多种调控机制的控制,包括转录干扰和非编码RNA的调控。Polr3e基因的突变与多种遗传疾病相关,包括易患VZV诱导的脑炎和肺炎,以及一系列神经退行性疾病。Polr3e基因的表达还与先天免疫反应和非编码RNA的调控有关。深入研究Polr3e基因的功能和调控机制有助于理解Pol III相关疾病的发病机制,并为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略[3]。

参考文献:
1. Yeganeh, Meghdad, Praz, Viviane, Cousin, Pascal, Hernandez, Nouria. 2017. Transcriptional interference by RNA polymerase III affects expression of the Polr3e gene. In Genes & development, 31, 413-421. doi:10.1101/gad.293324.116. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28289142/
2. Ramanathan, Aravind, Weintraub, Michael, Orlovetskie, Natalie, Elpeleg, Orly, Jarrous, Nayef. 2020. A mutation in POLR3E impairs antiviral immune response and RNA polymerase III. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 117, 22113-22121. doi:10.1073/pnas.2009947117. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32843346/
3. Lata, Elisabeth, Choquet, Karine, Sagliocco, Francis, Bernard, Geneviève, Teichmann, Martin. 2021. RNA Polymerase III Subunit Mutations in Genetic Diseases. In Frontiers in molecular biosciences, 8, 696438. doi:10.3389/fmolb.2021.696438. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34395528/
4. Zorn, Peter, Misiak, Danny, Gekle, Michael, Köhn, Marcel. 2021. Identification and initial characterization of POLIII-driven transcripts by msRNA-sequencing. In RNA biology, 18, 1807-1817. doi:10.1080/15476286.2020.1871216. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33404286/